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南通組織熒光定量PCR研究方案

來源: 發(fā)布時間:2023-04-01

引物的設(shè)計(jì)注意事項(xiàng):1,引物設(shè)計(jì)要跨內(nèi)含子,不能在一個外顯子上(我們的實(shí)驗(yàn)是以cDNA為模板來擴(kuò)增的,如果有DNA污染的話,因?yàn)镈NA上含有分子量很大的內(nèi)含子,不可能完成擴(kuò)增。這對我們消除整個實(shí)驗(yàn)的誤差起很大的作用)。2,引物設(shè)計(jì)的時候要盡可能設(shè)計(jì)在同一退火溫度,方便于以后同時擴(kuò)增很多不同的基因片段。但是如果相差比較大,就得分開做,浪費(fèi)模板,浪費(fèi)管家基因,所以每個實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)引物的時候要盡可能一致,這樣就不用每次查退火溫度,且對整個實(shí)驗(yàn)有利。許多疾病的未知病因的測序正在通過聚合酶鏈反應(yīng)得到解決。南通組織熒光定量PCR研究方案

南通組織熒光定量PCR研究方案,Real-timePCR技術(shù)服務(wù)

Real-time PCR雙熒光標(biāo)記探針設(shè)計(jì)原則:具體的其他要求可以具體聯(lián)系設(shè)計(jì)公司,拿到合成好的引物,需要先確認(rèn)引物的性能??梢杂眠@對引物先擴(kuò)增梯度稀釋后的標(biāo)準(zhǔn)品(標(biāo)準(zhǔn)品介紹見后續(xù)內(nèi)容)。由不同梯度標(biāo)準(zhǔn)品的加量和其對應(yīng)的Ct值,描繪出一條標(biāo)準(zhǔn)曲線。這里要注意根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線得到的參數(shù)是非常重要的。引物性能確認(rèn):1.決定系數(shù)R2大于0.98,越接近于1,結(jié)果越可靠。2.擴(kuò)增效率一般要求在0.8-1.2,越接近于1,越好。3.檢測的靈敏度,必須確認(rèn),通常要求35個循環(huán)以內(nèi),一般可以得到比較好的定量結(jié)果,30個循環(huán)以內(nèi),沒有非特異性擴(kuò)增產(chǎn)生。4.NTC是必須要確認(rèn)的,通常要求30個循環(huán)內(nèi)沒有引物二聚體產(chǎn)生。南通組織熒光定量PCR研究方案聚合酶鏈反應(yīng)是是一種簡單,廉價(jià)和可靠的方法復(fù)制DN段。

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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)生物學(xué)研究的歷史中占據(jù)了重要的地位。以此為基礎(chǔ)發(fā)展出包括Real-time PCR在內(nèi)的多項(xiàng)應(yīng)用技術(shù)。自誕生后Real-time PCR技術(shù)持續(xù)發(fā)展,從簡單的增擴(kuò)到整個PCR過程,Real-time PCR表現(xiàn)出比PCR更敏感、更明確的定量分析特性和對識別等位基因的能力。不少人以為real-time就是意味著可以在顯示器上看到每個循環(huán)增擴(kuò)曲線的增長。事實(shí)并非如此,早期的軟件不能在運(yùn)行期間提供可視化的增擴(kuò)曲線。主要是因?yàn)镾DS軟件采用整個平臺較終的數(shù)據(jù)執(zhí)行數(shù)據(jù)分析工作,而不是分析每個單獨(dú)的反應(yīng)循環(huán)。對某些設(shè)備來說,必須向分析軟件提供實(shí)時的數(shù)據(jù),有些設(shè)備則不需要。前一種設(shè)備允許軟件實(shí)時跟蹤每個加樣口的增擴(kuò)曲線,同時顯示在電腦屏幕上。

Real-time PCR的染料法和探針法的選擇:進(jìn)行mRNA表達(dá)量的測定,采用染料法是比較經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的;染料法可以通過比較熔解曲線的熔解峰位置得到產(chǎn)物特異性的情況;目的基因和內(nèi)參基因分管檢測,染料法可以選用Realtime染料PCRPreMIX,探針法主要應(yīng)用于病毒RNA的檢測;以及單位點(diǎn)突變(SNP);多基因的合并檢測,探針法還可用于同一個反應(yīng)中同時檢測目的基因和內(nèi)參基因的情況;而染料法則必須分管檢測。Real-time PCR:實(shí)時熒光定量PCR技術(shù)(Real-timequantitativePolymeraseChainReaction簡稱Real-time PCR)是在定性PCR技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的核酸定量技術(shù)。實(shí)時熒光定量在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號積累實(shí)時監(jiān)測整個PCR進(jìn)程,使每一個循環(huán)變得“可見”,之后通過Ct值和標(biāo)準(zhǔn)曲線對樣品中的DNA(orcDNA)的起始濃度進(jìn)行定量的方法。Real-time PCR探針法實(shí)驗(yàn)結(jié)果穩(wěn)定重複性好,特異性更高。

