聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的常見問題:Mg2+濃度:Mg2+離子濃度對PCR擴增效率影響很大,濃度過高可降低PCR擴增的特 異性,濃度過低則影響PCR擴增產(chǎn)量甚至使PCR擴增失敗而不出擴增條帶。反應(yīng)體積的改變:通常進(jìn)行PCR擴增采用的體積為20ul、30ul、50ul?;?00ul,應(yīng)用多 大體積進(jìn)行PCR擴增,是根據(jù)科研和臨床檢測不同目的而設(shè)定,在做小體積如20ul 后,再做大體積時,一定要模索條件,否則容易失敗。物理原因:變性對PCR擴增來說相當(dāng)重要,如變性溫度低,變性時間短,極有可能出現(xiàn)假陰性;退火溫度過低,可致非特異性擴增而降低特異性擴增效率退火溫度過高影響引物與模板的結(jié)合而降低PCR擴增效率。有時還有必要用標(biāo)準(zhǔn)的溫度計,檢測一下擴增儀或水溶鍋內(nèi)的變性、退火和延伸溫度,這也是PCR失敗的原因之一。嵌套聚合酶鏈反應(yīng)的兩組引物用于兩個連續(xù)的PCR。珠海特殊樣本定量PCR服務(wù)
聚合酶鏈反應(yīng)的常見問題分析與解決方法:MgCl2濃度過高??蛇m當(dāng)降低其用量。模板量過多。質(zhì)粒DNA的用量應(yīng)<50 ng,而基因組DNA則應(yīng)<200 ng。引物濃度不夠優(yōu)化。對引物進(jìn)行梯度稀釋重復(fù)PCR反應(yīng)。循環(huán)次數(shù)過多;增加模板量減少循環(huán)次數(shù)至30,縮短退火時間及延伸時間,或改用二種溫度的PCR循環(huán)。退火溫度過低。電泳體系有問題:凝膠中緩沖液和電泳緩沖液濃度相差太大;凝膠沒有凝固好;瓊脂糖質(zhì)量差。若為PCR試劑盒則可能:由于運輸儲存不當(dāng)引起試劑盒失效;試劑盒本身質(zhì)量有問題,如引物選擇、循環(huán)參數(shù)等選擇不當(dāng)。降解的陳舊模板擴增也易產(chǎn)生涂布。溫州組織熒光定量PCR技術(shù)服務(wù)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)中要確保反應(yīng)緩沖液融化完全并徹底混勻。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的步驟:標(biāo)準(zhǔn)的PCR過程分為三步:DNA變性:(90℃-96℃):雙鏈DNA模板在熱作用下,氫鍵斷裂,形成單鏈DNA;退火:(60℃-65℃):系統(tǒng)溫度降低,引物與DNA模板結(jié)合,形成局部雙鏈。延伸:(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性很好)的作用下,以dNTP為原料,從引物的3′端開始以從5′→3′端的方向延伸,合成與模板互補的DNA鏈。每一循環(huán)經(jīng)過變性、退火和延伸,DNA含量即增加一倍?,F(xiàn)在有些PCR因為擴增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時間內(nèi)復(fù)制完成,因此可以改為兩步法,即退火和延伸同時在60℃-65℃間進(jìn)行。
現(xiàn)在有些PCR因為擴增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時間內(nèi)復(fù)制完成,因此可以改為兩步法,即退火和延伸同時在60℃-65℃間進(jìn)行,以減少一次升降溫過程,提高了反應(yīng)速度。檢測:PCR反應(yīng)擴增出了高的拷貝數(shù),下一步檢測就成了關(guān)鍵。熒光素(溴化乙錠,EB)染色凝膠電泳是很常用的檢測手段。電泳法檢測特異性是不太高的,因此引物兩聚體等非特異性的雜交體很容易引起誤判。但因為其簡捷易行,成為了主流檢測方法。近年來以熒光探針為的檢測方法,有逐漸取代電泳法的趨勢。重疊延伸聚合酶鏈反應(yīng):一種用于將兩個或多個含有互補序列的DN段拼接在一起的基因工程技術(shù)。
聚合酶鏈反應(yīng)也可以用作以下敏感試驗的一部分組織分型,對移植至關(guān)重要。截至2008年,甚至有人提議用聚合酶鏈反應(yīng)檢測取代傳統(tǒng)的血型抗體檢測。許多形式的病癥涉及致病基因的改變。通過使用基于聚合酶鏈反應(yīng)的測試來研究這些突變,醫(yī)治方案有時可以根據(jù)患者的不同而不同。聚合酶鏈反應(yīng)可以早期診斷惡性疾病,如白血病和淋巴瘤,這是目前病癥研究中發(fā)展很快的,并且已經(jīng)被常規(guī)使用。PCR檢測可以直接在基因組DNA樣品上進(jìn)行,以檢測易位特異性惡性細(xì)胞,其靈敏度至少是其他方法的10,000倍。聚合酶鏈反應(yīng)在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域非常有用,因為它允許分離和擴增病癥抑制劑。例如,定量PCR可以用于量化和分析單細(xì)胞,以及識別DNA、mRNA和蛋白質(zhì)的確認(rèn)和組合。逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)較廣用于表達(dá)譜,以確定基因的表達(dá)或鑒定RNA轉(zhuǎn)錄物的序列。珠海特殊樣本定量PCR服務(wù)
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的模板的取材主要依據(jù)PCR的擴增對象,可以是病原體標(biāo)本如病毒、細(xì)菌、菌類等。珠海特殊樣本定量PCR服務(wù)
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):RNA和DNA的五碳糖,前者比后者多了一個O,由于多出來的O原子造成了RNA和DNA的堿基不同,即O原子造成U和T的不同,U分子化學(xué)式C4H4N2O2,T胸腺嘧啶化學(xué)式C5H6N2O2,現(xiàn)在將兩個分子式進(jìn)行對比,U比T多了CH2,結(jié)合前面的核糖區(qū)別,還有一個O分子,其余結(jié)構(gòu)相同,那么O和CH2之間的聯(lián)系是什么?是什么導(dǎo)致DNA和RNA的區(qū)別是RNA比DNA多了O和CH2?或者說如何將病毒的堿基中U變成DNA堿基中的T?若從結(jié)構(gòu)上說,直接從U中加入一個CH2,得到了T,這里面介入化學(xué)鍵的斷裂和重組,但是這樣一來的話,即使U變成了T,但是核糖依舊是RNA比DNA多了一個O分子,只是此時結(jié)構(gòu)是某分子=核糖(C4H9O4CHO)+堿基(A T G C),形成了RNA的五碳糖+DNA的堿基這種分子了。此時將這種分子導(dǎo)入受體細(xì)胞(亦或者蛋白質(zhì))中,表達(dá)的性質(zhì)一定不同于病毒表達(dá)的性質(zhì)。珠海特殊樣本定量PCR服務(wù)
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