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深圳細(xì)胞RT-PCR檢測(cè)技術(shù)應(yīng)用

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-04-12

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的常見(jiàn)問(wèn)題:靶序列變異:如靶序列發(fā)生突變或缺失,影響引物與模板特異性結(jié)合,或因靶序列某 段缺失使引物與模板失去互補(bǔ)序列,其PCR擴(kuò)增是不會(huì)成功的。假陽(yáng)性:出現(xiàn)的PCR擴(kuò)增條帶與目的靶序列條帶一致,有時(shí)其條帶更整齊,亮度更高。引物設(shè)計(jì)不合適:選擇的擴(kuò)增序列與非目的擴(kuò)增序列有同源性,因而在進(jìn)行PCR擴(kuò)增時(shí),擴(kuò)增出的PCR產(chǎn)物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出現(xiàn)假陽(yáng)性。需重新設(shè)計(jì)引物。出現(xiàn)片狀拖帶或涂抹帶:PCR擴(kuò)增有時(shí)出現(xiàn)涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶。其原因往往由于酶量過(guò)多或酶的質(zhì)量差,dNTP濃度過(guò)高,Mg2+濃度過(guò)高,退火溫度過(guò)低,循環(huán)次數(shù)過(guò)多引起。其對(duì)策有:減少酶量,或調(diào)換另一來(lái)源的酶。②減少dNTP的濃度。適當(dāng)降低Mg2+濃 度。增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。重疊延伸聚合酶鏈反應(yīng)可以創(chuàng)造特定的長(zhǎng)DNA構(gòu)建體。深圳細(xì)胞RT-PCR檢測(cè)技術(shù)應(yīng)用

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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):RNA和DNA的五碳糖,前者比后者多了一個(gè)O,由于多出來(lái)的O原子造成了RNA和DNA的堿基不同,即O原子造成U和T的不同,U分子化學(xué)式C4H4N2O2,T胸腺嘧啶化學(xué)式C5H6N2O2,現(xiàn)在將兩個(gè)分子式進(jìn)行對(duì)比,U比T多了CH2,結(jié)合前面的核糖區(qū)別,還有一個(gè)O分子,其余結(jié)構(gòu)相同,那么O和CH2之間的聯(lián)系是什么?是什么導(dǎo)致DNA和RNA的區(qū)別是RNA比DNA多了O和CH2?或者說(shuō)如何將病毒的堿基中U變成DNA堿基中的T?若從結(jié)構(gòu)上說(shuō),直接從U中加入一個(gè)CH2,得到了T,這里面介入化學(xué)鍵的斷裂和重組,但是這樣一來(lái)的話(huà),即使U變成了T,但是核糖依舊是RNA比DNA多了一個(gè)O分子,只是此時(shí)結(jié)構(gòu)是某分子=核糖(C4H9O4CHO)+堿基(A T G C),形成了RNA的五碳糖+DNA的堿基這種分子了。此時(shí)將這種分子導(dǎo)入受體細(xì)胞(亦或者蛋白質(zhì))中,表達(dá)的性質(zhì)一定不同于病毒表達(dá)的性質(zhì)。黃山骨頭熒光PCR序列間特異性聚合酶鏈反應(yīng)是一種用于DNA指紋識(shí)別的聚合酶鏈反應(yīng)方法。

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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):DNA的半保留復(fù)制是生物進(jìn)化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解旋成單鏈,在DNA聚合酶的參與下,根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則復(fù)制成同樣的兩分子拷貝。在實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),DNA在高溫時(shí)也可以發(fā)生變性解鏈,當(dāng)溫度降低后又可以復(fù)性成為雙鏈。因此,通過(guò)溫度變化控制DNA的變性和復(fù)性,加入設(shè)計(jì)引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的體外復(fù)制。但是,DNA聚合酶在高溫時(shí)會(huì)失活,因此,每次循環(huán)都得加入新的DNA聚合酶,不但操作煩瑣,而且價(jià)格昂貴,制約了PCR技術(shù)的應(yīng)用和發(fā)展。耐熱DNA聚合酶-Taq酶的發(fā)現(xiàn)對(duì)于PCR的應(yīng)用有里程碑的意義,該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活,不需要每個(gè)循環(huán)加酶,使PCR技術(shù)變得非常簡(jiǎn)捷、同時(shí)也降低了成本,PCR技術(shù)得以大量應(yīng)用,并逐步應(yīng)用于臨床。

