蛋白質(zhì)片段互補(bǔ)分析(PCA,也稱(chēng)為雙分子熒光互補(bǔ))和雙雜交篩選允許檢測(cè)細(xì)胞中蛋白質(zhì)相互作用的形成/抑制。PCA將單個(gè)檢測(cè)蛋白(熒光素酶、GFP、GAL)分成兩部分,這些部分與感興趣的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用融合;如果伴侶結(jié)合,檢測(cè)蛋白會(huì)重新形成并檢測(cè)到信號(hào)。高內(nèi)涵成像平臺(tái)(HCS)由于其能夠提供出色的單細(xì)胞分析功能和短的數(shù)據(jù)采集時(shí)間獲得大家的青睞。一般的實(shí)驗(yàn)流程為設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)并使用自動(dòng)分液儀將細(xì)胞接種到96、384或1536孔板中;然后加入化合物,由于細(xì)胞在孵育過(guò)程中會(huì)對(duì)化合物做出反應(yīng),隨后對(duì)細(xì)胞進(jìn)行染色,并通過(guò)HCS成像系統(tǒng)獲取圖像,通過(guò)軟件分析獲取的圖像以確定化合物的劑量反應(yīng)。組合化學(xué)高通量篩選。甘肅高通量篩選技術(shù)
我國(guó)進(jìn)行藥物高通量篩選的優(yōu)勢(shì)首先是化合物來(lái)源,且多為天然;其次是對(duì)化合物生物活性的篩選目的較明確,無(wú)目的合成的化合物較少;第三,我國(guó)傳統(tǒng)藥物為篩選研究提供了一個(gè)巨大的資源庫(kù),可從中藥中提取分離篩選新的化合物。這些優(yōu)勢(shì)為藥物的高通量篩選打下了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。我國(guó)藥物高通量篩選初現(xiàn)規(guī)模:藥物高通量篩選工作在我國(guó)起步較晚,且不規(guī)范。近幾年,我國(guó)進(jìn)行了外引內(nèi)聯(lián)的整體化、規(guī)模化基礎(chǔ)建設(shè),已初見(jiàn)成效。1996年中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院引進(jìn)國(guó)內(nèi)臺(tái)Biomek2000型實(shí)驗(yàn)自動(dòng)化工作站;1998年又引進(jìn)臺(tái)Topcount微量閃爍計(jì)數(shù)器,使放射配基實(shí)驗(yàn)、放射免疫實(shí)驗(yàn)等技術(shù)微量化、自動(dòng)化。上海藥物研究所、北京醫(yī)學(xué)科學(xué)院分別成立了藥物篩選專(zhuān)門(mén)機(jī)構(gòu),開(kāi)始從事大規(guī)模篩選工作。甘肅高通量篩選技術(shù)高通量篩選的具備條件。
藥物研發(fā)與開(kāi)發(fā)是一個(gè)復(fù)雜與漫長(zhǎng)的過(guò)程,特別是小分子藥物的研發(fā),其難點(diǎn)和關(guān)鍵在于如何快速高效的找到先導(dǎo)化合物(LeadCompound)。采用高通量藥物篩選(High-throughputscreening,HTS)來(lái)發(fā)現(xiàn)新的先導(dǎo)化合物仍然是小分子藥物研發(fā)的優(yōu)先。傳統(tǒng)藥物篩選是一個(gè)耗時(shí)長(zhǎng)且昂貴的過(guò)程,一般需要消耗大量的樣品和實(shí)驗(yàn)動(dòng)物,對(duì)技術(shù)人員的操作技能有較高要求,難以在短時(shí)間內(nèi)對(duì)一定數(shù)量的樣品開(kāi)展有效和經(jīng)濟(jì)的篩選。隨著各類(lèi)化合物樣品庫(kù)儲(chǔ)量的不斷增加以及組合化學(xué)技術(shù)的應(yīng)用,采用傳統(tǒng)手段篩選海量樣品不僅不可能而且極大地限制了新藥研究之進(jìn)程。
在1985年之前,先導(dǎo)物的篩選主要是通過(guò)人工進(jìn)行的,每周處理的樣本數(shù)量不過(guò)幾百個(gè),組合化學(xué)的出現(xiàn)使得科學(xué)家們獲取化合物的方式發(fā)生了變化,他們可以在短時(shí)間內(nèi)合成大量化合物。更重要的是,隨著分子生物學(xué)和功能基因組的研究發(fā)展,使得新穎靶標(biāo)大量增加,這種情況下,緩慢的人工篩選已經(jīng)沒(méi)有辦法滿足新藥研發(fā)的要求,高通量篩選技術(shù)的出現(xiàn)縮短了先導(dǎo)物開(kāi)發(fā)在藥物發(fā)現(xiàn)中的時(shí)間。如今,一個(gè)普通的藥學(xué)高通量篩選實(shí)驗(yàn)室每天篩選的靶標(biāo)已經(jīng)超過(guò)10萬(wàn)個(gè)。高通量篩選的原理是什么。
從先導(dǎo)化合物的結(jié)構(gòu)來(lái)看,特殊環(huán)系出現(xiàn)頻次多的是嘌呤結(jié)構(gòu),這有可能與激酶和其他一些基于核苷酸的酶在很多疾病中起到的巨大作用有關(guān)。其他出現(xiàn)頻次比較高的環(huán)系包括五元環(huán)的四氫噻唑、吡唑、吡咯、咪唑啉和吡咯烷,以及六元環(huán)哌啶和哌嗪類(lèi)骨架。分子柔性增加:大部分的先導(dǎo)化合物都含有一個(gè)手性中心,更有6個(gè)化合物含有兩個(gè)手性中心。從苗頭化合物到先導(dǎo)化合物,Sp3雜化碳原子個(gè)數(shù)比例有著地升高,統(tǒng)計(jì)上來(lái)說(shuō)從0.197± 0.157 上升到了0.255±0.162。高通量篩選菌種是什么。甘肅高通量篩選技術(shù)
藥物高通量篩選系統(tǒng)。甘肅高通量篩選技術(shù)
熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)是指在兩個(gè)不同的熒光基團(tuán)中,如果一個(gè)熒光基團(tuán)(供體Donor)的發(fā)射光譜與另一個(gè)基團(tuán)(受體Acceptor)的吸收光譜有一定的重疊,當(dāng)這兩個(gè)熒光基團(tuán)間的距離合適時(shí),就可觀察到熒光能量由供體向受體轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象,即以前一種基團(tuán)的激發(fā)波長(zhǎng)激發(fā)時(shí),可觀察到后一個(gè)基團(tuán)發(fā)射的熒光。常見(jiàn)的供體-受體對(duì)之間的有效距離通常為2-6nm,適用于許多蛋白質(zhì)相互作用。染料通常是有機(jī)分子,如與蛋白質(zhì)偶聯(lián)的熒光素和羅丹明,或與感興趣的蛋白質(zhì)融合的熒光蛋白。甘肅高通量篩選技術(shù)