聚合酶鏈反應(yīng)的常見問題分析與解決方法:反應(yīng)緩沖液未完全融化或未充分混勻。確保反應(yīng)緩沖液融化完全并徹底混勻。引物特異性差。利用BLAST檢查引物特異性或重新設(shè)計(jì)引物。引物量過多。減少反應(yīng)體系中引物的用量。模板量過多。質(zhì)粒DNA的用量應(yīng)<50ng,而基因組DNA則應(yīng)<200ng。外源DNA污染。確保操作的潔凈。陰性對照出現(xiàn)條帶:試劑,頭,工作臺污染。使用全新的試劑和頭,對工作臺進(jìn)行清潔。條帶大小與理論不符:污染。使用全新的試劑和頭,對工作臺進(jìn)行清潔。模板或引物使用錯誤。更換引物和模板?;騺喰汀ρ芯康幕蜻M(jìn)行序列分析和BLAST研究。流聚合酶鏈反應(yīng)將溶液置于熱梯度下,而不是反復(fù)加熱和冷卻聚合酶鏈反應(yīng)混合物。無錫實(shí)時熒光PCR技術(shù)服務(wù)
聚合酶鏈反應(yīng)注意事項(xiàng):在實(shí)驗(yàn)過程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在總RNA的提取過程中,注意避免mRNA的斷裂;為了防止非特異性擴(kuò)增,必須設(shè)陰性對照;內(nèi)參的設(shè)定:主要為了用于靶RNA的定量。常用的內(nèi)參有G3PD(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)、β-Actin(β-肌動蛋白)等。其目的在于避免RNA定量誤差、加樣誤差以及各PCR反應(yīng)體系中擴(kuò)增效率不均一各孔間的溫度差等所造成的誤差;PCR不能進(jìn)入平臺期,出現(xiàn)平臺效應(yīng)與所擴(kuò)增的目的基因的長度、序列、二級結(jié)構(gòu)以及目標(biāo)DNA起始的數(shù)量有關(guān)。故對于每一個目標(biāo)序列出現(xiàn)平臺效應(yīng)的循環(huán)數(shù),均應(yīng)通過單獨(dú)實(shí)驗(yàn)來確定;防止DNA的污染: 采用DNA酶處理RNA; 在可能的情況下,將PCR引物置于基因的不同外顯子,以消除基因和mRNA的共線性。無錫實(shí)時熒光PCR技術(shù)服務(wù)流聚合酶鏈反應(yīng):一種偽等溫PCR方法。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)是一種用于放大擴(kuò)增特定的DN段的分子生物學(xué)技術(shù),它可看作是生物體外的特殊DNA復(fù)制,PCR的很大特點(diǎn)是能將微量的DNA大幅增加。基因工程:生物材料——mRNA,將mRNA反轉(zhuǎn)錄后成為cDNA(互補(bǔ)DNA),通過PCR擴(kuò)增。這里不是信使RNA,而是病毒RNA作為生物材料進(jìn)行PCR聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。作用——體外將病毒RNA分子結(jié)構(gòu)進(jìn)行修飾,其次將目的基因?qū)胧荏w細(xì)胞中,進(jìn)行病。RNA的表現(xiàn)形式:RNA病毒一般由蛋白質(zhì)和RNA組成,現(xiàn)在看下RNA——一條核糖核酸長鏈,核糖核酸長鏈由無數(shù)個核糖核苷酸分子構(gòu)成,其中,一個核糖核苷酸分子由一分子磷酸、一分子核糖(一種五碳糖)、一分子含氮堿基構(gòu)成。脫氧核糖核苷酸分子比核糖核苷酸分子少了一個O分子。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):定量PCR允許實(shí)時定量和檢測特定的DNA序列,因?yàn)樗诤铣蛇^程中測量濃度。有兩種方法可以同時檢測和定量。種方法是使用在DNA雙鏈之間非特異性保留的熒光染料。第二種方法涉及編碼特定序列并被熒光標(biāo)記的探針。只有在探針與其互補(bǔ)DNA雜交后,才能使用這些方法檢測DNA。一種有趣的技術(shù)組合是實(shí)時PCR和逆轉(zhuǎn)錄。這種復(fù)雜的技術(shù)被稱為RT-qPCR,允許定量少量RNA。通過這種組合技術(shù),mRNA被轉(zhuǎn)化為cDNA,并用qPCR進(jìn)一步定量。這種技術(shù)降低了聚合酶鏈反應(yīng)終點(diǎn)出錯的可能性,增加了檢測與遺傳疾病如病癥相關(guān)的基因的機(jī)會。實(shí)驗(yàn)室使用RT-qPCR來靈敏地測量基因調(diào)控?,F(xiàn)在有些PCR因?yàn)閿U(kuò)增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時間內(nèi)復(fù)制完成。
聚合酶鏈反應(yīng)同時擴(kuò)增單個精子中幾個基因座的能力]增強(qiáng)了極大地增強(qiáng)了通過研究減數(shù)分裂后染色體交叉來進(jìn)行基因定位的傳統(tǒng)任務(wù)。通過分析數(shù)千個單個精子,已經(jīng)直接觀察到非常緊密基因座之間罕見的交叉事件。類似地,可以分析異常的缺失、插入、易位或倒位,所有這些都無需等待(或支付)漫長而艱苦的受精、胚胎發(fā)生等過程。定點(diǎn)突變:聚合酶鏈反應(yīng)可用于產(chǎn)生突變基因,突變由科學(xué)家隨意選擇??梢赃x擇這些突變來理解蛋白質(zhì)是如何完成其功能的,并改變或改善蛋白質(zhì)功能。逆轉(zhuǎn)錄酶將核糖核酸逆轉(zhuǎn)錄成cDNA ,然后通過聚合酶鏈反應(yīng)進(jìn)行擴(kuò)增。杭州血液RT-PCR檢測技術(shù)技術(shù)服務(wù)
多重連接依賴探針擴(kuò)增允許用單個引物對擴(kuò)增多個靶標(biāo),從而避免多重PCR的分辨率限制。無錫實(shí)時熒光PCR技術(shù)服務(wù)
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)準(zhǔn)備:10×擴(kuò)增緩沖液、4種dNTP混合物(終濃度)、引物(終濃度)、模板DNA、Taq DNA聚合酶、Mg2+(終濃度)、補(bǔ)加雙蒸水等。其中dNTP、引物、模板DNA、Taq DNA聚合酶以及Mg2+的加量(或濃度)可根據(jù)實(shí)驗(yàn)調(diào)整,以上表格只提供大致參考值。PCR反應(yīng)五要素:參加PCR反應(yīng)的物質(zhì)主要有五種即:引物(PCR引物為DN段,細(xì)胞內(nèi)DNA復(fù)制的引物為一段RNA鏈)、酶、dNTP、模板和緩沖液(其中需要Mg2+)。引物有多種設(shè)計(jì)方法,由PCR在實(shí)驗(yàn)中的目的決定,但基本原則相同。無錫實(shí)時熒光PCR技術(shù)服務(wù)