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連云港微量定量PCR研究方案

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-01-17

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的常見問題:出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增帶:PCR擴(kuò)增后出現(xiàn)的條帶與預(yù)計(jì)的大小不一致,或大或小,或者同時(shí)出現(xiàn)特異性擴(kuò)增帶 與非特異性擴(kuò)增帶。非特異性條帶的出現(xiàn),其原因:一是引物與靶序列不完全互補(bǔ)、或引物聚合形成二聚體。二是Mg2+離子濃度過高、退火溫度過低,及PCR循環(huán)次數(shù)過多有關(guān)。其次是酶的質(zhì)和量,往往一些來源的酶易出現(xiàn)非特異條帶而另一來源的酶則不出現(xiàn),酶量過多有時(shí)也會(huì)出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增。其對(duì)策有:必要時(shí)重新設(shè)計(jì)引 物。減低酶量或調(diào)換另一來源的酶。降低引物量,適當(dāng)增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。適當(dāng)提高退火溫度或采用二溫度點(diǎn)法(93℃變性,65℃左右退火與延伸)。序列間特異性聚合酶鏈反應(yīng)放大簡(jiǎn)單重復(fù)序列之間的區(qū)域,以產(chǎn)生擴(kuò)增片段長(zhǎng)度的獨(dú)特指紋。連云港微量定量PCR研究方案

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聚合酶鏈反應(yīng)的常見問題分析與解決方法:MgCl2濃度過高??蛇m當(dāng)降低其用量。模板量過多。質(zhì)粒DNA的用量應(yīng)<50 ng,而基因組DNA則應(yīng)<200 ng。引物濃度不夠優(yōu)化。對(duì)引物進(jìn)行梯度稀釋重復(fù)PCR反應(yīng)。循環(huán)次數(shù)過多;增加模板量減少循環(huán)次數(shù)至30,縮短退火時(shí)間及延伸時(shí)間,或改用二種溫度的PCR循環(huán)。退火溫度過低。電泳體系有問題:凝膠中緩沖液和電泳緩沖液濃度相差太大;凝膠沒有凝固好;瓊脂糖質(zhì)量差。若為PCR試劑盒則可能:由于運(yùn)輸儲(chǔ)存不當(dāng)引起試劑盒失效;試劑盒本身質(zhì)量有問題,如引物選擇、循環(huán)參數(shù)等選擇不當(dāng)。降解的陳舊模板擴(kuò)增也易產(chǎn)生涂布。連云港微量定量PCR研究方案聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)可看作是生物體外的特殊DNA復(fù)制。

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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的特點(diǎn):特異性強(qiáng),PCR反應(yīng)的特異性決定因素為:引物與模板DNA特異正確的結(jié)合;堿基配對(duì)原則;Taq DNA聚合酶合成反應(yīng)的忠實(shí)性;靶基因的特異性與保守性。其中引物與模板的正確結(jié)合是關(guān)鍵。引物與模板的結(jié)合及引物鏈的延伸是遵循堿基配對(duì)原則的。聚合酶合成反應(yīng)的忠實(shí)性及TaqDNA聚合酶耐高溫性,使反應(yīng)中模板與引物的結(jié)合(復(fù)性)可以在較高的溫度下進(jìn)行,結(jié)合的特異性增加,被擴(kuò)增的靶基因片段也就能保持很高的正確度。再通過選擇特異性和保守性高的靶基因區(qū),其特異性程度就更高。

聚合酶鏈反應(yīng):在檢測(cè)病原體方面,病原體培養(yǎng)是臨床診斷的金標(biāo)準(zhǔn) .但是對(duì)于一些苛養(yǎng)菌 生長(zhǎng)緩慢的細(xì)菌或難以培養(yǎng)的病原體等培養(yǎng)的陽性檢出率不高.檢測(cè)時(shí)間過長(zhǎng) 無法滿足臨床早期快速診斷以指導(dǎo)醫(yī)治的需要[3]。當(dāng)前 PCR 技術(shù)是在傳統(tǒng) PCR 技術(shù)應(yīng)用的基礎(chǔ)上進(jìn)行的改進(jìn),包括實(shí)時(shí)定量 PCR 技術(shù) 、 實(shí)時(shí)熒光定量PCR、 PCR-酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn) 、 巢式PCR等。 在PCR技術(shù)的輔助作用下,實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)也逐漸從生化免疫診斷過渡到基因診斷,生化免疫檢測(cè)主要從表型表現(xiàn)評(píng)估病癥,而基因診斷則深入本質(zhì)探究其病因,以PCR 技術(shù)為主的核酸技術(shù)在臨床實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)與疾病診斷中表現(xiàn)出了明顯的應(yīng)用價(jià)值,在未來的臨床醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中必將會(huì)得到更加較廣的應(yīng)用。熱啟動(dòng)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):一種在PCR的初始建立階段減少非特異性擴(kuò)增的技術(shù)。

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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):三步:變性:模板DNA加熱變性;復(fù)性,引物與它的靶序列發(fā)生退火,引物DNA量多,使引物和模板在局部形成雜交鏈;延伸,4種dNTP 與 Mg2+ 存在的條件下,DNA合成酶催化以引物為起始點(diǎn),按5'-3'方向進(jìn)行延伸。上面三步為一個(gè)循環(huán),可使拷貝數(shù)到達(dá)2*E-6-2*E-7。PCR產(chǎn)物一段雙鏈DNA,是由它的末端引物的5’端決定的。首輪擴(kuò)增,其產(chǎn)物是大小不均一的DNA分子。長(zhǎng)度應(yīng)大于兩引物之間的長(zhǎng)度。在第二個(gè)循環(huán)中,由于5'固定,其產(chǎn)物長(zhǎng)度就由等于兩引物之間的長(zhǎng)度。所以幾十個(gè)循環(huán)后就會(huì)產(chǎn)生大量的兩引物之間序列。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)準(zhǔn)備:PCR所用的酶主要有兩種來源:Taq和Pfu,分別來自兩種不同的噬熱菌。上海微量熒光PCR設(shè)計(jì)公司

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)中兩個(gè)引物之間不應(yīng)存在互補(bǔ)序列,尤其是避免3 ′端的互補(bǔ)重疊。連云港微量定量PCR研究方案

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)是一種用于放大擴(kuò)增特定的DN段的分子生物學(xué)技術(shù),它可看作是生物體外的特殊DNA復(fù)制,PCR的很大特點(diǎn)是能將微量的DNA大幅增加。因此,無論是化石中的古生物、歷史人物的殘骸,還是幾十年前兇殺案中兇手所遺留的毛發(fā)、皮膚或血液,只要能分離出一丁點(diǎn)的DNA,就能用PCR加以放大,進(jìn)行比對(duì)。這也是“微量證據(jù)”的威力之所在。由1983年美國首先提出設(shè)想,1985年由其發(fā)明了聚合酶鏈反應(yīng),即簡(jiǎn)易DNA擴(kuò)增法,意味著PCR技術(shù)的真正誕生。到2013年,PCR已發(fā)展到第三代技術(shù)。連云港微量定量PCR研究方案

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