Real-time PCR式反應準備:10×擴增緩沖液、4種dNTP混合物(終濃度)、引物(終濃度)、模板DNA、TaqDNA聚合酶、Mg2+(終濃度)、補加雙蒸水等。其中dNTP、引物、模板DNA、TaqDNA聚合酶以及Mg2+的加量(或濃度)可根據(jù)實驗調整,以上表格只提供大致參考值。PCR反應五要素:參加PCR反應的物質主要有五種即:引物(PCR引物為DN段,細胞內(nèi)DNA復制的引物為一段RNA鏈)、酶、dNTP、模板和緩沖液(其中需要Mg2+)。引物有多種設計方法,由PCR在實驗中的目的決定,但基本原則相同。Real-time PCR探針法實驗結果穩(wěn)定重複性好,特異性更高。珠海實時熒光定量PCR服務
Real-time PCR反應:多重連接依賴探針擴增(MLPA):允許用單個引物對擴增多個靶標,從而避免多重PCR的分辨率限制。多重聚合酶鏈反應:由單個PCR混合物中的多個引物組組成,以產(chǎn)生對不同DNA序列特異的不同大小的擴增子。通過同時靶向多個基因,可以從單次測試中獲得額外的信息,否則將需要幾次試劑和更多時間來執(zhí)行。每個引物組的退火溫度必須優(yōu)化,以在單個反應中正確工作,并符合擴增子尺寸。也就是說,當通過凝膠電泳可視化時,它們的堿基對長度應該足夠不同以形成不同的條帶。珠海微量熒光PCR服務PCR反應的很大特點是具有較大擴增能力與極高的靈敏性。
引物的設計對于這個實驗至關重要,因為Real-time PCR的檢測靈敏度比較高,所以相應的對引物設計的要求就很高。普通的要求規(guī)則大家都知道,還有幾點必須注意:1,引物的錯配率(引物錯配形成引物二聚體,但是SYBR照樣能嵌入進去,結果導致實驗結果的誤差很大,重復性也不好)。2,引物的特異性一定要高(不像常規(guī)PCR,引物同源性不高,只要兩條產(chǎn)物的片段長度相差足夠大,在電泳的時候能夠區(qū)分開就可以。Real-time PCR只有在熔解曲線的時候能分開,所以這就造成整個實驗結果誤差很大,不可信)。
Real-time PCR:所謂Real-time PCR技術,是指在PCR反應體系中加入螢光基團,利用螢光信號累積實時監(jiān)測整個PCR進程,之后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。利用螢光信號的變化實時檢測PCR擴增反應中每一個循環(huán)擴增產(chǎn)物量的變化,通過Ct值和標準曲線的分析對起始模板進行定量分析。Real-time PCR技術即實時螢光定量PCR避免了傳統(tǒng)PCR以終產(chǎn)物監(jiān)測定量產(chǎn)生的偏差,提高實驗的重複性。該技術已經(jīng)被普遍用于監(jiān)測細胞mRNA表達量的變化;比較不同組織的mRNA表達差異;驗證基因晶片,siRNA干擾的實驗結果。Real-time PCR探針法適用于擴增序列專一的體系的檢測。
Real-timePCR的反應條件:dNTP濃度過高會加快反應速度,但同時還可以增加堿基的錯誤摻入率。引物濃度過高會引起錯配和非特異性產(chǎn)物擴增。TaqDNA聚合酶濃度過高會引起錯配和非特異性產(chǎn)物擴增,低則合成產(chǎn)物量減少。TaqDNA聚合酶無校正功能,摻入錯誤率達2*E-4個核苷酸,一個30個循環(huán)的擴增反應0.1%-0.25%總錯誤率。在90~95度下可使整個基因組的DNA變性為單鏈。一般94~95度30~60s。時間過長使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結合。引物長度在15~25時退火溫度。PCR由一系列20-40次重復的溫度變化組成,稱為熱循環(huán)?;窗蔡厥鈽颖緮?shù)字PCR
聚合酶鏈式反應(PCR)是一種用于放大擴增特定的DN段的分子生物學技術。珠海實時熒光定量PCR服務
Real-time PCR的染料法和探針法的選擇:進行mRNA表達量的測定,采用染料法是比較經(jīng)濟實惠的;染料法可以通過比較熔解曲線的熔解峰位置得到產(chǎn)物特異性的情況;目的基因和內(nèi)參基因分管檢測,染料法可以選用Realtime染料PCRPreMIX,探針法主要應用于病毒RNA的檢測;以及單位點突變(SNP);多基因的合并檢測,探針法還可用于同一個反應中同時檢測目的基因和內(nèi)參基因的情況;而染料法則必須分管檢測。Real-time PCR:實時熒光定量PCR技術(Real-timequantitativePolymeraseChainReaction簡稱Real-time PCR)是在定性PCR技術基礎上發(fā)展起來的核酸定量技術。實時熒光定量在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進程,使每一個循環(huán)變得“可見”,之后通過Ct值和標準曲線對樣品中的DNA(orcDNA)的起始濃度進行定量的方法。珠海實時熒光定量PCR服務
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