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湖南流式細胞高通量篩選

來源: 發(fā)布時間:2022-07-20

瓊脂平板篩選法,對突變體間差異可視化較弱,適用于突變庫的初步篩選,篩選后的突變體仍需要其他檢測方法如微孔板法進行準確定量。數(shù)字影像分光光度計在瓊脂平板篩選方法中的應用使瓊脂平板法的靈敏度提高且通量達到10^5克隆/d,若可根據(jù)目標酶或代謝產(chǎn)物的特性建立瓊脂平板篩選方法,則無需使用依賴復雜儀器設備的超高通量篩選法。平板篩選法是微生物在平板固體培養(yǎng)基上進行生殖反應,從而反應出來的性狀。微孔板篩選方法微孔板篩選方法通過檢測微孔板中底物或目標產(chǎn)物所引起的吸光度或熒光變化對其進行定量分析,可以保證篩選的精確性和靈敏度,是目前常用的篩選方法。根據(jù)熒光或吸光度精確檢測目標產(chǎn)物的微孔板(Microtiterplate,MTP)篩選方法應運而生,并已廣泛應用于酶和細胞工廠的定向改造中。但微孔板篩選法存在通量低、操作耗時等缺點。微孔板篩選法,可以理解成非常小的搖瓶,是微生物在液體環(huán)境中反應出來的性狀。細胞水平高通量篩選。湖南流式細胞高通量篩選

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高通量篩選的實驗方法分子水平和細胞水平的實驗方法(或稱篩選模型)是實現(xiàn)藥物高通量篩選的技術基礎。由于藥物高通量篩選要求同時處理大量樣品,實驗體系必須微量化,而這些微量化的實驗方法應根據(jù)新的科研成果來建立。第四軍醫(yī)大學周四元研究認為,藥物高通量篩選模型的實驗方法,根據(jù)其生物學特點,可分為以下幾類:受體結合分析法;酶活性測定法;細胞分子測定法;細胞活性測定法;代謝物質(zhì)測定法;基因產(chǎn)物測定法。這些實驗方法,均已用于藥物高通量篩選中。充分利用藥用資源 由于高通量篩選依賴數(shù)量龐大的樣品庫,實現(xiàn)了藥物篩選的規(guī)模化,較大限度地利用了藥用物質(zhì)資源,提高了藥物發(fā)現(xiàn)的幾率,同時提高了發(fā)現(xiàn)新藥的質(zhì)量。湖南流式細胞高通量篩選通過高通量篩選得到的藥物。

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基于細胞水平的篩選的關鍵特征之一是可以一次篩選多個靶標?;诩毎暮Y選常用于以下情況下:1)所需的分子靶標未知,2)靶標無法在生化測定中充分重組,3)所需的表型只存在于細胞環(huán)境中,例如從一種細胞類型分化到另一種細胞類型?;诩毎臋z測貫穿于藥物發(fā)現(xiàn)的所有階段:靶標選擇和驗證、初步篩選、先導化合物識別、先導化合物優(yōu)化以及安全和毒理學篩選。介紹一些細胞水平分析的方法:細胞活力、報告基因、第二信使和高內(nèi)涵成像等。

高通量篩選的實驗方法分子水平和細胞水平的實驗方法(或稱篩選模型)是實現(xiàn)藥物高通量篩選的技術基礎。由于藥物高通量篩選要求同時處理大量樣品,實驗體系必須微量化,而這些微量化的實驗方法應根據(jù)新的科研成果來建立。第四軍醫(yī)大學周四元研究認為,藥物高通量篩選模型的實驗方法,根據(jù)其生物學特點,可分為以下幾類:受體結合分析法;酶活性測定法;細胞分子測定法;細胞活性測定法;代謝物質(zhì)測定法;基因產(chǎn)物測定法。這些實驗方法,均已用于藥物高通量篩選中。高通量篩選菌種技術。

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在報告基因檢測(也稱為信號通路檢測)中,報告蛋白的序列編碼是在相關通路的轉(zhuǎn)錄控制下引入的。通過熒光或光學讀數(shù)監(jiān)測報告基因的表達,通過這些指標來間接反應啟動子的或抑制程度。觀察到的信號是整個通路的產(chǎn)物,篩選的化合物可以在該通路上的任何點相互作用。常見的報告基因是CAT(氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶)、GAL(β-半乳糖苷酶)、LAC(β-內(nèi)酰胺酶)、LUC(熒光素酶)和GFP。我們通常使用的為LUC(熒光素酶),但也可以使用其他報告基因。高通量篩選方法有哪些。湖南流式細胞高通量篩選

藥物高通量篩選系統(tǒng)。湖南流式細胞高通量篩選

正如之前提到,在高通量篩選中Assay的檢出方法有很多,用于衡量酶活性多的當屬于熒光檢出法和吸光度檢出法。這兩種方法都能非常便捷的與高通量進行匹配。但是這兩種檢出方法也有不適用的場景,比如吸光度檢出法,在終點法測定(endpointassay)時,如果化合物庫的吸收低于~410nm,實驗的背景吸收會引入假陽性(false-positive)和假陰性(false-negative)結果。雖然假陽性結果可以通過動力學Assay或者驗證Assay來解決,但是由于微量定量板有位于340~410nm的強吸收,所以仍舊會導致Z因子降低,直接結果就是較弱活性的苗頭化合物將很難被篩選出來。而對于熒光檢出法而言,自發(fā)熒光化合物庫或者具有光敏特性的化合物庫同樣會遇到假陽性和假陰性結果。在某種程度上,選擇合適的檢出方法可以減少甚至避免上述問題,比如使用更長波段的光源,對于熒光檢出來說,>500nm會是比較好的選擇。湖南流式細胞高通量篩選

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