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云南高通量篩選平臺(tái)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-04-04

作者通過(guò)對(duì)酶抑制劑的高通量篩選的總結(jié),揭示了當(dāng)下的新藥發(fā)展的病癥主要圍繞、細(xì)菌和病毒,研究靶標(biāo)也以激酶、磷酸化酶、肽酶等為主要的研究點(diǎn)。作為當(dāng)下主流的Assay方法,基于熒光的Assay在新藥發(fā)現(xiàn)中起到非常重要的作用。作者還通過(guò)對(duì)73個(gè)苗頭化合物到先導(dǎo)化合物的優(yōu)化和結(jié)構(gòu)改性案例分析,印證了類(lèi)藥五原則的重要指導(dǎo)意義,也提煉了特殊環(huán)系在新藥發(fā)現(xiàn)中的重要作用。另外,也總結(jié)了影響苗頭化合物檢出率的其他重要因素,包括Z因子、化合物庫(kù)質(zhì)量、假陽(yáng)性化合物的甄別以及選取合適的Assay檢出方法。這對(duì)藥物篩選和后期優(yōu)化,具有非常大的指導(dǎo)意義。高通量篩選的技術(shù)優(yōu)點(diǎn)。云南高通量篩選平臺(tái)

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高通量篩選的特色效用高通量篩選技術(shù)是將多種技術(shù)方法有機(jī)結(jié)合而形成的一種新技術(shù)體系,它以微板形式作為實(shí)驗(yàn)工具載體,以自動(dòng)化操作系統(tǒng)執(zhí)行實(shí)驗(yàn)過(guò)程,以靈敏快速的檢測(cè)儀器采集實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),以計(jì)算機(jī)對(duì)數(shù)以千計(jì)的樣品數(shù)據(jù)進(jìn)行分析處理,從而得出科學(xué)準(zhǔn)確的實(shí)驗(yàn)結(jié)果和特色效用。英國(guó)學(xué)者AlanD研究提示,一個(gè)實(shí)驗(yàn)室采用傳統(tǒng)的方法,借助20余種藥物作用靶位,1年內(nèi)能篩選75000個(gè)樣品;1997年高通量篩選技術(shù)發(fā)展初期,采用100余種靶位,每年可篩選100萬(wàn)個(gè)樣品;1999年高通量篩選技術(shù)進(jìn)一步完善后,每天的篩選量就高達(dá)10萬(wàn)種化合物。云南高通量篩選平臺(tái)微流控高通量篩選技術(shù)。

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充分利用藥用資源由于高通量篩選依賴(lài)數(shù)量龐大的樣品庫(kù),實(shí)現(xiàn)了藥物篩選的規(guī)?;^大限度地利用了藥用物質(zhì)資源,提高了藥物發(fā)現(xiàn)的幾率,同時(shí)提高了發(fā)現(xiàn)新藥的質(zhì)量。微量篩選系統(tǒng)由于高通量篩選采用的是細(xì)胞、分子水平的篩選模型.樣品用量一般在微克級(jí)(μg),節(jié)省了樣品資源,奠定了“一藥多篩”的物質(zhì)基礎(chǔ),同時(shí)節(jié)省了實(shí)驗(yàn)材料,降低了單藥篩選成本。高度自動(dòng)化操作隨著對(duì)高通量藥物篩選的重視程度不斷提高,用于高通量藥物篩選操作設(shè)備和檢測(cè)儀器都有了長(zhǎng)足發(fā)展,實(shí)現(xiàn)了計(jì)算機(jī)控制的自動(dòng)化,減少了操作誤差的發(fā)生,提高了篩選效率和結(jié)果的準(zhǔn)確性。多學(xué)科理論和技術(shù)的結(jié)合在高通量篩選過(guò)程中,不僅應(yīng)用了普通的藥理學(xué)技術(shù)和理論,而且與藥物化學(xué)、分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、數(shù)學(xué)、微生物學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)等多學(xué)科緊密結(jié)合。這種多學(xué)科的有機(jī)結(jié)合,在藥物篩選領(lǐng)域產(chǎn)生大量新的課題和發(fā)展機(jī)會(huì),促進(jìn)了藥物篩選理論和技術(shù)的發(fā)展。

細(xì)胞活力的測(cè)定常用于藥物篩選。一種常見(jiàn)且可靠的活力測(cè)定為使用熒光素酶催化底物(熒光素)氧化,在ATP依賴(lài)性反應(yīng)中產(chǎn)光來(lái)測(cè)量ATP含量。我們也常使用如釕、阿拉馬爾藍(lán)和四氮唑類(lèi)化合物(MTT、MTS、XTT和WST-1)等染料通過(guò)測(cè)定熒光或顏色的變化來(lái)測(cè)定細(xì)胞活力。此外,細(xì)胞活力也可以通過(guò)細(xì)胞內(nèi)酶(蛋白酶、LDH)在培養(yǎng)基中的釋放或通過(guò)將不透膜的熒光染料插入DNA(如碘化丙啶)來(lái)評(píng)估,也可以使用膜滲透性DNA染料對(duì)細(xì)胞進(jìn)行計(jì)數(shù)。細(xì)胞活力測(cè)定。酶的高通量篩選實(shí)驗(yàn)。

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從先導(dǎo)化合物的結(jié)構(gòu)來(lái)看,特殊環(huán)系出現(xiàn)頻次多的是嘌呤結(jié)構(gòu),這有可能與激酶和其他一些基于核苷酸的酶在很多疾病中起到的巨大作用有關(guān)。其他出現(xiàn)頻次比較高的環(huán)系包括五元環(huán)的四氫噻唑、吡唑、吡咯、咪唑啉和吡咯烷,以及六元環(huán)哌啶和哌嗪類(lèi)骨架。分子柔性增加:大部分的先導(dǎo)化合物都含有一個(gè)手性中心,更有6個(gè)化合物含有兩個(gè)手性中心。從苗頭化合物到先導(dǎo)化合物,Sp3雜化碳原子個(gè)數(shù)比例有著地升高,統(tǒng)計(jì)上來(lái)說(shuō)從0.197± 0.157 上升到了0.255±0.162。高通量篩選技術(shù)原理。云南高通量篩選平臺(tái)

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高通量篩選時(shí)每天要對(duì)數(shù)以千萬(wàn)的樣品進(jìn)行檢測(cè),工作枯燥,步驟單一,操作人員容易疲勞、出錯(cuò)。自動(dòng)化操作系統(tǒng)由計(jì)算機(jī)及其操作軟件、自動(dòng)化加樣設(shè)備、溫孵離心設(shè)備和堆棧4個(gè)部分組成。自動(dòng)化操作系統(tǒng)代替人工操作顯然有諸多優(yōu)勢(shì),它利用計(jì)算機(jī)通過(guò)操作軟件控制整個(gè)實(shí)驗(yàn)過(guò)程,編程過(guò)程簡(jiǎn)潔明了。微量篩選系統(tǒng) 由于高通量篩選采用的是細(xì)胞、分子水平的篩選模型.樣品用量一般在微克級(jí)(μg),節(jié)省了樣品資源,奠定了“一藥多篩”的物質(zhì)基礎(chǔ),同時(shí)節(jié)省了實(shí)驗(yàn)材料,降低了單藥篩選成本。云南高通量篩選平臺(tái)

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