免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,Co-IP)的優(yōu)點主要包括:高度特異性:免疫共沉淀利用高親和力的抗體與目標蛋白結合,能夠高度特異性地識別目標蛋白質(zhì),從而減少假陽性和假陰性的誤差,提高實驗結果的準確性??煽匦詮姡好庖吖渤恋韺嶒灥姆磻獥l件相對穩(wěn)定,實驗長度、溫度、蛋白濃度、抗體濃度等可被有效控制,這樣可以有效地減少誤差和變異性??捎糜谘芯康鞍紫嗷プ饔茫好庖吖渤恋聿粌H可以檢測單個蛋白質(zhì),還可以研究蛋白質(zhì)之間的相互作用,從而揭示蛋白質(zhì)的組裝和功能。這對于理解細胞內(nèi)的信號轉(zhuǎn)導、代謝途徑等復雜生物過程具有重要意義。天然狀態(tài):通過免疫共沉淀得到的蛋白質(zhì)相互作用是在自然狀態(tài)下進行的,避免了人為影響,可以分離得到天然狀態(tài)下相互作用的蛋白復合物。這對于理解蛋白質(zhì)在細胞內(nèi)的真實功能和相互作用模式具有重要意義。可逆性:免疫共沉淀實驗是可逆的,在沉淀后的蛋白質(zhì)可以被再次溶解和分離進行下一步操作或其他科學研究。操作簡便:免疫共沉淀的實驗流程相對簡便,不需要事先制備大規(guī)模蛋白表達文庫,使得這種方法在實驗室中易于實施。Co-IP和ChIP實驗對象有什么區(qū)別。上海免疫沉淀CoIP-Mass檢測
CoIP-Mass和CoIP-WB檢測要點:
互作蛋白篩選和驗證:數(shù)據(jù)分析以非標定量信號強度(LFQintensity和FC>10)作為強陽篩選,以文獻查閱,功能匹配,批量CoIP-WB驗證,提高驗證成功率。理想CoIP-MS結果的蛋白定量都到超過1000種蛋白。其中絕大部分蛋白為非特異結合或背景蛋白。以目的蛋白的富集信號強度和差異倍數(shù)作為參考(相對強信號和差異),分析實驗組中明顯定量較高且差異較大的蛋白,作為重要候選蛋白。同時對重要候選蛋白進行STRING互作分析,文獻分析,目的蛋白功能匹配分析,選擇Top的4-5個蛋白進行CoIP-WB驗證,提高CoIP-WB成功率。 山西CoIP-MassCo-IP實驗要點:樣品新鮮、抗體特異、偶聯(lián)充分、洗滌徹底,確保結果準確可靠!
在CoIP(免疫共沉淀)實驗中,對照組的設計對實驗結果尤為重要,陽性對照組設計建議如下:1. 已知相互作用蛋白對照組:如果可能的話,使用已知與誘餌蛋白相互作用的蛋白作為陽性對照。這可以驗證實驗條件的可行性,以及抗體和實驗方法的可靠性。2. 設置過量誘餌蛋白對照組:通過加入過量的誘餌蛋白,可以驗證靶蛋白與誘餌蛋白之間的相互作用是否具有飽和性。如果加入過量誘餌蛋白后,靶蛋白的結合減少或消失,則表明相互作用具有飽和性。
在CoIP(免疫共沉淀)實驗中,技術重復和生物重復設計建議如下:進行多次技術重復(在同一實驗條件下使用不同的樣品或樣品批次)和生物重復(使用來自不同生物或不同實驗條件的樣品),以評估結果的穩(wěn)定性和可靠性。在設置對照組時,還需要注意以下幾點:對照組的設置應遵循科學原理,并充分考慮實驗的具體需求和目標。確保對照組和實驗組在實驗條件和操作步驟上保持一致,以便進行準確的比較。在分析實驗結果時,應綜合考慮對照組和實驗組的數(shù)據(jù),以得出更準確的結論??傊?,在CoIP實驗中,通過精心設計和執(zhí)行對照組實驗,可以提高實驗的準確性和可靠性,從而更準確地評估目標蛋白與誘餌蛋白之間的相互作用。CoIP實驗需多次重復,科學設對照組,確保結果準確可靠!
CoIP-Mass和CoIP-WB檢測要點:
試驗設計:盡量進行試驗組別設計和進行生物學重復檢測,提高后續(xù)驗證的陽性率。常規(guī)過表達單組(AbIPvsIgGIP);動態(tài)互作組學(實驗組vs對照組vsIg組)。根據(jù)目的設計適當?shù)纳飳W重復。如果后續(xù)以CoIP-Mass數(shù)據(jù)進行互作組標準分析,則需要3-4組生物學重復;如果后續(xù)以尋找關鍵互作蛋白,進行機制深入研究,則建議1-2次生物學重復。經(jīng)驗顯示單次重復假陽性率90%。
蛋白表達和細胞量:細胞用量要求大(2-10e7細胞量),建議不少于5e7(金標準:320g離心細胞量50μl,保障項目用量)。低表達蛋白,建議使用過表達組進行檢測。蛋白表達可根據(jù)WB結果或初步根據(jù)數(shù)據(jù)庫判定(ProteomicsDB;HumanProteinAtlas)。 Co-IP和ChIP基本原理方面的區(qū)別有什么。四川互作機制CoIP
Co-IP技術揭示蛋白互作,助力藥物研發(fā)與疾病機制探索!上海免疫沉淀CoIP-Mass檢測
免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,Co-IP)是一種經(jīng)典的生物學技術,主要用于研究蛋白質(zhì)之間的相互作用。它以其獨特的優(yōu)勢在蛋白質(zhì)組學、生物化學和細胞生物學等領域中得到了大范圍應用。Co-IP的主要優(yōu)點包括。直接性:Co-IP能夠直接檢測蛋白質(zhì)之間的相互作用,從而提供關于蛋白質(zhì)功能和調(diào)控機制的直接證據(jù)。特異性:通過使用特異性抗體,Co-IP能夠精確地捕獲目標蛋白及其相互作用伙伴,減少非特異性干擾。靈敏度:Co-IP能夠檢測到低豐度的蛋白質(zhì)相互作用,這對于研究微弱或瞬時的蛋白互作具有重要意義。適用性廣:該技術適用于多種樣本類型,包括細胞裂解液、組織提取物和純化后的蛋白質(zhì)復合物。兼容性強:Co-IP技術可以與其他技術相結合,如質(zhì)譜分析,從而提供更詳盡的互作網(wǎng)絡信息。綜上所述,Co-IP技術的優(yōu)點在于其直接性、特異性、靈敏度、大范圍的適用性和與其他技術的兼容性,這些優(yōu)點使其成為研究蛋白質(zhì)相互作用的有力工具。上海免疫沉淀CoIP-Mass檢測