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寧波組織數(shù)字PCR

來源: 發(fā)布時間:2022-03-01

聚合酶鏈式反應(yīng):三步:變性:模板DNA加熱變性;復(fù)性,引物與它的靶序列發(fā)生退火,引物DNA量多,使引物和模板在局部形成雜交鏈;延伸,4種dNTP 與 Mg2+ 存在的條件下,DNA合成酶催化以引物為起始點,按5'-3'方向進行延伸。上面三步為一個循環(huán),可使拷貝數(shù)到達2*E-6-2*E-7。PCR產(chǎn)物一段雙鏈DNA,是由它的末端引物的5’端決定的。首輪擴增,其產(chǎn)物是大小不均一的DNA分子。長度應(yīng)大于兩引物之間的長度。在第二個循環(huán)中,由于5'固定,其產(chǎn)物長度就由等于兩引物之間的長度。所以幾十個循環(huán)后就會產(chǎn)生大量的兩引物之間序列。聚合酶鏈反應(yīng)應(yīng)經(jīng)常使用帶有一次性柱塞和超長移液器吸頭的移液器。寧波組織數(shù)字PCR

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聚合酶鏈式反應(yīng)是80年代中期發(fā)展起來的體外核酸擴增技術(shù)。工具/原料:擴增緩沖液,四種dNTP,引物,模板DNA,Taq DNA聚合酶, Mg離子,蒸餾水。模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準備;模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合;引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基配對與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA 鏈互補的半保留復(fù)制鏈。重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三過程,就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。莆田分子生物學(xué)RT-PCR檢測技術(shù)序列間特異性聚合酶鏈反應(yīng)是一種用于DNA指紋識別的聚合酶鏈反應(yīng)方法。

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聚合酶鏈式反應(yīng)的特點:靈敏度高:PCR產(chǎn)物的生成量是以指數(shù)方式增加的,能將皮克(pg=10-12)量級的起始待測模板擴增到微克(μg=-6)水平。能從100萬個細胞中檢出一個靶細胞;在病毒的檢測中,PCR的靈敏度可達3個RFU(空斑形成單位);在細菌學(xué)中很小檢出率為3個細菌。簡便、快速:PCR反應(yīng)用耐高溫的Taq DNA聚合酶,一次性地將反應(yīng)液加好后,即在DNA擴增液和水浴鍋上進行變性-退火-延伸反應(yīng),一般在2~4 小時完成擴增反應(yīng)。擴增產(chǎn)物一般用電泳分析,不一定要用同位素,無放射性污染、易推廣。純度要求低:不需要分離病毒或細菌及培養(yǎng)細胞,DNA 粗制品及RNA均可作為擴增模板??芍苯佑门R床標本如血液、體腔液、洗嗽液、毛發(fā)、細胞、活組織等DNA擴增檢測。

PCR的反應(yīng)條件:dNTP濃度過高會加快反應(yīng)速度,但同時還可以增加堿基的錯誤摻入率。引物濃度過高會引起錯配和非特異性產(chǎn)物擴增。TaqDNA聚合酶濃度過高會引起錯配和非特異性產(chǎn)物擴增,低則合成產(chǎn)物量減少。TaqDNA聚合酶無校正功能,摻入錯誤率達2*E-4個核苷酸,一個30個循環(huán)的擴增反應(yīng)0.1%-0.25%總錯誤率。在90~95度下可使整個基因組的DNA變性為單鏈。一般94~95度30~60s。時間過長使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結(jié)合。引物長度在15~25時退火溫度。許多疾病的未知病因的測序正在通過聚合酶鏈反應(yīng)得到解決。

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逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)的原理是:提取組織或細胞中的總RNA,以其中的mRNA作為模板,采用Oligo(dT)或隨機引物利用逆轉(zhuǎn)錄酶反轉(zhuǎn)錄成cDNA。再以cDNA為模板進行PCR擴增,而獲得目的基因或檢測基因表達。完整RNA 的提取和純化,是進行RNA 方面的研究工作,如Nothern雜交、mRNA 分離、RT-PCR、定量PCR、cDNA合成及體外翻譯等的前提。所有RNA的提取過程中都有五個關(guān)鍵點,即樣品細胞或組織的有效破碎;有效地使白復(fù)合體變性;對內(nèi)源RNA酶的有效抑制;有效地將RNA從DNA和蛋白混合物中分離;對于多糖含量高的樣品還牽涉到多糖雜質(zhì)的有效除去。但其中很關(guān)鍵的是抑制RNA酶活性。RNA 的提取目前階段主要可采用兩種途徑,提取總核酸,再用氯化鋰將RNA 沉淀出來;直接在酸性條件下抽提,酸性下DNA與蛋白質(zhì)進入有機相而RNA 留在水相。種提取方法將導(dǎo)致小分子量RNA 的丟失,目前該方法的使用頻率已很低。電子聚合酶鏈反應(yīng)是指計算工具使用給定的一組引物來擴增來自測序的基因組或轉(zhuǎn)錄組的DNA 序列。廣州骨頭RT-PCR檢測技術(shù)供應(yīng)商

多重連接依賴探針擴增允許用單個引物對擴增多個靶標,從而避免多重PCR的分辨率限制。寧波組織數(shù)字PCR

聚合酶鏈式反應(yīng)準備:PCR所用的酶主要有兩種來源:Taq和Pfu,分別來自兩種不同的噬熱菌。其中Taq擴增效率高但易發(fā)生錯配。Pfu擴增效率弱但有糾錯功能。所以實際使用時根據(jù)需要必須做不同的選擇。模板即擴增用的DNA,可以是任何來源,但有兩個原則,純度必須較高,第二濃度不能太高以免抑制。緩沖液的成分很為復(fù)雜,除水外一般包括四個有效成分:緩沖體系,一般使用HEPES或MOPS緩沖體系;一價陽離子,一般采用鉀離子,但在特殊情況下也可使用銨根離子;二價陽離子,即鎂離子,根據(jù)反應(yīng)體系確定,除特殊情況外不需調(diào)整;輔助成分,常見的有DMSO、甘油等,主要用來保持酶的活性和幫助DNA解除纏繞結(jié)構(gòu)。寧波組織數(shù)字PCR

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