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蘇州細胞PCR檢測技術原理及步驟

來源: 發(fā)布時間:2023-02-14

Real-time PCR鏈反應的常見問題分析與解決方法:反應緩沖液未完全融化或未充分混勻。確保反應緩沖液融化完全并徹底混勻。引物特異性差。利用BLAST檢查引物特異性或重新設計引物。引物量過多。減少反應體系中引物的用量。模板量過多。質粒DNA的用量應<50ng,而基因組DNA則應<200ng。外源DNA污染。確保操作的潔凈。陰性對照出現(xiàn)條帶:試劑,頭,工作臺污染。使用全新的試劑和頭,對工作臺進行清潔。條帶大小與理論不符:污染。使用全新的試劑和頭,對工作臺進行清潔。模板或引物使用錯誤。更換引物和模板?;騺喰?。對研究的基因進行序列分析和BLAST研究。逆轉錄-聚合酶鏈反應較廣用于表達譜,以確定基因的表達或鑒定RNA轉錄物的序列。實時熒光定量PCR是目前確定樣品中DNA(或cDNA)拷貝數(shù)較敏感、較準確的方法。蘇州細胞PCR檢測技術原理及步驟

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聚合酶鏈反應注意事項:在實驗過程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在總RNA的提取過程中,注意避免mRNA的斷裂;為了防止非特異性擴增,必須設陰性對照;內(nèi)參的設定主要為了用于靶RNA的定量。常用的內(nèi)參有G3PD(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)、β-Actin(β-肌動蛋白)等。其目的在于避免RNA定量誤差、加樣誤差以及各PCR反應體系中擴增效率不均一各孔間的溫度差等所造成的誤差;PCR不能進入平臺期,出現(xiàn)平臺效應與所擴增的目的基因的長度、序列、二級結構以及目標DNA起始的數(shù)量有關。故對于每一個目標序列出現(xiàn)平臺效應的循環(huán)數(shù),均應通過單獨實驗來確定;防止DNA的污染:采用DNA酶處理RNA;在可能的情況下,將PCR引物置于基因的不同外顯子,以消除基因和mRNA的共線性。聚合酶鏈反應可以選擇這些突變來理解蛋白質是如何完成其功能的,并改變或改善蛋白質功能。廈門組織RT-PCR檢測技術技術服務聚合酶鏈式反應是80年代中期發(fā)展起來的體外核酸擴增技術。

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Real-time PCR原理:基于探針的化學法,Real-time PCR應用一個或多個熒光標記的寡核苷酸探針檢測PCR擴增產(chǎn)物;依賴熒光能量共振傳遞(FRET)檢測特異性擴增產(chǎn)物,單單檢測特異性擴增產(chǎn)物,DNA及RNA定量;基因表達驗證;等位基因鑒別;SNP分型;病原體和病毒檢測;多重PCR,探針和目標片段的特異性結合產(chǎn)生熒光信號,因此減少了背景熒光和假陽性;探針可標記不同波長的熒光基團,用于多重PCR反應。對于不同的靶序列需要合成不同的探針,原料成本較高。

引物的設計對于這個實驗至關重要,因為Real-time PCR的檢測靈敏度比較高,所以相應的對引物設計的要求就很高。普通的要求規(guī)則大家都知道,還有幾點必須注意:1,引物的錯配率(引物錯配形成引物二聚體,但是SYBR照樣能嵌入進去,結果導致實驗結果的誤差很大,重復性也不好)。2,引物的特異性一定要高(不像常規(guī)PCR,引物同源性不高,只要兩條產(chǎn)物的片段長度相差足夠大,在電泳的時候能夠區(qū)分開就可以。Real-time PCR只有在熔解曲線的時候能分開,所以這就造成整個實驗結果誤差很大,不可信)。聚合酶鏈反應的試劑應分配到一次性的等分試樣中。

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Real-time PCR鏈反應:嵌套聚合酶鏈反應:通過減少DNA非特異性擴增的背景,提高DNA擴增的特異性。兩組引物用于兩個連續(xù)的PCR。在個反應中,一對引物用于產(chǎn)生DNA產(chǎn)物,除了預期的靶之外,該產(chǎn)物可能仍然由非特異性擴增的DN段組成。然后用一組引物將產(chǎn)物用于第二次聚合酶鏈反應,所述引物的結合位點完全或部分不同于次反應中使用的每個引物,并且位于其中的3’。嵌套式PCR在特異性擴增長DN段方面通常比傳統(tǒng)PCR更成功,但它需要更詳細的目標序列知識。重疊延伸聚合酶鏈反應或者通過重疊延伸拼接(SOEing):一種用于將兩個或多個含有互補序列的DN段拼接在一起的基因工程技術。它用于連接含有基因、調(diào)節(jié)序列或突變的DN段;這項技術可以創(chuàng)造特定的長DNA構建體。它還可以將缺失、插入或點突變引入DNA序列。如果基因的基因組DNA序列是已知的,逆轉錄-聚合酶鏈反應可以用來繪制基因中外顯子和內(nèi)含子的位置。廈門組織RT-PCR檢測技術技術服務

Real-time PCR在實驗內(nèi)參的設定主要為了用于靶RNA的定量。蘇州細胞PCR檢測技術原理及步驟

Real-time PCR的染料法和探針法的選擇:進行mRNA表達量的測定,采用染料法是比較經(jīng)濟實惠的;染料法可以通過比較熔解曲線的熔解峰位置得到產(chǎn)物特異性的情況;目的基因和內(nèi)參基因分管檢測,染料法可以選用Realtime染料PCRPreMIX,探針法主要應用于病毒RNA的檢測;以及單位點突變(SNP);多基因的合并檢測,探針法還可用于同一個反應中同時檢測目的基因和內(nèi)參基因的情況;而染料法則必須分管檢測。Real-time PCR:實時熒光定量PCR技術(Real-timequantitativePolymeraseChainReaction簡稱Real-time PCR)是在定性PCR技術基礎上發(fā)展起來的核酸定量技術。實時熒光定量在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進程,使每一個循環(huán)變得“可見”,之后通過Ct值和標準曲線對樣品中的DNA(orcDNA)的起始濃度進行定量的方法。蘇州細胞PCR檢測技術原理及步驟

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