研究方向甲基化含量鑒定作為表觀遺傳學(xué)研究中重要的一個研究方向——甲基化程度分析,現(xiàn)階段有不同的方法或技術(shù)來進(jìn)行研究:如傳統(tǒng)的亞硫酸氫鹽處理后的克隆測序統(tǒng)計法、抗體檢測法、定量PCR檢測法等。這些方法皆因方法學(xué)的問題而不能獲得精確的定量,而微滴式數(shù)字PCR系統(tǒng)通過對樣品的微滴化處理及目標(biāo)因子的***拷貝數(shù)定量,為甲基化程度的精確定量檢測提供了一種全新 的技術(shù)。*****的伴隨診斷常用體液來源(如血液,胸腹水,唾液及尿液等)的待檢標(biāo)本中的DNA,有正常脫落體細(xì)胞和病變脫落細(xì)胞兩種來源,前者的量遠(yuǎn)大于后者。通過微液滴處理能在每個微液滴中有效減少正常體細(xì)胞DNA的干擾,實現(xiàn)**標(biāo)記物的有效檢測,如EGFR,ALK,ROS1,KRAS、BRAF等基因的突變檢測、乳腺*/胃*的HER2基因擴(kuò)增檢測等,應(yīng)用于**精細(xì)醫(yī)學(xué)的伴隨診斷。全封閉防污染設(shè)計,一鍵式自動化操作。常州永諾數(shù)字PCR哪家好
數(shù)字PCR(dPCR)是近年來引起重視并迅速發(fā)展起來的一種突破性的核酸定量分析技術(shù)。該技術(shù)先將核酸模板進(jìn)行稀釋,分配到大量 的反應(yīng)單元中,使每個反應(yīng)單元中只有單個模板分子,然后進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng),擴(kuò)增結(jié)束后對每個反應(yīng)室的熒光信號進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,來定量DNA拷貝數(shù)。數(shù)字PCR采用先擴(kuò)增后定量,因此不依賴擴(kuò)增曲線的循環(huán)閾值(Ct),也無需采用內(nèi)參基因和標(biāo)準(zhǔn)曲線,準(zhǔn)確度高、重現(xiàn)性好,可以實現(xiàn)***定量分析。由于其獨特的技術(shù)優(yōu)勢,已經(jīng)在臨床診斷、轉(zhuǎn)基因成分定量、單細(xì)胞基因表達(dá)分析、環(huán)境微生物檢測和下一代測序等研究領(lǐng)域顯示出巨大的優(yōu)勢和應(yīng)用前景。蘇州數(shù)字PCR如何選型無創(chuàng)產(chǎn)前篩查:低成本、快速。
CNV(CopyNumberVariations,拷貝數(shù)變異)研究需要極高的定量精度以區(qū)別不同拷貝數(shù)之間的微小差異,測序方法適用于高于30%的變異率檢測,而qPCR的比較**辨在1.5倍左右,數(shù)字PCR通過直接計數(shù)目標(biāo)基因與參照基因(拷貝數(shù)為1的基因,例如RNaseP)的數(shù)目, 計算比值,直接得到目標(biāo)基因的拷貝數(shù)可以達(dá)到極高的拷貝數(shù)分辨精度。除此之外,dPCR在病原微生物檢測、microRNA研究、基因表達(dá)研究、NGS測序文庫的***定量、表觀遺傳學(xué)直接相關(guān)的DNA甲基化定量檢測、ChIP定量鑒定等領(lǐng)域的應(yīng)用都令人極為期待,而在轉(zhuǎn)基因成分鑒定、分子標(biāo)準(zhǔn)品精確定量、環(huán)境樣本檢測等具體的應(yīng)用方向上,已經(jīng)有大量實驗數(shù)據(jù)和結(jié)果證明了dPCR技術(shù)的優(yōu)良性能。
研究方向基因表達(dá)差異研究檢測時完全不依賴傳統(tǒng)的Ct值即可實現(xiàn)真正意義上的***定量,從而提供了比實時熒光定量PCR更精確的基因差異表達(dá)研究,尤其對于那些靶基因表達(dá)差異微小的情況:microRNA、lncRNAs等的表達(dá)分析、等位基因的不平衡表達(dá)、單細(xì)胞基因表達(dá)分析、Exosome內(nèi)核酸分子定量分析等。拷貝數(shù)變異(CNV)研究微滴化的樣品處理及檢測,這種擺脫Ct值的計算方法而直接獲取目標(biāo)基因的***拷貝數(shù),為拷貝數(shù)變異的研究提供了***的檢測精度。是其他諸如二代測序、芯片雜交等平臺無法達(dá)到的,因此采用數(shù)字PCR能夠有效對NGS、aCGH的實驗結(jié)果進(jìn)行驗證,并具有成本低、通量高的特點。雙通道熒光檢測,支持EvaGreen染料及探針法。
無創(chuàng)產(chǎn)前檢查鐮狀細(xì)胞貧血(sicklecellanemia)是HBB基因突變引起的常染色體顯性遺傳病,有嚴(yán)重的危害,可以導(dǎo)致高達(dá)5%的胎兒死亡率及4.62%的孕婦死亡率。而精細(xì)有效的無創(chuàng)產(chǎn)前診斷是預(yù)防鐮狀細(xì)胞貧血患兒出生的有效方法。研究人員采用dPCR技術(shù)檢測孕婦胎兒 游離DNA(cff-DNA)HBB基因突變。結(jié)果顯示,dPCR技術(shù)能夠確定87%的男性胎兒(n=45)和75%的女性胎兒(n=20)HBB基因的突變狀態(tài)。當(dāng)cff-DNA濃度大于7%時,可以**的檢測出HBB基因突變[3],可以說是相當(dāng)厲害了。數(shù)字PCR技術(shù)是公認(rèn)的液體活檢領(lǐng)域靈敏度比較好的檢測方法。上海數(shù)字PCR原理
支持多重數(shù)字PCR,可選全中文分析軟件。常州永諾數(shù)字PCR哪家好
目前數(shù)字PCR技術(shù)在臨床領(lǐng)域已經(jīng)有著非常***且***地應(yīng)用,例如在病原微生物檢測中的應(yīng)用:HBV檢測、HIV檢測、甲型流感病毒檢測等;在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用:13/18/21號染色體三倍體檢測、遺傳性耳聾檢測、地中海貧血檢測及優(yōu)生五項的病毒檢測等;在**靶向***相關(guān)基因檢 測中的應(yīng)用:肺*EGFR基因突變、ALK基因融合檢測、結(jié)直腸*KRAS、BRAF基因突變檢測、乳腺*HER2基因擴(kuò)增檢測、神經(jīng)膠質(zhì)瘤IDH基因突變檢測等。以**靶向***相關(guān)基因檢測為例,在**形成的超早期,會出現(xiàn)**細(xì)胞的壞死和凋亡,這些凋亡或壞死的**細(xì)胞會釋放其DNA進(jìn)入外周血,因此通過分析循環(huán)血液中是否含有**特異的游離DNA就可以達(dá)到**早期篩查的目的。然而此時DNA含量極低,對檢測的靈敏度和精確性要求極高,目前只有數(shù)字PCR技術(shù)可以檢測出來。另外進(jìn)行個體化***時,需要對基因組樣本進(jìn)行分析,此時利用數(shù)字PCR技術(shù)也能**提高結(jié)果的可信性,進(jìn)而建立合理***方案。常州永諾數(shù)字PCR哪家好
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