基因檢測**前沿的兩種方法是:高通量測序(NGS)和數(shù)字PCR(dPCR)。高通量測序技術(shù)又稱“下一代”測序技術(shù),可以一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測定,功能強大,但是實驗操作較復(fù)雜,數(shù)據(jù)分析難度較大,檢測周期長,成本較高。數(shù)字PCR技術(shù)是目前**精細(xì)**靈敏的基因檢測技術(shù),借助微液滴或微腔室,通過單個模板分子的PCR擴增,可實現(xiàn)不依賴于標(biāo)準(zhǔn)曲線和參照樣本的***定量。與NGS相比,數(shù)字PCR靈敏度高、檢測速度快、操作簡便、結(jié)果易讀、成本低廉等優(yōu)勢使其更適合臨床檢測,成為精細(xì)醫(yī)療實現(xiàn)平民化、大眾化的比較好選擇。此外,數(shù)字PCR還在基因表達(dá)差異研究、拷貝數(shù)變異(CNV)研究、低豐度DNA模板分子的精確定量、甲基化含量鑒定、二代測序輔助建庫、CRISPR-Cas9基因編輯結(jié)果驗證、轉(zhuǎn)基因成分的檢測、移植排異監(jiān)控、腸道菌群分析以及***基因組檢測等眾多領(lǐng)域中有著優(yōu)異的應(yīng)用。支持多重數(shù)字PCR,可選全中文分析軟件。青海實驗室數(shù)字PCR安裝
與常規(guī)PCR方法相比,數(shù)字PCR有如下優(yōu)勢:1、能夠***定量:常規(guī)PCR定量需要制定已知拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)DNA曲線,但是由于待檢樣本與標(biāo)準(zhǔn)曲線不在統(tǒng)一體系,條件上會存在差異,另外加上PCR擴增效率的差異從而影響定量結(jié)果的準(zhǔn)確性。而數(shù)字PCR不受標(biāo)準(zhǔn)曲線和擴增動力學(xué)影響,可進(jìn)行***定量。2、樣本需求量低:適用于珍貴樣本或核酸降解嚴(yán)重的樣本。3、靈敏度高:數(shù)字PCR是將傳統(tǒng)PCR反應(yīng)體系分割成數(shù)萬個 PCR反應(yīng),這些反應(yīng)可以精確地檢測很小的目的片段差異、單拷貝甚至低濃度的混雜樣本。且能避免非同源異質(zhì)雙鏈的形成。4、高耐受性:由于目的序列被分配到多個 反應(yīng)體系中,***降低了背景信號和***物對反應(yīng)的干擾,擴增基質(zhì)效應(yīng)大大減小。廣東噪音小數(shù)字PCR咨詢報價油包水乳化微滴技術(shù),在微管道中利用氣壓驅(qū)動生成十萬個微滴,單個微滴體積體積低至皮升級。
數(shù)字PCR也叫DigitalPCR(dPCR),是近幾年發(fā)展起來的一種核酸定量分析技術(shù)。相較于傳統(tǒng)熒光定量PCR來說,數(shù)字PCR對結(jié)果的判定不依賴于擴增曲線循環(huán)Ct值,不受擴增效率的影響,能夠直接讀出DNA的分子個數(shù),能夠?qū)ζ鹗紭颖竞怂岱肿?**定量。數(shù)字PCR基本原理是將一個樣本分成幾十到幾萬份,然后再將其分配到不同的反應(yīng)單元中,使每個微滴單元包含一個或多個拷貝的核酸分子(即DNA模板),每個單元都會對目標(biāo)分子進(jìn)行擴增,然后再對每個單元進(jìn)行熒光信號的統(tǒng)計并計算。相對而言,傳統(tǒng)PCR或qPCR反應(yīng)都是發(fā)生于同一體系當(dāng)中,這也是數(shù)字PCR與其比較大的區(qū)別。
二代測序輔助建庫目前靶向測序建庫方法包括擴增子方法,在均相溶液中,當(dāng)擴增引物增加時,由于擴增引物之間的相互作用,從而影響擴增的效率;如果將其分散到大量微液滴中擴增,將可降低引物間相互作用,提高擴增效率。同時還可以實現(xiàn)對于少量模板的有效擴增,得到更多的有效測序數(shù)據(jù)。CRISPR-Cas9基因編輯結(jié)果驗證CRISPR-Cas9技術(shù)的發(fā)明,是基因編輯技術(shù)的一大突破,但如何驗證實驗是否成功,仍需要高靈敏度的檢測方法,數(shù)字PCR技術(shù)可以滿足這一需求。Broad研究所張鋒團隊發(fā)明了以CRISPR為基礎(chǔ)的SHERLOCK技術(shù)可以對核酸進(jìn)行高靈敏度的定性檢測,但精確定量評估時仍采取了數(shù)字PCR進(jìn)行確認(rèn)。線性范圍達(dá)到6個數(shù)量級,靈敏度低至萬分之一。
相對于二代測序、基因芯片和定量PCR而言,數(shù)字PCR具備以下優(yōu)勢:●靈敏度可達(dá)到單個核酸分子:檢測限低至0.001%,主要系為數(shù)字PCR可以實現(xiàn)靶標(biāo)DNA/RNA的生物濃縮;●無需標(biāo)準(zhǔn)曲線活參照基因進(jìn)行對比來測定核算量,可對靶分子起始量進(jìn)行***定量,直接獨處DNA分子 的個數(shù);●適合環(huán)境復(fù)雜樣品的檢測:終點PCR檢測,不依賴Ct值,不依賴擴增效率,能克服PCR 劑的影響,避免樣品間的交叉 問題,適合各類復(fù)雜環(huán)境中的樣本進(jìn)行 定量,如動血樣、糞便、尿液、痰液、水樣、土壤、植物等;雙通道熒光檢測,支持EvaGreen染料及探針法。青海實驗室數(shù)字PCR安裝
采用微滴式技術(shù)高達(dá)100,000個的微滴。青海實驗室數(shù)字PCR安裝
數(shù)字PCR(dPCR)是近年來引起重視并迅速發(fā)展起來的一種突破性的核酸定量分析技術(shù)。該技術(shù)先將核酸模板進(jìn)行稀釋,分配到大量 的反應(yīng)單元中,使每個反應(yīng)單元中只有單個模板分子,然后進(jìn)行PCR擴增反應(yīng),擴增結(jié)束后對每個反應(yīng)室的熒光信號進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,來定量DNA拷貝數(shù)。數(shù)字PCR采用先擴增后定量,因此不依賴擴增曲線的循環(huán)閾值(Ct),也無需采用內(nèi)參基因和標(biāo)準(zhǔn)曲線,準(zhǔn)確度高、重現(xiàn)性好,可以實現(xiàn)***定量分析。由于其獨特的技術(shù)優(yōu)勢,已經(jīng)在臨床診斷、轉(zhuǎn)基因成分定量、單細(xì)胞基因表達(dá)分析、環(huán)境微生物檢測和下一代測序等研究領(lǐng)域顯示出巨大的優(yōu)勢和應(yīng)用前景。青海實驗室數(shù)字PCR安裝
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