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深圳特殊樣本PCR檢測技術(shù)方案

來源: 發(fā)布時(shí)間:2023-02-23

Real-time PCR:使用Real-time PCR進(jìn)行基因檢測,被普遍應(yīng)用于病毒和病原菌檢測、轉(zhuǎn)基因食品檢測、遺傳病基因檢測等領(lǐng)域。一般首先需要利用專業(yè)使用的試劑盒從待檢樣品中提取其核酸(DNAorRNA),并經(jīng)過精制等復(fù)雜的操作(通常稱為前處理操作)之后才可以進(jìn)行Real-time PCR。不易受反應(yīng)阻害物的影響,使用時(shí)不需要進(jìn)行復(fù)雜的前處理操作,單單需將待檢樣品直接加入到檢測試劑中即可開始檢測。通過使用本產(chǎn)品,可以在更短的時(shí)間內(nèi),簡便、低成本地進(jìn)行Real-time PCR檢測。Real-time PCR的基本目標(biāo)是精確測量和鑒別非常微量的特異性核酸。深圳特殊樣本PCR檢測技術(shù)方案

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Real-time PCR:基線(baseline):通常是3-15個(gè)循環(huán)的熒光信號,同一次反應(yīng)中針對不同的基因需單獨(dú)設(shè)置基線。閾值(threshold):自動設(shè)置是3-15個(gè)循環(huán)的熒光信號的標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍。手動設(shè)置:置于指數(shù)擴(kuò)增期,剛好可以清楚地看到熒光信號明顯增強(qiáng)。同一次反應(yīng)中針對不同的基因可單獨(dú)設(shè)置閾值,但對于同一個(gè)基因擴(kuò)增一定要用同一個(gè)閾值。Ct值:與起始濃度的對數(shù)成線性關(guān)系,分析定量時(shí)候一般取Ct:15-35.太大或者太小都會導(dǎo)致定量的不準(zhǔn)確。相對定量:通過與內(nèi)參基因Ct值之間的相差來計(jì)算基因之間的表達(dá)差異,一般是2-△△Ct。或者是考慮擴(kuò)增效率的Pfaffl法。常州血液熒光PCR服務(wù)聚合酶鏈反應(yīng)非常敏感,有可能產(chǎn)生數(shù)百萬到數(shù)十億份特定產(chǎn)品的拷貝,用于測序、克隆和分析。

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Real-time PCR的染料法和探針法的選擇:進(jìn)行mRNA表達(dá)量的測定,采用染料法是比較經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的;染料法可以通過比較熔解曲線的熔解峰位置得到產(chǎn)物特異性的情況;目的基因和內(nèi)參基因分管檢測,染料法可以選用Realtime染料PCRPreMIX,探針法主要應(yīng)用于病毒RNA的檢測;以及單位點(diǎn)突變(SNP);多基因的合并檢測,探針法還可用于同一個(gè)反應(yīng)中同時(shí)檢測目的基因和內(nèi)參基因的情況;而染料法則必須分管檢測。Real-time PCR:實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)(Real-timequantitativePolymeraseChainReaction簡稱Real-time PCR)是在定性PCR技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的核酸定量技術(shù)。實(shí)時(shí)熒光定量在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號積累實(shí)時(shí)監(jiān)測整個(gè)PCR進(jìn)程,使每一個(gè)循環(huán)變得“可見”,之后通過Ct值和標(biāo)準(zhǔn)曲線對樣品中的DNA(orcDNA)的起始濃度進(jìn)行定量的方法。

Real-time PCR探針法適用于:1、具有高適應(yīng)性和可靠性,實(shí)驗(yàn)結(jié)果穩(wěn)定重複性好,特異性更高。2、適用于擴(kuò)增序列專一的體系的檢測。3、樣品中靶基因含量過低的定量PCR檢測。4、靶基因的特異序列較短,無論怎樣較佳化引物設(shè)計(jì)條件都不能解決。5、存在與靶基因同源的序列,在PCR中容易出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增,對特異性要求較高的定量。6、普遍用于人類傳染病的診斷和病原定量,在動物病原體基因的檢測,畜禽產(chǎn)品的檢驗(yàn)檢疫,生物製品的鑒定。Real-time PCR探針法:PCR擴(kuò)增時(shí)在加入一對引物的同時(shí)加入一個(gè)特異性的螢光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告螢光基團(tuán)和一個(gè)淬滅螢光基團(tuán)。探針完整時(shí),報(bào)告基團(tuán)發(fā)射的螢光信號被淬滅基團(tuán)吸收;PCR擴(kuò)增時(shí),Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解,使報(bào)告螢光基團(tuán)和淬滅螢光基團(tuán)分離,從而螢光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到螢光信號,即每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個(gè)螢光分子形成,實(shí)現(xiàn)了螢光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步。通過使用本產(chǎn)品,可以在更短的時(shí)間內(nèi),簡便、低成本地進(jìn)行Real-time PCR檢測。

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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):因?yàn)镻CR擴(kuò)增了目的DNA區(qū)域,所以PCR可以用于分析極少量的樣品。這對于法醫(yī)檢定法,當(dāng)時(shí)只有微量的DNA可作為證據(jù)。聚合酶鏈反應(yīng)也可用于分析古代DNA那已經(jīng)有數(shù)萬年的歷史了。這些基于聚合酶鏈反應(yīng)的技術(shù)已經(jīng)成功地應(yīng)用于動物身上,例如四萬年前猛犸,以及人類DNA,定量聚合酶鏈反應(yīng)或者實(shí)時(shí)聚合酶鏈反應(yīng)不要與逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)方法混淆)允許估計(jì)樣品中存在的給定序列的量——這種技術(shù)通常用于定量確定基因表達(dá)的水平。定量PCR是一種已建立的DNA定量工具,用于測量每輪PCR擴(kuò)增后DNA產(chǎn)物的積累。聚合酶鏈反應(yīng)的試劑應(yīng)分配到一次性的等分試樣中。PCR反應(yīng)的特異性決定因素為:引物與模板DNA特異正確的結(jié)合。深圳特殊樣本PCR檢測技術(shù)方案

序列間特異性聚合酶鏈反應(yīng)放大簡單重復(fù)序列之間的區(qū)域,以產(chǎn)生擴(kuò)增片段長度的獨(dú)特指紋。深圳特殊樣本PCR檢測技術(shù)方案

所謂real-timeQ-PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基因,利用熒光信號累積實(shí)時(shí)監(jiān)測整個(gè)PCR進(jìn)程,之后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進(jìn)行定量分析的方法。在real-time技術(shù)的發(fā)展過程中,兩個(gè)重要的發(fā)現(xiàn)起著關(guān)鍵的作用:(1)TaqDNA多聚酶的5′核酸外切酶活性的發(fā)現(xiàn),它能降解特異性熒光記探針,因此使得間接的檢測PCR產(chǎn)物成為可能。(2)此后熒光雙標(biāo)記探針的運(yùn)用使在一密閉的反應(yīng)管中能實(shí)時(shí)地監(jiān)測反應(yīng)全過程。這兩個(gè)發(fā)現(xiàn)的結(jié)合以及相應(yīng)的儀器和試劑的商品化發(fā)展導(dǎo)致real-timeQ-PCR方法在研究工作中的運(yùn)用。深圳特殊樣本PCR檢測技術(shù)方案

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