免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation，Co-IP）的局限性主要包括：可能檢測(cè)不到低親和力和瞬間的相互作用：低親和力和瞬間的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)之間的相互作用可能檢測(cè)不到，這可能導(dǎo)致某些重要的相互作用被遺漏。不能確保直接相互作用：免疫共沉淀不能保證沉淀的蛋白復(fù)合物是由直接相互作用的兩種蛋白組成。兩種蛋白質(zhì)的結(jié)合可能不是直接結(jié)合，而可能有第三者在中間起橋梁作用。靈敏度限制：免疫共沉淀的靈敏度不如某些其他技術(shù)，如親和色譜，這可能影響到對(duì)低豐度蛋白或微弱相互作用的研究。樣本純度要求高：如果將蛋白復(fù)合物直接進(jìn)行質(zhì)譜分析，需要得到較高純度和濃度的蛋白復(fù)合物樣品，這并非易事，并且成本較高。對(duì)抗體要求高：用于免疫共沉淀的抗體不是總是與操作相合適，與Western blotting或者 ELISA相比容易出現(xiàn)假陽(yáng)性反應(yīng)。免疫共沉淀法可信度高，可發(fā)現(xiàn)新蛋白搭檔，但存局限，需結(jié)合其他方法驗(yàn)證。湖北免疫共沉淀CoIP

免疫共沉淀CoIP實(shí)驗(yàn)，細(xì)胞的收集及裂解方法如下：

收集2E7個(gè)細(xì)胞樣品，加入PBS洗滌細(xì)胞，離心后棄上清收集細(xì)胞沉淀。

準(zhǔn)備500μl預(yù)冷的CellLysisBuffer,分別加入5μlProteaseInhibitor、5μlPMSF，混勻后加進(jìn)細(xì)胞沉淀中吹打均勻，冰上孵育30min，期間渦旋混勻幾次。

4℃,12000rpm離心10min，取上清，進(jìn)行蛋白濃度測(cè)定及后續(xù)實(shí)驗(yàn)。廣州基云生物，在IP互作組檢測(cè)和關(guān)鍵機(jī)制分子篩選驗(yàn)證領(lǐng)域，具有豐富的經(jīng)驗(yàn)，助力您的互作機(jī)制研究，歡迎垂詢(xún)合作。 北京互作機(jī)制CoIP-MS檢測(cè)蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)分子互作實(shí)驗(yàn)方法介紹。

Co-IP（免疫共沉淀）實(shí)驗(yàn)操作的要點(diǎn)。1.細(xì)胞裂解：確保采用溫和的裂解條件，以保持細(xì)胞內(nèi)存在的蛋白間相互作用。使用非變性裂解液進(jìn)行裂解和洗滌。2.抗體固定：選擇經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的抗體，以減少假陽(yáng)性結(jié)果。注意抗體與緩沖液的比例，避免抗體稀釋過(guò)度或過(guò)多。3.抗體結(jié)合：將抗體與樣品混合，確?？贵w與目標(biāo)蛋白充分結(jié)合。4.磁珠或瓊脂糖添加：將抗體固定的磁珠或瓊脂糖加入混合物中，使其與抗體-蛋白復(fù)合物結(jié)合。5.沉淀：通過(guò)磁珠或瓊脂糖的沉降，分離出蛋白復(fù)合物。6.洗脫：使用洗脫緩沖液將蛋白質(zhì)復(fù)合物從磁珠或瓊脂糖上洗脫下來(lái)。7.增加洗脫之前的洗滌次數(shù)或在免疫共沉淀緩沖液中加入Triton X-100，以降低非特異性結(jié)合。遵循這些操作要點(diǎn)，可以確保Co-IP實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和可靠性，從而得到準(zhǔn)確的蛋白質(zhì)相互作用結(jié)果。

