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南京血液定量PCR原理及步驟

來源: 發(fā)布時間:2022-01-20

聚合酶鏈反應(yīng):流聚合酶鏈反應(yīng):一種偽等溫PCR方法。將溶液置于熱梯度下,而不是反復(fù)加熱和冷卻聚合酶鏈反應(yīng)混合物。由此產(chǎn)生的熱不穩(wěn)定性驅(qū)動對流流動自動將聚合酶鏈反應(yīng)試劑從熱區(qū)域和冷區(qū)域打亂,從而反復(fù)啟動聚合酶鏈反應(yīng)。通過利用混沌流場的出現(xiàn),可以優(yōu)化熱邊界條件和PCR外殼的幾何形狀等參數(shù),以產(chǎn)生特異和快速的PCR。這種對流聚合酶鏈反應(yīng)設(shè)置明顯降低了設(shè)備功率需求和操作時間。逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)):用于從RNA中擴增DNA。逆轉(zhuǎn)錄酶將核糖核酸逆轉(zhuǎn)錄成cDNA ,然后通過聚合酶鏈反應(yīng)進行擴增。逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)較廣用于表達譜,以確定基因的表達或鑒定RNA轉(zhuǎn)錄物的序列,包括轉(zhuǎn)錄起始和終止位點。如果基因的基因組DNA序列是已知的,逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)可以用來繪制基因中外顯子和內(nèi)含子的位置。基因的5’端(對應(yīng)于轉(zhuǎn)錄起始位點)通常通過 RACE-PCR (快速擴增cDNA末端)中。PCR產(chǎn)物的生成量是以指數(shù)方式增加的,能將皮克量級的起始待測模板擴增到微克水平。南京血液定量PCR原理及步驟

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聚合酶鏈式反應(yīng)的步驟:標準的PCR過程分為三步:DNA變性:(90℃-96℃):雙鏈DNA模板在熱作用下,氫鍵斷裂,形成單鏈DNA;退火:(60℃-65℃):系統(tǒng)溫度降低,引物與DNA模板結(jié)合,形成局部雙鏈。延伸:(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性很好)的作用下,以dNTP為原料,從引物的3′端開始以從5′→3′端的方向延伸,合成與模板互補的DNA鏈。每一循環(huán)經(jīng)過變性、退火和延伸,DNA含量即增加一倍?,F(xiàn)在有些PCR因為擴增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時間內(nèi)復(fù)制完成,因此可以改為兩步法,即退火和延伸同時在60℃-65℃間進行。深圳特殊樣本定量PCR網(wǎng)站PCR的很大特點是能將微量的DNA大幅增加。

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聚合酶鏈式:PCR由變性--退火--延伸三個基本反應(yīng)步驟構(gòu)成:模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準備;模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合;引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基配對與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA 鏈互補的半保留復(fù)制鏈重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三過程,就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2-4分鐘,2-3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。到達平臺期(Plateau)所需循環(huán)次數(shù)取決于樣品中模板的拷貝?!CR技術(shù)敏感性高,特異性強,操作簡便、快速,在生命科學研究、食品衛(wèi)生、醫(yī)療、法醫(yī)及環(huán)境監(jiān)測等諸多方面都具有重要的應(yīng)用價值。

聚合酶鏈式反應(yīng):三步:變性:模板DNA加熱變性;復(fù)性,引物與它的靶序列發(fā)生退火,引物DNA量多,使引物和模板在局部形成雜交鏈;延伸,4種dNTP 與 Mg2+ 存在的條件下,DNA合成酶催化以引物為起始點,按5'-3'方向進行延伸。上面三步為一個循環(huán),可使拷貝數(shù)到達2*E-6-2*E-7。PCR產(chǎn)物一段雙鏈DNA,是由它的末端引物的5’端決定的。首輪擴增,其產(chǎn)物是大小不均一的DNA分子。長度應(yīng)大于兩引物之間的長度。在第二個循環(huán)中,由于5'固定,其產(chǎn)物長度就由等于兩引物之間的長度。所以幾十個循環(huán)后就會產(chǎn)生大量的兩引物之間序列。為了很大限度地減少污染的可能性,調(diào)查人員應(yīng)該為試劑制備、聚合酶鏈反應(yīng)和產(chǎn)品分析預(yù)留單獨的房間。

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聚合酶鏈反應(yīng)的常見問題分析與解決方法:擴增產(chǎn)物出現(xiàn)多條帶(雜帶):引物用量偏大,引物的特異性不高。應(yīng)調(diào)換引物或降低引物的使用量。循環(huán)的次數(shù)過多。適當增加模板的量,減少循環(huán)次數(shù)。酶的用量偏高或酶的質(zhì)量不好,應(yīng)降低酶量或調(diào)換另一來源的酶。退火溫度偏低,退火及延伸時間偏長。應(yīng)提高退火溫度,減少變性與延伸時間,也可采用二種溫度的PCR擴增。以2度為梯度設(shè)計梯度PCR反應(yīng)優(yōu)化退火溫度。 樣品處理不當。Mg2+濃度偏高,因適當調(diào)整Mg2+使用濃度。若為PCR試劑盒,也可能時試劑盒本身質(zhì)量有問題。復(fù)制提前終止。使用非熱啟動的聚合酶時常有發(fā)生。冰上準備反應(yīng)體系或采用熱啟動聚合酶。電子聚合酶鏈反應(yīng)用于計算理論聚合酶鏈反應(yīng)結(jié)果。連云港血液熒光PCR

PCR反應(yīng)的特異性決定因素為:引物與模板DNA特異正確的結(jié)合。南京血液定量PCR原理及步驟

序列標簽站點是一個過程,其中PCR被用作基因組的特定片段存在于特定克隆中的指示物。人類基因組計劃發(fā)現(xiàn)這一應(yīng)用對于繪制他們測序的粘粒克隆以及協(xié)調(diào)不同實驗室的結(jié)果至關(guān)重要。聚合酶鏈反應(yīng)的一個令人興奮的應(yīng)用是對來自遠古來源的DNA進行系統(tǒng)進化分析,例如在尼安德特人的復(fù)原骨骼中、從猛犸的冷凍組織中或從埃及木乃伊的大腦中發(fā)現(xiàn)的DNA已經(jīng)被放大和測序。]在某些情況下,這些來源的高度降解的DNA可能在擴增的早期階段重新組裝。聚合酶鏈反應(yīng)的一個常見應(yīng)用是對以下基因表達模式的研究。組織(甚至單個細胞)可以在不同階段進行分析,以了解哪些基因變得活躍,哪些基因被關(guān)閉。該應(yīng)用還可以使用定量聚合酶鏈反應(yīng)來定量表達的實際水平。南京血液定量PCR原理及步驟

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