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上海蛋白免疫沉淀實驗原理

來源： 發(fā)布時間：2024-07-22

免疫沉淀技術(shù)（Immunoprecipitation, IP）的實驗步驟通常包括以下幾個關(guān)鍵環(huán)節(jié)：
1. 細胞裂解：首先需要收集細胞并裂解它們，以釋放細胞內(nèi)的蛋白質(zhì)。這通常通過添加含有蛋白酶抑制劑的裂解緩沖液來完成，以防止蛋白質(zhì)降解。
2. 裂解物上清：裂解后的細胞混合物通常需要通過離心來去除未破碎的細胞碎片和未裂解的細胞，從而獲得上清。
3. 抗體的添加：將特定于目標蛋白的抗體加入到裂解物中。這些抗體將特異性地結(jié)合到目標蛋白上。
4. 免疫復(fù)合物的形成：抗體與目標蛋白結(jié)合形成免疫復(fù)合物。
5. 免疫復(fù)合物的捕獲：使用Protein A/G結(jié)合的磁珠來捕獲免疫復(fù)合物。
6. 洗滌：捕獲免疫復(fù)合物后，需要用裂解/洗滌緩沖液多次洗滌，以去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和其他污染物。
7. 洗脫：免疫復(fù)合物可以通過加入SDS樣品緩沖液進行洗脫，這將導(dǎo)致抗體和抗原變性并從珠子上釋放下來，或者使用低pH緩沖液進行溫和洗脫，以保持蛋白質(zhì)的天然構(gòu)象。
8. 分析：洗脫后的樣品可以通過SDS-PAGE凝膠電泳、Western blot等方法進行分析，以驗證目標蛋白的存在和狀態(tài)。
免疫沉淀技術(shù)ChIP的原理是什么？上海蛋白免疫沉淀實驗原理

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Co-IP的實驗步驟：
1. 細胞裂解：首先，細胞或組織被裂解，釋放其中的蛋白質(zhì)。
2. 抗體結(jié)合：然后，將特異性抗體（針對已知蛋白質(zhì)之一的抗體）加入到裂解物中。這些抗體會特異性地結(jié)合到目標蛋白（誘餌蛋白）上。
3. 免疫復(fù)合物形成：抗體與目標蛋白結(jié)合后，形成免疫復(fù)合物。
4. 沉淀：接著，使用蛋白A或蛋白G結(jié)合的珠子（如瓊脂糖或磁性珠子）來捕獲免疫復(fù)合物。蛋白A或蛋白G能夠與抗體的Fc部分結(jié)合，從而拉下抗體以及與之結(jié)合的目標蛋白和任何相關(guān)的相互作用蛋白。
5. 洗滌：捕獲的免疫復(fù)合物被洗滌以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)。
6. 洗脫和分析：免疫復(fù)合物被洗脫并進行進一步的分析，如Western blot（WB）或質(zhì)譜分析，以鑒定相互作用的蛋白質(zhì)。
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免疫沉淀是利用抗體特異性反應(yīng)純化富集目的蛋白的一種方法?？贵w與細胞裂解液或表達上清中相應(yīng)的蛋白結(jié)合后，再與蛋白A/G（ProteinA/G）或二抗偶聯(lián)的珠子（agarose或Sepharose）孵育，通過離心得到珠子-蛋白A/G或二抗-抗體-目的蛋白復(fù)合物，沉淀經(jīng)過洗滌后，重懸于電泳上樣緩沖液，煮沸5-10min，在高溫及還原劑的作用下，抗原與抗體解離，離心收集上清，上清中包括抗體、目的蛋白和少量的雜蛋白。免疫沉淀是一種生物學(xué)技術(shù)，它利用抗體的特異性結(jié)合特性來富集和分離混合物中的特定蛋白質(zhì)。這種技術(shù)是研究蛋白質(zhì)表達、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)修飾和蛋白質(zhì)功能的強大工具。

免疫共沉淀分析（Co-IP）實驗原理與IP十分類似，基本的技術(shù)都是采用目標抗原特異性的固相化抗體；但IP的目標是純化單一抗原，而Co-IP旨在分離抗原及與抗原結(jié)合的蛋白質(zhì)或配體。

在Co-IP實驗中，已知抗原稱為誘餌蛋白，與之結(jié)合的蛋白則稱為靶蛋白。靶蛋白可能是一些復(fù)雜的伴侶蛋白、信號分子、結(jié)構(gòu)蛋白、輔助因子等，蛋白間相互作用強度范圍可能介于高度瞬時和十分穩(wěn)定之間?；镜腃o-IP實驗方案與IP相同，實際上任何IP系統(tǒng)均可用于Co-IP。但是，還有許多其他因素需要考慮，例如，結(jié)合和洗滌條件的優(yōu)化，優(yōu)化時，需要考慮到誘餌蛋白-靶蛋白的相互作用強度以及抗體-誘餌蛋白的親和力。
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ChIP（染色質(zhì)免疫沉淀）實驗是一種用于研究蛋白質(zhì)與DNA相互作用的技術(shù)。以下是ChIP實驗的實驗方法概述：
1. 交聯(lián)：將細胞與交聯(lián)劑（如1%甲醛）孵育，通常在室溫下進行10-15分鐘。
2. 終止交聯(lián)：添加甘氨酸以終止交聯(lián)反應(yīng)，孵育5分鐘。
3. 收集細胞：通過離心收集細胞，并用PBS洗滌以去除交聯(lián)劑。
4. 細胞裂解：使用裂解緩沖液裂解細胞，釋放染色質(zhì)。
5. 染色質(zhì)剪切：使用超聲波或酶消化將染色質(zhì)剪切成適當大小的片段。
6. 免疫沉淀：將剪切后的染色質(zhì)與特異性抗體孵育，然后添加蛋白A/G磁珠。
7. 洗滌：用低鹽、高鹽和LiCl洗滌液洗滌磁珠，去除非特異性結(jié)合物。
8. 洗脫：用洗脫緩沖液洗脫DNA。
9. 逆轉(zhuǎn)交聯(lián)：用蛋白酶K處理，然后在65°C下加熱過夜以逆轉(zhuǎn)交聯(lián)。
10. DNA純化：使用商業(yè)試劑盒或標準酚/氯仿方法純化DNA。
11. 分析：使用qPCR分析富集的DNA，或進行測序以確定蛋白質(zhì)結(jié)合位點。
免疫沉淀技術(shù)IP的優(yōu)缺點是什么？蛋白免疫沉淀磁珠的選擇

免疫沉淀技術(shù)IP實驗步驟。上海蛋白免疫沉淀實驗原理

ChIP技術(shù)的應(yīng)用：
1. 轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點的鑒定：研究特定轉(zhuǎn)錄因子在基因組上的結(jié)合模式。
2. 組蛋白修飾的分布：分析不同組蛋白修飾在基因組上的分布情況，這些修飾與基因的活躍或沉默有關(guān)。
3. DNA甲基化研究：結(jié)合ChIP技術(shù)可以研究DNA甲基化對基因表達的影響。
4. 染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能：研究染色質(zhì)重塑對基因表達和細胞功能的影響。
5. 疾病相關(guān)基因的調(diào)控：研究疾病狀態(tài)下基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的變化。
ChIP技術(shù)是表觀遺傳學(xué)研究中的一個重要工具，它可以幫助科學(xué)家們理解基因表達是如何在分子水平上被精確調(diào)控的。
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