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深圳微量定量PCR原理

來源: 發(fā)布時間:2023-06-30

Real-time PCR實驗注意事項-防止RNA酶污染的措施:1.所有的玻璃器皿均應(yīng)在使用前于180℃的高溫下干烤6hr或更長時間。2.塑料器皿可用0.1%DEPC水浸泡或用氯仿沖洗(注意:有機玻璃器具因可被氯仿腐蝕,故不能使用)。3.有機玻璃的電泳槽等,可先用去污劑洗滌,雙蒸水沖洗,乙醇干燥,再浸泡在3%H2O2室溫10min,然后用0.1%DEPC水沖洗,晾干。4.配制的溶液應(yīng)盡可能的用0.1%DEPC,在37℃處理12hr以上。然后用高壓滅菌除去殘留的DEPC。不能高壓滅菌的試劑,應(yīng)當(dāng)用DEPC處理過的無菌雙蒸水配制,然后經(jīng)0.22μm濾膜過濾除菌。5.操作人員戴一次性口罩、帽子、手套,實驗過程中手套要勤換。6.設(shè)置RNA操作專業(yè)使用實驗室,所有器械等應(yīng)為專業(yè)使用。聚合酶鏈反應(yīng)允許快速生產(chǎn)短DN段,即使已知的引物序列不超過兩個。深圳微量定量PCR原理

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聚合酶鏈式反應(yīng)生物學(xué)研究的歷史中占據(jù)了重要的地位。以此為基礎(chǔ)發(fā)展出包括Real-time PCR在內(nèi)的多項應(yīng)用技術(shù)。自誕生后Real-time PCR技術(shù)持續(xù)發(fā)展,從簡單的增擴到整個PCR過程,Real-time PCR表現(xiàn)出比PCR更敏感、更明確的定量分析特性和對識別等位基因的能力。不少人以為real-time就是意味著可以在顯示器上看到每個循環(huán)增擴曲線的增長。事實并非如此,早期的軟件不能在運行期間提供可視化的增擴曲線。主要是因為SDS軟件采用整個平臺較終的數(shù)據(jù)執(zhí)行數(shù)據(jù)分析工作,而不是分析每個單獨的反應(yīng)循環(huán)。對某些設(shè)備來說,必須向分析軟件提供實時的數(shù)據(jù),有些設(shè)備則不需要。前一種設(shè)備允許軟件實時跟蹤每個加樣口的增擴曲線,同時顯示在電腦屏幕上。廣州實時熒光定量PCR原理Real-time PCR可看作是生物體外的特殊DNA復(fù)制。

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Real-time PCR原理:基于探針的化學(xué)法,Real-time PCR應(yīng)用一個或多個熒光標記的寡核苷酸探針檢測PCR擴增產(chǎn)物;依賴熒光能量共振傳遞(FRET)檢測特異性擴增產(chǎn)物,單單檢測特異性擴增產(chǎn)物,DNA及RNA定量;基因表達驗證;等位基因鑒別;SNP分型;病原體和病毒檢測;多重PCR,探針和目標片段的特異性結(jié)合產(chǎn)生熒光信號,因此減少了背景熒光和假陽性;探針可標記不同波長的熒光基團,用于多重PCR反應(yīng)。對于不同的靶序列需要合成不同的探針,原料成本較高。

引物的設(shè)計對于這個實驗至關(guān)重要,因為Real-time PCR的檢測靈敏度比較高,所以相應(yīng)的對引物設(shè)計的要求就很高。普通的要求規(guī)則大家都知道,還有幾點必須注意:1,引物的錯配率(引物錯配形成引物二聚體,但是SYBR照樣能嵌入進去,結(jié)果導(dǎo)致實驗結(jié)果的誤差很大,重復(fù)性也不好)。2,引物的特異性一定要高(不像常規(guī)PCR,引物同源性不高,只要兩條產(chǎn)物的片段長度相差足夠大,在電泳的時候能夠區(qū)分開就可以。Real-time PCR只有在熔解曲線的時候能分開,所以這就造成整個實驗結(jié)果誤差很大,不可信)。PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的螢光探針。

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內(nèi)標在傳統(tǒng)定量中的作用,由于傳統(tǒng)定量方法都是終點檢測,即PCR到達平臺期后進行檢測,而PCR經(jīng)過對數(shù)期擴增到達平臺期時,檢測重現(xiàn)性極差。同一個模板在96孔PCR儀上做96次重復(fù)實驗,所得結(jié)果有很大差異,因此無法直接從終點產(chǎn)物量推算出起始模板量。加入內(nèi)標后,可部分消除終產(chǎn)物定量所造成的不準確性。但即使如此,傳統(tǒng)的定量方法也都只能算作半定量、粗略定量的方法。內(nèi)標對定量PCR的影響,若在待測樣品中加入已知起始拷貝數(shù)的內(nèi)標,則PCR反應(yīng)變?yōu)殡p重PCR,雙重PCR反應(yīng)中存在兩種模板之間的干擾和競爭,尤其當(dāng)兩種模板的起始拷貝數(shù)相差比較大時,這種競爭會表現(xiàn)得更為明顯。但由于待測樣品的起始拷貝數(shù)是未知的,所以無法加入合適數(shù)量的已知模板作為內(nèi)標。也正是這個原因,傳統(tǒng)定量方法雖然加入內(nèi)標,但仍然只是一種半定量的方法。所謂實時熒光定量PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團。廣州實時熒光定量PCR原理

擴增后用內(nèi)切酶消化PCR產(chǎn)物,競爭性模板的產(chǎn)物被酶解為兩個片段。深圳微量定量PCR原理

Real-time PCR-傳統(tǒng)定量PCR:擴增后用內(nèi)切酶消化PCR產(chǎn)物,競爭性模板的產(chǎn)物被酶解為兩個片段,而待測模板不被酶切,可通過電泳或高效液相將兩種產(chǎn)物分開,分別測定熒光強度,根據(jù)已知模板推測未知模板的起始拷貝數(shù)。PCR-ELISA法:利用地高辛或生物素等標記引物,擴增產(chǎn)物被固相板上特異的探針所結(jié)合,再加入抗地高辛或生物素酶標抗體-辣根過氧化物酶結(jié)合物,之后酶使底物顯色。常規(guī)的PCR-ELISA法只是定性實驗,若加入內(nèi)標,作出標準曲線,也可實現(xiàn)定量檢測目的。深圳微量定量PCR原理

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