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的常見(jiàn)問(wèn)題:Mg2+濃度:Mg2+離子濃度對(duì)PCR擴(kuò)增效率影響很大,濃度過(guò)高可降低PCR擴(kuò)增的特 異性,濃度過(guò)低則影響PCR擴(kuò)增產(chǎn)量甚至使PCR擴(kuò)增失敗而不出擴(kuò)增條帶。反應(yīng)體積的改變:通常進(jìn)行PCR擴(kuò)增采用的體積為20ul、30ul、50ul?;?00ul,應(yīng)用多 大體積進(jìn)行PCR擴(kuò)增,是根據(jù)科研和臨床檢測(cè)不同目的而設(shè)定,在做小體積如20ul 后,再做大體積時(shí),一定要模索條件,否則容易失敗。物理原因:變性對(duì)PCR擴(kuò)增來(lái)說(shuō)相當(dāng)重要,如變性溫度低,變性時(shí)間短,極有可能出現(xiàn)假陰性;退火溫度過(guò)低,可致非特異性擴(kuò)增而降低特異性擴(kuò)增效率退火溫度過(guò)高影響引物與模板的結(jié)合而降低PCR擴(kuò)增效率。有時(shí)還有必要用標(biāo)準(zhǔn)的溫度計(jì),檢測(cè)一下擴(kuò)增儀或水溶鍋內(nèi)的變性、退火和延伸溫度,這也是PCR失敗的原因之一。PCR由變性-退火-延伸三個(gè)基本反應(yīng)步驟構(gòu)成。

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聚合酶鏈反應(yīng):在檢測(cè)病原體方面,病原體培養(yǎng)是臨床診斷的金標(biāo)準(zhǔn) .但是對(duì)于一些苛養(yǎng)菌 生長(zhǎng)緩慢的細(xì)菌或難以培養(yǎng)的病原體等培養(yǎng)的陽(yáng)性檢出率不高.檢測(cè)時(shí)間過(guò)長(zhǎng) 無(wú)法滿(mǎn)足臨床早期快速診斷以指導(dǎo)醫(yī)治的需要[3]。當(dāng)前 PCR 技術(shù)是在傳統(tǒng) PCR 技術(shù)應(yīng)用的基礎(chǔ)上進(jìn)行的改進(jìn),包括實(shí)時(shí)定量 PCR 技術(shù) 、 實(shí)時(shí)熒光定量PCR、 PCR-酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn) 、 巢式PCR等。 在PCR技術(shù)的輔助作用下,實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)也逐漸從生化免疫診斷過(guò)渡到基因診斷,生化免疫檢測(cè)主要從表型表現(xiàn)評(píng)估病癥,而基因診斷則深入本質(zhì)探究其病因,以PCR 技術(shù)為主的核酸技術(shù)在臨床實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)與疾病診斷中表現(xiàn)出了明顯的應(yīng)用價(jià)值,在未來(lái)的臨床醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中必將會(huì)得到更加較廣的應(yīng)用。聚合酶鏈反應(yīng)的試劑應(yīng)分配到一次性的等分試樣中。黃山骨頭熒光PCR

PCR產(chǎn)物的生成量是以指數(shù)方式增加的,能將皮克量級(jí)的起始待測(cè)模板擴(kuò)增到微克水平。深圳細(xì)胞RT-PCR檢測(cè)技術(shù)應(yīng)用

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的常見(jiàn)問(wèn)題:出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增帶:PCR擴(kuò)增后出現(xiàn)的條帶與預(yù)計(jì)的大小不一致,或大或小,或者同時(shí)出現(xiàn)特異性擴(kuò)增帶 與非特異性擴(kuò)增帶。非特異性條帶的出現(xiàn),其原因:一是引物與靶序列不完全互補(bǔ)、或引物聚合形成二聚體。二是Mg2+離子濃度過(guò)高、退火溫度過(guò)低,及PCR循環(huán)次數(shù)過(guò)多有關(guān)。其次是酶的質(zhì)和量,往往一些來(lái)源的酶易出現(xiàn)非特異條帶而另一來(lái)源的酶則不出現(xiàn),酶量過(guò)多有時(shí)也會(huì)出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增。其對(duì)策有:必要時(shí)重新設(shè)計(jì)引 物。減低酶量或調(diào)換另一來(lái)源的酶。降低引物量,適當(dāng)增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。適當(dāng)提高退火溫度或采用二溫度點(diǎn)法(93℃變性,65℃左右退火與延伸)。深圳細(xì)胞RT-PCR檢測(cè)技術(shù)應(yīng)用

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