ChIP實(shí)驗(yàn)的基本步驟包括:
1. 交聯(lián)(Crosslinking):細(xì)胞被甲醛等交聯(lián)劑處理,使得蛋白質(zhì)和DNA之間的相互作用被固定,形成穩(wěn)定的蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物。
2. 細(xì)胞裂解:裂解細(xì)胞,釋放染色質(zhì),同時(shí)保持蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物的完整性。
3. 超聲或酶解:通過超聲或酶解將染色質(zhì)切割成較小的片段,以便于后續(xù)步驟中的免疫沉淀。
4. 免疫沉淀(Immunoprecipitation):加入針對特定組蛋白修飾或轉(zhuǎn)錄因子的抗體,這些抗體會(huì)特異性地結(jié)合到目標(biāo)蛋白質(zhì)上。
5. 捕獲復(fù)合物:使用蛋白A或蛋白G結(jié)合的珠子捕獲抗體-蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物。
6. 洗滌:洗滌珠子以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)和DNA片段。
7. 逆轉(zhuǎn)錄交聯(lián):將捕獲的復(fù)合物從珠子上洗脫,并進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄交聯(lián),使固定的蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物分離。
8. DNA純化:純化從免疫沉淀中得到的DNA片段。
9. 分析:通過qPCR、芯片分析(ChIP-chip)或高通量測序(ChIP-seq)等方法分析沉淀的DNA片段,以確定特定蛋白質(zhì)在基因組上的結(jié)合位點(diǎn)。
免疫沉淀抗體的選擇?南京anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠現(xiàn)貨
免疫沉淀ChIP實(shí)驗(yàn)中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實(shí)驗(yàn)情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結(jié)構(gòu) (直徑 50-150 μm) 可以結(jié)合抗體 (繼而結(jié)合靶蛋白) ,它能夠直接高效、快速結(jié)合抗體,而不需借助特殊的專業(yè)設(shè)備。瓊脂糖珠呈多孔結(jié)構(gòu),這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質(zhì)相互接觸,具有更高的結(jié)合載量。
與瓊脂糖珠不同,磁珠是固體,抗體的結(jié)合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,盡管磁珠沒有多孔中心增加結(jié)合能力,但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多,使磁珠擁有足夠的抗體結(jié)合表面積滿足高容量的抗體結(jié)合。
簡而言之,瓊脂糖珠的結(jié)合能力較強(qiáng),而磁珠在得率,可重復(fù)性以及自動(dòng)化方面有明顯的優(yōu)勢。
蘇州anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠的選擇免疫沉淀技術(shù)RIP實(shí)驗(yàn)步驟。
免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)通常包括以下幾個(gè)關(guān)鍵步驟:
1. 目標(biāo)蛋白質(zhì)的選擇:
2. 抗體的選擇:選擇特異性強(qiáng)、親和力高的抗體來捕獲目標(biāo)蛋白質(zhì)
3. 樣本的準(zhǔn)備:收集和準(zhǔn)備細(xì)胞或組織樣本。
4. 蛋白質(zhì)的裂解和釋放:選擇合適的裂解條件,如pH值、離子強(qiáng)度、去污劑等。
5. 蛋白質(zhì)濃度的測定:確定裂解液中蛋白質(zhì)的濃度,以便于后續(xù)步驟的標(biāo)準(zhǔn)化。
6. 免疫沉淀的操作:將特異性抗體與裂解液混合,并在適宜的條件下孵育,以形成抗體-抗原復(fù)合物。
7. 非特異性結(jié)合的減少:通過預(yù)純化步驟去除可能的非特異性結(jié)合蛋白。
8. 洗滌:多次洗滌以去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和雜質(zhì)。
9. 目標(biāo)蛋白質(zhì)的洗脫:使用適當(dāng)?shù)木彌_液洗脫抗體-抗原復(fù)合物。
10. 后續(xù)分析:對洗脫的蛋白質(zhì)進(jìn)行進(jìn)一步分析,如Western Blot.