CoIP-Mass和CoIP-WB檢測(cè)要點(diǎn)：

互作蛋白篩選和驗(yàn)證：數(shù)據(jù)分析以非標(biāo)定量信號(hào)強(qiáng)度（LFQintensity和FC>10）作為強(qiáng)陽(yáng)篩選，以文獻(xiàn)查閱，功能匹配，批量CoIP-WB驗(yàn)證，提高驗(yàn)證成功率。理想CoIP-MS結(jié)果的蛋白定量都到超過(guò)1000種蛋白。其中絕大部分蛋白為非特異結(jié)合或背景蛋白。以目的蛋白的富集信號(hào)強(qiáng)度和差異倍數(shù)作為參考（相對(duì)強(qiáng)信號(hào)和差異），分析實(shí)驗(yàn)組中明顯定量較高且差異較大的蛋白，作為重要候選蛋白。同時(shí)對(duì)重要候選蛋白進(jìn)行STRING互作分析，文獻(xiàn)分析，目的蛋白功能匹配分析，選擇Top的4-5個(gè)蛋白進(jìn)行CoIP-WB驗(yàn)證，提高CoIP-WB成功率。 Co-IP外源檢測(cè)引入外源蛋白驗(yàn)證互作，敏感度高但需嚴(yán)控條件，結(jié)合內(nèi)源檢測(cè)更準(zhǔn)確！

Co-IP實(shí)驗(yàn)原理主要基于抗原-抗體特異性結(jié)合以及蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。具體來(lái)說(shuō)，當(dāng)細(xì)胞在非變性條件下被裂解時(shí)，細(xì)胞內(nèi)存在的許多蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)間的相互作用會(huì)被保留下來(lái)。實(shí)驗(yàn)中，利用靶蛋白的特異性抗體與靶蛋白結(jié)合形成復(fù)合物，然后通過(guò)免疫反應(yīng)將復(fù)合物與固定在固相支持物（如瓊脂糖珠或磁珠）上的親和劑（如Protein A/G）結(jié)合。經(jīng)過(guò)一系列的洗滌步驟后，可以去除非特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)，將目標(biāo)蛋白質(zhì)及其相互作用的蛋白質(zhì)富集在固相支持物上。通過(guò)電泳、質(zhì)譜分析等技術(shù)對(duì)富集的蛋白質(zhì)進(jìn)行分析，從而鑒定和定量相互作用的蛋白質(zhì)。Co-IP（免疫共沉淀）技術(shù)應(yīng)用場(chǎng)景。天津互作機(jī)制CoIP-MS

Co-IP技術(shù)廣泛應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)、藥物研發(fā)、蛋白質(zhì)組學(xué)等領(lǐng)域，助力科研人員探索生命奧秘！湖北免疫共沉淀CoIP

免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation）是以抗體和抗原之間的專(zhuān)一性作用為基礎(chǔ)的用于研究蛋白質(zhì)相互作用的經(jīng)典方法。是確定兩種蛋白質(zhì)在完整細(xì)胞內(nèi)生理性相互作用的有效方法。當(dāng)細(xì)胞在非變性條件下被裂解時(shí)，完整細(xì)胞內(nèi)存在的許多蛋白質(zhì)－蛋白質(zhì)間的相互作用被保留了下來(lái)。當(dāng)用預(yù)先固化在agarose beads上的蛋白質(zhì)A的抗體免疫沉淀A蛋白，那么與A蛋白在體內(nèi)結(jié)合的蛋白質(zhì)B也能一起沉淀下來(lái)。再通過(guò)蛋白變性分離，對(duì)B蛋白進(jìn)行檢測(cè)，進(jìn)而證明兩者間的相互作用。這種方法得到的目的蛋白是在細(xì)胞內(nèi)與興趣蛋白天然結(jié)合的，符合體內(nèi)實(shí)際情況，得到的結(jié)果可信度高。這種方法常用于測(cè)定兩種目標(biāo)蛋白質(zhì)是否在體內(nèi)結(jié)合；也可用于確定一種特定蛋白質(zhì)的新的作用搭檔。湖北免疫共沉淀CoIP