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Real-time PCR反應(yīng):多重連接依賴探針擴(kuò)增(MLPA):允許用單個引物對擴(kuò)增多個靶標(biāo),從而避免多重PCR的分辨率限制。多重聚合酶鏈反應(yīng):由單個PCR混合物中的多個引物組組成,以產(chǎn)生對不同DNA序列特異的不同大小的擴(kuò)增子。通過同時靶向多個基因,可以從單次測試中獲得額外的信息,否則將需要幾次試劑和更多時間來執(zhí)行。每個引物組的退火溫度必須優(yōu)化,以在單個反應(yīng)中正確工作,并符合擴(kuò)增子尺寸。也就是說,當(dāng)通過凝膠電泳可視化時,它們的堿基對長度應(yīng)該足夠不同以形成不同的條帶。Real-time PCR在實(shí)驗(yàn)過程中為了防止非特異性擴(kuò)增,必須設(shè)陰性對照。南京實(shí)時Real-time PCR

由于在PCR擴(kuò)增的指數(shù)時期,模板的Ct值和該模板的起始拷貝數(shù)存在線性關(guān)系,所以成為定量的依據(jù)。南通組織熒光定量PCR研究方案

Real-time PCR鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的常見問題:靶序列變異:如靶序列發(fā)生突變或缺失,影響引物與模板特異性結(jié)合,或因靶序列某段缺失使引物與模板失去互補(bǔ)序列,其PCR擴(kuò)增是不會成功的。假陽性:出現(xiàn)的PCR擴(kuò)增條帶與目的靶序列條帶一致,有時其條帶更整齊,亮度更高。引物設(shè)計(jì)不合適:選擇的擴(kuò)增序列與非目的擴(kuò)增序列有同源性,因而在進(jìn)行PCR擴(kuò)增時,擴(kuò)增出的PCR產(chǎn)物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出現(xiàn)假陽性。需重新設(shè)計(jì)引物。出現(xiàn)片狀拖帶或涂抹帶:PCR擴(kuò)增有時出現(xiàn)涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶。其原因往往由于酶量過多或酶的質(zhì)量差,dNTP濃度過高,Mg2+濃度過高,退火溫度過低,循環(huán)次數(shù)過多引起。其對策有:減少酶量,或調(diào)換另一來源的酶。②減少dNTP的濃度。適當(dāng)降低Mg2+濃度。增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)準(zhǔn)備:PCR所用的酶主要有兩種來源:Taq和Pfu,分別來自兩種不同的噬熱菌。南通組織熒光定量PCR研究方案

上海司鼎生物科技有限公司正式組建于2016-06-07,將通過提供以免疫印跡(WB)技術(shù)服務(wù),熒光定量PCR技術(shù)服務(wù),膜片鉗電生理技術(shù)服務(wù),在體光纖成像記錄技術(shù)服務(wù)等服務(wù)于于一體的組合服務(wù)。司鼎生物經(jīng)營業(yè)績遍布國內(nèi)諸多地區(qū)地區(qū),業(yè)務(wù)布局涵蓋免疫印跡(WB)技術(shù)服務(wù),熒光定量PCR技術(shù)服務(wù),膜片鉗電生理技術(shù)服務(wù),在體光纖成像記錄技術(shù)服務(wù)等板塊。隨著我們的業(yè)務(wù)不斷擴(kuò)展,從免疫印跡(WB)技術(shù)服務(wù),熒光定量PCR技術(shù)服務(wù),膜片鉗電生理技術(shù)服務(wù),在體光纖成像記錄技術(shù)服務(wù)等到眾多其他領(lǐng)域,已經(jīng)逐步成長為一個獨(dú)特,且具有活力與創(chuàng)新的企業(yè)。值得一提的是,司鼎生物致力于為用戶帶去更為定向、專業(yè)的醫(yī)藥健康一體化解決方案,在有效降低用戶成本的同時,更能憑借科學(xué)的技術(shù)讓用戶極大限度地挖掘司鼎;OriCell的應(yīng)用潛能。

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