牛痘DNA拓撲異構酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)是一種來源于牛痘病毒的I型真核拓撲異構酶,具有以下功能和應用:1.**功能**:-牛痘DNA拓撲異構酶I可以催化雙鏈DNA分子中單鏈DNA特定序列位置的磷酸二酯鍵的斷開和連接。-具有解超螺旋的酶(DNARelaxingEnzyme)活性,能夠通過快速的酶切和連接使雙鏈共價閉合環(huán)狀的正或負超螺旋DNA發(fā)生解超螺旋,形成含有較少的正或負超螺旋的雙鏈環(huán)狀DNA分子。-能夠使雙鏈DNA形成繩結(knotting)或解開繩結(unknotting),聯(lián)結互補的單鏈環(huán)狀DNA成為雙鏈環(huán)狀DNA。2.**應用**:-作為一種DNA重組連接的新型工具酶,用于DNA載體和重組片段的連接、缺刻修復、接頭連接等。-適用于TOPO克隆載體的制備、NGS建庫中的接頭連接等。-在TOPO克隆技術中,DNA拓撲異構酶I同時具有限制酶和連接酶特性,其生物學功能是在復制期間切割并重新連接DNA。3.**使用方法**:-用于DNA快速酶切流程,包括配制體系反應液、輕柔混勻、37℃孵育15分鐘等步驟。4.**儲存條件**:-建議在-25~-15℃保存,有效期為3年。5.**注意事項**:-避免起泡或劇烈攪拌、渦旋等操作,以防止酶失活。牛痘DNA拓撲異構酶I因其獨特的功能,在分子生物學研究和基因工程中扮演著重要的角色。FnCas12a需要一個crRNA,而不需要tracrRNA,簡化了RNA的設計和構建過程。Recombinant Human CD93/C1q R1 (hFc Tag)
pA-MNase(蛋白A-微球菌核酸酶)在以下實驗中特別有用:1.**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:這是一種用于研究蛋白質-DNA相互作用的技術,pA-MNase在此技術中用于在免疫沉淀后切割染色質DNA,以分析特定蛋白質與DNA的結合位點。2.**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:這是一種蛋白質-基因組互作研究技術,pA-MNase在此技術中用于在目標蛋白質被抗體識別后,通過核酸酶活性切割附近的DNA,從而釋放與目標蛋白質相互作用的DNA片段。CUT&RUN技術相比傳統(tǒng)的ChIP-Seq具有實驗周期短、信噪比高、可重復性好以及細胞投入量低的優(yōu)勢,尤其適用于早期胚胎發(fā)育、干細胞、**以及表觀遺傳學等研究領域。3.**染色質免疫沉淀實驗**:pA-MNase在染色質免疫沉淀實驗中用于染色質片段化,它在核小體間DNAlinker上進行切割保持了核小體的完整性,并且由于其溫和的酶解條件,消除了超聲功率的可變性和超聲過程中染色質乳化所帶來的負面影響。4.**去除核酸污染**:pA-MNase也可用于去除細胞裂解液中的核酸,以減少樣品的粘度,這對于后續(xù)的蛋白質分析實驗尤為重要。
磁珠法提取的DNA通常指的是通過磁珠吸附技術從樣本中純化得到的核酸,而基因組DNA(gDNA)是指一個生物體細胞核中包含的全套遺傳信息的DNA。兩者的主要區(qū)別在于:1.**來源和組成**:-磁珠法提取的DNA可以是基因組DNA,也可以是質粒DNA、線粒體DNA等其他類型的DNA。它是一個廣的概念,指的是通過磁珠法技術提取的任何類型的DNA。-基因組DNA特指一個生物體細胞核中的DNA,包含了所有的基因信息,以及可能的非編碼區(qū)域。它通常包含了大量的堿基對,如人類基因組由大約30億個堿基對組成。2.**純度和應用**:-磁珠法提取的DNA的純度和質量取決于提取過程中的裂解、吸附、洗滌和洗脫步驟,以及磁珠的質量和操作條件。高質量的磁珠法提取的DNA可以用于多種分子生物學實驗,如PCR、克隆、測序等。-基因組DNA的提取通常需要考慮其完整性和純度,以確保后續(xù)實驗的準確性。基因組DNA提取的難點在于血液樣本成分復雜,且白細胞體積占比低,因此提取純化難度較高。3.**提取方法**:-磁珠法提取DNA是一種高效、快速的核酸提取技術,它利用磁珠表面修飾的特定官能團與核酸的特異性結合,通過外加磁場實現(xiàn)核酸與雜質的快速分離。