11. 對照實(shí)驗(yàn):設(shè)計(jì)適當(dāng)?shù)恼龑φ蘸拓?fù)對照,以評(píng)估實(shí)驗(yàn)的特異性和敏感性。
免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)的實(shí)驗(yàn)方法通常包括以下步驟:
1. 樣本準(zhǔn)備
2. 蛋白質(zhì)濃度測定:使用BCA、Bradford或Lowry等方法測定裂解液中蛋白質(zhì)的濃度。
3. 抗體預(yù)處理:如果使用預(yù)固定的抗體,需先將抗體固定在固相支持物上,如瓊脂糖珠或磁性微珠。
4. 免疫沉淀反應(yīng):將裂解液與特異性抗體(固定或未固定)混合,并在4°C下緩慢搖晃孵育過夜,以允許抗體與目標(biāo)蛋白質(zhì)充分結(jié)合。
5. 固相支持物的回收:對于未固定的抗體,加入與抗體特異性結(jié)合的蛋白A或蛋白G結(jié)合的固相支持物。
6. 洗滌:去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和雜質(zhì),通常需要多次洗滌固相支持物。
7. 洗脫:使用適當(dāng)?shù)南疵摼彌_液(如加熱的SDS加載緩沖液或酸性緩沖液)從固相支持物上洗脫免疫復(fù)合物。
8. 后續(xù)分析:對洗脫的蛋白質(zhì)進(jìn)行SDS-PAGE電泳、Western Blot、質(zhì)譜分析等,以進(jìn)一步分析目標(biāo)蛋白質(zhì)。
免疫沉淀技術(shù)ChIP的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。
免疫沉淀(IP)實(shí)驗(yàn)中抗體的選擇非常關(guān)鍵,因?yàn)榭贵w的特異性和親和力直接影響到實(shí)驗(yàn)的成功與否。
1. 特異性:抗體應(yīng)當(dāng)對目標(biāo)蛋白具有高度的特異性,以避免與其他蛋白發(fā)生非特異性結(jié)合,導(dǎo)致假陽性結(jié)果。
2. 親和力:抗體對目標(biāo)蛋白的親和力要足夠高,以確保在免疫沉淀過程中能夠有效地捕獲目標(biāo)蛋白。
3. 抗體類型:單克隆抗體和多克隆抗體都可以用于IP實(shí)驗(yàn)。單克隆抗體提供更高的特異性和批間一致性,而多克隆抗體可能提供更強(qiáng)的結(jié)合能力和更廣的表位覆蓋。
4. 應(yīng)用驗(yàn)證:選擇已經(jīng)過免疫沉淀(IP)或相關(guān)應(yīng)用(如Western blot, IHC)驗(yàn)證的抗體,這增加了實(shí)驗(yàn)成功的可能性。
5. 供應(yīng)商信息:選擇信譽(yù)良好的抗體供應(yīng)商,并查看供應(yīng)商提供的技術(shù)數(shù)據(jù)和客戶評(píng)價(jià),以幫助做出決策。
免疫沉淀技術(shù)的應(yīng)用。南京anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠現(xiàn)貨
免疫沉淀和免疫共沉淀的區(qū)別?南京anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠現(xiàn)貨
免疫沉淀(Co-IP)實(shí)驗(yàn)中抗體的選擇非常關(guān)鍵,因?yàn)榭贵w的特異性和親和力直接影響到實(shí)驗(yàn)的成功與否。
1. 特異性:抗體應(yīng)當(dāng)對目標(biāo)蛋白具有高度的特異性,以避免與其他蛋白發(fā)生非特異性結(jié)合,導(dǎo)致假陽性結(jié)果。
2. 親和力:抗體對目標(biāo)蛋白的親和力要足夠高,以確保在免疫沉淀過程中能夠有效地捕獲目標(biāo)蛋白。
3. 抗體類型:單克隆抗體和多克隆抗體都可以用于IP實(shí)驗(yàn)。單克隆抗體提供更高的特異性和批間一致性,而多克隆抗體可能提供更強(qiáng)的結(jié)合能力和更廣的表位覆蓋。
4. 應(yīng)用驗(yàn)證:選擇已經(jīng)過免疫沉淀(Co-IP)或相關(guān)應(yīng)用(如Western blot, IHC)驗(yàn)證的抗體,這增加了實(shí)驗(yàn)成功的可能性。
5. 供應(yīng)商信息:選擇信譽(yù)良好的抗體供應(yīng)商,并查看供應(yīng)商提供的技術(shù)數(shù)據(jù)和客戶評(píng)價(jià),以幫助做出決策。
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