冷凍電鏡技術工作流程:做好前面的工作就需要設定較佳的參數(比如:欠焦值、放大倍數和電子劑量等),記錄這些樣品區(qū)域的大量圖像,用手工或半自動程序框取那些離散的分子形成的投影圖。然后就是三維結構搭建。由于電子可能對非常敏感的樣品造成輻射損傷,所以單顆粒冷凍電鏡只能采用非常低的電子量,而這種電鏡2D投影圖像有非常大的背景噪聲。為提高圖像分辨率,研究人員首先需要提出一個初始的3D模型,然后對捕獲的單顆粒2D圖像進行分選。冷凍電鏡技術能夠揭示生物分子細節(jié)。莆田透射電子顯微鏡技術服務中心
冷凍電鏡技術解析結構主要風險在:A.樣品很不穩(wěn)定,樣品寄送過來的時候,已經降解或者聚集,無法進行后續(xù)處理;B.樣品在冷凍制樣的過程中,可能會被凍碎,從而無法進行后續(xù)處理;C.樣品純度可能很好,但是均一度很差,從而難以獲得樣品的高分辨結構;D.我們關心的區(qū)域可能在整個復合體中有很強的柔性,從而經過二維或者三維平均后,我們關心區(qū)域的分辨率會比較差甚至看不見,達不到我們的預期;E.一些配體,比如藥物前體分子,分子量太小,不一定能在電鏡的密度圖中觀測到;F.對于合適的樣品,我們冷凍制樣需要優(yōu)化的參數有很多,包括樣品濃度的優(yōu)化,blottime的優(yōu)化,溫度的優(yōu)化,grid規(guī)格(銅網或者金網)的優(yōu)化等一系列條件的優(yōu)化。因此冷凍電鏡制樣需要豐富的經驗和充足的機時支持,不同的實驗者,成功率可能差別很大。荊州低溫電子顯微鏡技術哪里有將冷凍樣品保持低溫放置在透射電子顯微鏡下觀察,從而獲得生物大分子的結構,被稱為冷凍電鏡技術。
冷凍電子顯微技術學解析生物大分子及細胞結構的中心是透射電子顯微鏡成像,包括樣品制備、圖像采集、圖像處理及三維重構等幾個基本步驟。三維重構:數據處理的較終目的是為了獲得生物樣品的三維質量密度圖,由二維圖像推知三維結構的方法即三維重構。其理論原理是在1968年由DeRosier和Klug提出的中心截面定理:一個函數沿某方向投影函數的傅里葉變換等于此函數的傅里葉變換通過原點且垂直于此投影方向的截面函數。由于樣品性質的不同,圖像分析的方法也有差異。
冷凍電鏡技術原理之電子晶體學:利用電子顯微鏡對生物大分子在一維、二維以致三維空間形成的高度有序重復排列的結構(晶體)成像或者收集衍射圖樣,進而解析這些生物大分子的結構,這種方法稱為電子晶體學。其適合的樣品分子量范圍為10~500kD,Zgao分辨率約0.19nm。該方法與X射線晶體學的類似之處在于均需獲得高度均一的生物大分子的周期性排列,不同之處是利用電子顯微鏡除了可以獲得晶體的電子衍射外還可以通過獲得晶體的圖像來進行結構解析。冷凍電鏡技術之冷凍蝕刻電子顯微鏡優(yōu)點:樣品通過冷凍,可使其微細結構接近于活的狀態(tài)。
冷凍電鏡技術:隨著技術的不斷進步和人類對于生命科學領域知識的不斷積累,藥物研發(fā)越來越走向理性化,包括法規(guī)體系的建立和優(yōu)化、藥品質量控制模式的變遷走向QbD階段。基于結構的藥物設計已經逐漸成為藥物開發(fā)設計的主流,與此同時冷凍電鏡技術也在蓬勃發(fā)展。冷凍電鏡單顆粒分析技術和微晶電子衍射技術不只能解析近原子分辨率的結構,而且能解析傳統(tǒng)結構生物學無法解析的結構,幫助確認藥物靶點,拓展可用藥物靶點的研究范圍和完善基于靶點結構的藥物設計。冷凍電子斷層掃描技術在不久的未來可能提供細胞原位觀察藥物與靶點的作用。冷凍電鏡技術的獨特優(yōu)勢:適合于研究結構不規(guī)則的大分子復合物,對于分子量的上限沒有限制。黃石透射電鏡技術
冷凍電鏡技術也正在成為助力醫(yī)藥研發(fā)的有力手段。莆田透射電子顯微鏡技術服務中心
冷凍電鏡技術之冷凍蝕刻電子顯微鏡:冷凍蝕刻電鏡技術是從50年代開始發(fā)展起來的一種將斷裂和復型相結合的制備透射電鏡樣品技術,亦稱冷凍斷裂或冷凍復型,用于細胞生物學等領域的顯微結構研究。冷凍蝕刻電鏡的優(yōu)點:①樣品通過冷凍,可使其微細結構接近于活的狀態(tài);②樣品經冷凍斷裂蝕刻后,能夠觀察到不同劈裂面的微細結構,進而可研究細胞內的膜性結構及內含物結構;③冷凍蝕刻的樣品,經鉑、碳噴鍍而制備的復型膜,具有很強的立體感且能耐受電子束轟擊和長期保存。莆田透射電子顯微鏡技術服務中心