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來源: 發(fā)布時間:2024-07-15

免疫沉淀純化所得抗原純度低一般有多種原因:
1. 非特異性蛋白污染
如果洗脫所得抗原純度較低,則有幾種方法可以進(jìn)行優(yōu)化。在結(jié)合或洗滌緩沖液中加入去污劑或其他可以降低非特異性結(jié)合的組分。使用普通微珠預(yù)純化樣本還可以降低非目標(biāo)分子的共純化。此外,還可以使用無關(guān)蛋白 (如BSA) 封閉微珠 。
2. 抗體污染
使用蛋白A、G或A/G的經(jīng)典免疫沉淀實(shí)驗(yàn)中會出現(xiàn)抗體與抗原共洗脫的情況。如果共洗脫會影響下游分析,則需要使用抗體通過共價(jià)連接固定至微珠的方法進(jìn)行實(shí)驗(yàn),如Pierce 直接 IP 或交聯(lián) IP 的形式。
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免疫沉淀技術(shù)RIP(RNA Immunoprecipitation,RNA免疫沉淀)的實(shí)驗(yàn)方法基于以下幾個關(guān)鍵步驟:
1. 細(xì)胞裂解:首先,細(xì)胞或組織樣本被裂解,以釋放細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)和RNA復(fù)合物。
2.抗體特異性結(jié)合:裂解后的樣本中加入針對特定RNA結(jié)合蛋白的抗體。這些抗體能夠特異性地識別并結(jié)合到目標(biāo)蛋白。
3. 免疫復(fù)合物形成:抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合后,形成抗體-蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合物。
4. 親和介質(zhì)捕獲:使用蛋白A或蛋白G結(jié)合的珠子(如瓊脂糖或磁性珠子)來捕獲這些抗體-蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合物。蛋白A或蛋白G能夠與抗體的Fc部分結(jié)合,從而拉下與之結(jié)合的復(fù)合物。
5. 洗滌:捕獲的復(fù)合物被洗滌以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)和RNA。
6. RNA分離和分析:從珠子上洗脫或消化復(fù)合物,分離出RNA,并進(jìn)行進(jìn)一步的分析,如qPCR、Northern blot或高通量測序(RNA-Seq)。
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免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)是一種利用抗體與特定蛋白質(zhì)結(jié)合的特性,從復(fù)雜樣本中分離和純化目標(biāo)蛋白質(zhì)的實(shí)驗(yàn)方法。這項(xiàng)技術(shù)在生物醫(yī)學(xué)研究中有著廣泛的應(yīng)用場景,以下是一些主要的應(yīng)用領(lǐng)域:
1. 蛋白質(zhì)相互作用分析:通過免疫沉淀技術(shù),研究人員可以研究蛋白質(zhì)之間的相互作用,揭示蛋白質(zhì)復(fù)合物的組成以及它們在細(xì)胞內(nèi)的功能和調(diào)控機(jī)制。
2. 抗體藥物開發(fā):免疫沉淀技術(shù)可以用于研究抗體藥物與其靶標(biāo)蛋白的結(jié)合特性,評估抗體藥物的親和力和特異性,指導(dǎo)抗體藥物的設(shè)計(jì)和優(yōu)化。
3. 蛋白質(zhì)表達(dá)水平分析:通過比較不同條件下的免疫沉淀結(jié)果,可以評估目標(biāo)蛋白的相對量,進(jìn)而研究蛋白質(zhì)的表達(dá)調(diào)控。
4. 染色質(zhì)免疫沉淀(ChIP):這是一種特殊的免疫沉淀技術(shù),用于研究蛋白質(zhì)與DNA的相互作用,如轉(zhuǎn)錄因子或組蛋白修飾與基因組特定區(qū)域的結(jié)合情況。
5. RNA免疫沉淀(RIP):類似于ChIP,RIP用于研究RNA結(jié)合蛋白與RNA分子之間的相互作用。

免疫沉淀(ChIP)實(shí)驗(yàn)中抗體的選擇非常關(guān)鍵,因?yàn)榭贵w的特異性和親和力直接影響到實(shí)驗(yàn)的成功與否。
1. 特異性:抗體應(yīng)當(dāng)對目標(biāo)蛋白具有高度的特異性,以避免與其他蛋白發(fā)生非特異性結(jié)合,導(dǎo)致假陽性結(jié)果。
2. 親和力:抗體對目標(biāo)蛋白的親和力要足夠高,以確保在免疫沉淀過程中能夠有效地捕獲目標(biāo)蛋白。
3. 抗體類型:單克隆抗體和多克隆抗體都可以用于IP實(shí)驗(yàn)。單克隆抗體提供更高的特異性和批間一致性,而多克隆抗體可能提供更強(qiáng)的結(jié)合能力和更廣的表位覆蓋。
4. 應(yīng)用驗(yàn)證:選擇已經(jīng)過免疫沉淀(ChIP)或相關(guān)應(yīng)用(如Western blot, IHC)驗(yàn)證的抗體,這增加了實(shí)驗(yàn)成功的可能性。
5. 供應(yīng)商信息:選擇信譽(yù)良好的抗體供應(yīng)商,并查看供應(yīng)商提供的技術(shù)數(shù)據(jù)和客戶評價(jià),以幫助做出決策。
免疫沉淀技術(shù)RIP的原理是什么?

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免疫共沉淀分析(Co-IP)與IP十分類似,基本的技術(shù)都是采用目標(biāo)抗原特異性的固相化抗體;但I(xiàn)P的目標(biāo)是純化單一抗原,而Co-IP旨在分離抗原及與抗原結(jié)合的蛋白質(zhì)或配體。

在Co-IP實(shí)驗(yàn)中,已知抗原稱為誘餌蛋白,與之結(jié)合的蛋白則稱為靶蛋白。靶蛋白可能是一些復(fù)雜的伴侶蛋白、信號分子、結(jié)構(gòu)蛋白、輔助因子等,蛋白間相互作用強(qiáng)度范圍可能介于高度瞬時和十分穩(wěn)定之間。
基本的Co-IP實(shí)驗(yàn)方案與IP相同,實(shí)際上任何IP系統(tǒng)均可用于Co-IP。但是,還有許多其他因素需要考慮,例如,結(jié)合和洗滌條件的優(yōu)化,優(yōu)化時,需要考慮到誘餌蛋白-靶蛋白的相互作用強(qiáng)度以及抗體-誘餌蛋白的親和力。
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免疫沉淀技術(shù)ChIP的原理是什么?北京RIP免疫沉淀磁珠多少錢

真核生物的基因組 DNA 以染色質(zhì)(Chromatin)的形式存在。因此,研究蛋白質(zhì)與 DNA 在染色質(zhì)環(huán)境中的相互作用是闡明真核生物基因表達(dá)機(jī)制的基本途徑,而染色質(zhì)免疫共沉淀(Chromatinimmunoprecipitation,ChIP)技術(shù)是目前公認(rèn)的研究此相互作用的選擇,是真核生物基因表達(dá)機(jī)制研究中不可或缺的技術(shù)之一。
它的基本原理是在活細(xì)胞狀態(tài)下,固定蛋白質(zhì)-DNA(染色質(zhì))復(fù)合物,并將其切斷為一定長度范圍內(nèi)的染色質(zhì)小片段,然后通過免疫學(xué)方法(抗體親和)沉淀此復(fù)合體,特異性地富集目的蛋白結(jié)合的 DNA,通過對目的片段的純化與后期檢測,從而獲得蛋白質(zhì)與 DNA 相互作用的信息。
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標(biāo)簽: 免疫沉淀 支原體
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