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武漢細(xì)胞熒光PCR方案

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-04-13

PCR的反應(yīng)條件:dNTP濃度過高會(huì)加快反應(yīng)速度,但同時(shí)還可以增加堿基的錯(cuò)誤摻入率。引物濃度過高會(huì)引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增。TaqDNA聚合酶濃度過高會(huì)引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增,低則合成產(chǎn)物量減少。TaqDNA聚合酶無校正功能,摻入錯(cuò)誤率達(dá)2*E-4個(gè)核苷酸,一個(gè)30個(gè)循環(huán)的擴(kuò)增反應(yīng)0.1%-0.25%總錯(cuò)誤率。在90~95度下可使整個(gè)基因組的DNA變性為單鏈。一般94~95度30~60s。時(shí)間過長使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結(jié)合。引物長度在15~25時(shí)退火溫度。如果基因的基因組DNA序列是已知的,逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)可以用來繪制基因中外顯子和內(nèi)含子的位置。武漢細(xì)胞熒光PCR方案

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聚合酶鏈反應(yīng):多重連接依賴探針擴(kuò)增(MLPA):允許用單個(gè)引物對擴(kuò)增多個(gè)靶標(biāo),從而避免多重PCR的分辨率限制。多重聚合酶鏈反應(yīng):由單個(gè)PCR混合物中的多個(gè)引物組組成,以產(chǎn)生對不同DNA序列特異的不同大小的擴(kuò)增子。通過同時(shí)靶向多個(gè)基因,可以從單次測試中獲得額外的信息,否則將需要幾次試劑和更多時(shí)間來執(zhí)行。每個(gè)引物組的退火溫度必須優(yōu)化,以在單個(gè)反應(yīng)中正確工作,并符合擴(kuò)增子尺寸。也就是說,當(dāng)通過凝膠電泳可視化時(shí),它們的堿基對長度應(yīng)該足夠不同以形成不同的條帶。武漢細(xì)胞熒光PCR方案序列間特異性聚合酶鏈反應(yīng)放大簡單重復(fù)序列之間的區(qū)域,以產(chǎn)生擴(kuò)增片段長度的獨(dú)特指紋。

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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):反應(yīng)的控制:PCR反應(yīng)的緩沖液 提供合適的酸堿度與某些離子;鎂離子濃度 總量應(yīng)比dNTPs的濃度高,常用1.5mmol/L;底物濃度 dNTP以等摩爾濃度配制,20~200umol/L;TaqDNA聚合酶 2.5U(100ul);引物濃度一般為0.1 ~ 0.5umol/L;反應(yīng)溫度和循環(huán)次數(shù);變性溫度和時(shí)間 95℃,30s;退火溫度和時(shí)間 低于引物Tm值5 ℃左右,一般在45~55℃;延伸溫度和時(shí)間 72℃,1min/kb(10kb內(nèi));Tm值=4(G+C) +2(A+T);循環(huán)次數(shù) :一般為25 ~ 30次。循環(huán)數(shù)決定PCR擴(kuò)增的產(chǎn)量。模板初始濃度低,可增加循環(huán)數(shù)以便達(dá)到有效的 擴(kuò)增量。但循環(huán)數(shù)并不是可以無限增加的。一般循環(huán)數(shù)為30個(gè)左右,循環(huán)數(shù)超過30個(gè)以后,DNA聚合酶活性逐漸達(dá)到飽和,產(chǎn)物的量不再隨循環(huán)數(shù)的增加而增加,出現(xiàn)了所謂的“平臺(tái)期”。

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)準(zhǔn)備:引物內(nèi)部不應(yīng)出現(xiàn)互補(bǔ)序列。兩個(gè)引物之間不應(yīng)存在互補(bǔ)序列,尤其是避免3 ′端的互補(bǔ)重疊。引物與非特異擴(kuò)增區(qū)的序列的同源性不要超過70%,引物3′末端連續(xù)8個(gè)堿基在待擴(kuò)增區(qū)以外不能有完全互補(bǔ)序列,否則易導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增。引物3‘端的堿基,特別是很末及倒數(shù)第二個(gè)堿基,應(yīng)嚴(yán)格要求配對,很好選擇是G和C。引物的5′端可以修飾。如附加限制酶位點(diǎn),引入突變位點(diǎn),用生物素、熒光物質(zhì)、地高辛標(biāo)記,加入其它短序列,包括起始密碼子、終止密碼子等。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)中要確保反應(yīng)緩沖液融化完全并徹底混勻。

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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)是一種用于放大擴(kuò)增特定的DN段的分子生物學(xué)技術(shù),它可看作是生物體外的特殊DNA復(fù)制,PCR的很大特點(diǎn)是能將微量的DNA大幅增加。因此,無論是化石中的古生物、歷史人物的殘骸,還是幾十年前兇殺案中兇手所遺留的毛發(fā)、皮膚或血液,只要能分離出一丁點(diǎn)的DNA,就能用PCR加以放大,進(jìn)行比對。這也是“微量證據(jù)”的威力之所在。由1983年美國首先提出設(shè)想,1985年由其發(fā)明了聚合酶鏈反應(yīng),即簡易DNA擴(kuò)增法,意味著PCR技術(shù)的真正誕生。到2013年,PCR已發(fā)展到第三代技術(shù)。聚合酶鏈反應(yīng)應(yīng)經(jīng)常使用帶有一次性柱塞和超長移液器吸頭的移液器。莆田組織RT-PCR檢測技術(shù)

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的模板的取材主要依據(jù)PCR的擴(kuò)增對象,可以是病原體標(biāo)本如病毒、細(xì)菌、菌類等。武漢細(xì)胞熒光PCR方案

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的常見問題:陰性:需注意的是有時(shí)忘加Taq酶或溴乙錠。引物:引物質(zhì)量、引物的濃度、兩條引物的濃度是否對稱,是PCR失敗或擴(kuò)增條帶不理想、容易彌散的常見原因。有些批號(hào)的引物合成質(zhì)量有問題,兩條引物一條濃度高,一條濃度低,造成低效率的不對稱擴(kuò)增,對策為:選定一個(gè)好的引物合成單位。引物的濃度不但要看OD值,更要注重引物原液做瓊脂糖凝膠電泳,一定要有引物條帶出現(xiàn),而且兩引物帶的亮度應(yīng)大體一致,如一條引物有條帶,一條引物無條帶,此時(shí)做PCR有可能失敗,應(yīng)和引物合成單位協(xié)商解決。如一條引物亮度高,一條亮度低,在稀釋引物時(shí)要平衡其濃度。引物應(yīng)高濃度小量分裝保存,防止多次凍融或長期放冰箱冷藏部分,導(dǎo)致引物變質(zhì)降解失效。引物設(shè)計(jì)不合理,如引物長度不夠,引物之間形成二聚體等。武漢細(xì)胞熒光PCR方案

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