在質粒DNA提取過程中,確保DNA的完整性和活性至關重要,這通常涉及以下幾個關鍵因素:1.**溫和的裂解條件**:選擇適當?shù)牧呀夥椒▽τ诒3諨NA的完整性至關重要。對于大于15kb的質粒DNA,應采用溫和的裂解方法,如將細菌懸浮于等滲的葡萄糖溶液中,加入溶菌酶和EDTA破壞細胞壁和細胞膜,以減少對質粒DNA的機械剪切力,從而保護其完整性。2.**避免過度裂解**:在質粒提取過程中,并非裂解時間越長越好。過長的裂解時間可能會造成基因組DNA片段的污染,影響質粒的純度。3.**適當?shù)南礈旌拖疵?*:在純化過程中,適當?shù)南礈炜梢匀コ鞍踪|和其他雜質,但過度洗滌可能會導致DNA的損失。洗脫步驟中,確保洗脫液完全浸潤柱膜,以保證結合在柱膜上的質粒得以充分洗脫,避免因洗脫體積過小而影響質粒得率。4.**避免DNA的降解**:在提取過程中,添加核酸酶抑制劑可以防止DNA被核酸酶降解。同時,避免長時間將DNA暴露在室溫下,以及避免多次凍融循環(huán),這些都有助于保護DNA的完整性。5.**低溫操作**:盡量在低溫條件下進行提取操作,以減少核酸酶的活性,從而保護DNA的完整性。
BstDNA聚合酶在等溫擴增中的優(yōu)勢主要包括以下幾點:1.**高靈敏度和擴增效率**:BstDNA聚合酶具有鏈置換能力,能夠在恒溫條件下快速、高效、特異性地擴增模板。翌圣生物的BstPlusDNAPolymerase靈敏度超高,低至5copies目的基因可測,且始終能比競品更快達到閾值,擴增速率更快。2.**高dUTP耐受性**:BstPlusDNAPolymerase具有較高的dUTP耐受性,在反應體系中添加dUTP對BstPlusDNAPolymerase的靈敏度及擴增效率無影響,這使得它在防污染系統(tǒng)中表現(xiàn)出色。3.**快速擴增**:使用BstDNA聚合酶的等溫擴增技術,如LAMP,可以在15-60分鐘內實現(xiàn)109-1010倍的擴增,顯示出快速的擴增能力。4.**熱穩(wěn)定性**:BstDNA聚合酶具有較強的熱穩(wěn)定性,能在60-65℃的恒溫條件下保持活性,這使得它非常適合于不需要溫度循環(huán)的等溫擴增技術。5.**簡化的反應設置**:Bst3.0DNAPolymerase優(yōu)化了Loop-MediatedIsothermalDNAAmplification(LAMP)反應,簡化了反應設置,可以實現(xiàn)單酶RT-LAMP反應。6.**抗抑制劑能力強**:Bst3.0DNAPolymerase即使在高濃度的擴增抑制劑中,包括dUTP,也能展現(xiàn)出強大的性能。
Ultra-Long Master Mix 在分子生物學實驗中的應用主要集中在需要擴增長片段DNA序列的場合。Recombinant Human CD93/C1q R1 (hFc Tag)
不同的DNA聚合酶在PCR中的應用差異主要體現(xiàn)在以下幾個方面:1.**TaqDNAPolymerase**:是常用的DNA聚合酶之一,來源于Thermusaquaticus,具有較高的熱穩(wěn)定性及擴增效率。但它缺乏3'-5'核酸外切酶活性,即沒有校正功能,因此其保真性相對較低。Taq酶適合擴增較短的DNA片段(通常不超過3kb),且在PCR產物的3'端帶A堿基,可直接用于TA克隆。2.**PfuDNAPolymerase**:來源于Pyrococcusfuriosus,是一種高保真聚合酶,具有3'-5'外切酶活性,可以修復并糾正PCR反應中的腺嘌呤堿基誤配,有效防止誤差累積。Pfu聚合酶適用于需要高度準確的PCR擴增和DNA測序。3.**VentDNAPolymerase**:來源于Thermuslitoralis,具有中等保真度,比Taq聚合酶高兩倍。它適用于GC含量高或復雜序列的PCR擴增,具有較高的熱穩(wěn)定性,半衰期可達6.7小時。4.**KODDNAPolymerase**:來源于Thermococcuskodakaraensis,具有高保真性和高熱穩(wěn)定性,保真性是Taq的約50倍,同時具有合成速度快的特點,聚合速度約為普通PfuDNAPolymerase的5倍,特別適合于高保真地擴增6kb以內的PCR產物。Recombinant Human CD93/C1q R1 (hFc Tag)