廣州IP免疫沉淀實(shí)驗(yàn)原理

來源：發(fā)布時(shí)間：2024-06-25

RNA免疫沉淀技術(shù)（RIP）是一種研究RNA與蛋白質(zhì)相互作用的重要方法，其應(yīng)用領(lǐng)域主要包括：

1. 轉(zhuǎn)錄后調(diào)控研究：RIP技術(shù)可以幫助研究者了解RNA在轉(zhuǎn)錄后水平如何被調(diào)控。

2. 表觀遺傳調(diào)控：RIP技術(shù)用于研究RNA結(jié)合蛋白（RBPs）在表觀遺傳調(diào)控中的作用。

3. 非編碼RNA功能研究：RIP技術(shù)可以用來研究長非編碼RNA（lncRNA）、miRNA和其他小RNA的種類，以及它們?nèi)绾闻c蛋白質(zhì)相互作用來調(diào)控基因表達(dá)。

4. RNA病毒研究：RIP技術(shù)也可用于研究RNA病毒與其宿主細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的相互作用，進(jìn)而了解病毒復(fù)制和致病機(jī)制。

5. RNA修飾和甲基化研究：RIP技術(shù)結(jié)合其他技術(shù)如m5C-RIP-seq，可用于研究RNA甲基化修飾及其在病理過程中的作用。

6. RNA定位和穩(wěn)定性：通過RIP技術(shù)，研究者可以探索特定RNA在細(xì)胞內(nèi)的定位以及它們?nèi)绾伪环€(wěn)定或降解。

7. RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物的鑒定：RIP技術(shù)可以用來鑒定與特定RNA結(jié)合的蛋白質(zhì)，從而揭示RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物的組成。

8. 疾病相關(guān)RNA研究：RIP技術(shù)在疾病相關(guān)RNA的研究中也有應(yīng)用。

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ChIP技術(shù)的應(yīng)用：

1. 轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的鑒定：研究特定轉(zhuǎn)錄因子在基因組上的結(jié)合模式。

2. 組蛋白修飾的分布：分析不同組蛋白修飾在基因組上的分布情況，這些修飾與基因的活躍或沉默有關(guān)。

3. DNA甲基化研究：結(jié)合ChIP技術(shù)可以研究DNA甲基化對(duì)基因表達(dá)的影響。

4. 染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能：研究染色質(zhì)重塑對(duì)基因表達(dá)和細(xì)胞功能的影響。

5. 疾病相關(guān)基因的調(diào)控：研究疾病狀態(tài)下基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的變化。

ChIP技術(shù)是表觀遺傳學(xué)研究中的一個(gè)重要工具，它可以幫助科學(xué)家們理解基因表達(dá)是如何在分子水平上被精確調(diào)控的。

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ChIP（染色質(zhì)免疫沉淀）實(shí)驗(yàn)是一種用于研究蛋白質(zhì)與DNA相互作用的技術(shù)。以下是ChIP實(shí)驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)概述：

1. 目標(biāo)蛋白的選擇：確定您想要研究的目標(biāo)蛋白，例如特定的轉(zhuǎn)錄因子或組蛋白修飾。

2. 樣本的準(zhǔn)備：根據(jù)研究的需要選擇合適的細(xì)胞或組織樣本。

3. 抗體的選擇：選擇具有高特異性和親和力的抗體，這對(duì)于實(shí)驗(yàn)的成功至關(guān)重要。

4. 交聯(lián)：使用甲醛等交聯(lián)劑將蛋白質(zhì)與DNA在體內(nèi)共價(jià)結(jié)合，形成穩(wěn)定的蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物。

5. 細(xì)胞裂解：裂解細(xì)胞以釋放染色質(zhì)，同時(shí)保持蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物的完整性。

6. 染色質(zhì)的剪切：通過超聲或酶消化將染色質(zhì)剪切成適當(dāng)大小的片段，通常在200-1000 bp之間。

7. 免疫沉淀：使用特定抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合，然后利用蛋白A/G磁珠沉淀復(fù)合物。

8. 洗滌和洗脫：洗滌沉淀物以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)和DNA，然后洗脫目標(biāo)蛋白-DNA復(fù)合物。

9. 逆轉(zhuǎn)交聯(lián)：使用蛋白酶K處理樣品以逆轉(zhuǎn)交聯(lián)，釋放DNA。

10. DNA的純化和分析：純化DNA并使用qPCR、芯片或測序技術(shù)（如ChIP-seq）進(jìn)行分析。

免疫沉淀實(shí)驗(yàn)步驟：

1. 樣品制備

a. 懸浮細(xì)胞樣品處理：離心收集細(xì)胞（4℃, 1000g, 5 min），用手指把細(xì)胞用力彈散。按照6孔板每孔細(xì)胞加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制劑的裂解液（裂解液應(yīng)在使用前數(shù)分鐘內(nèi)加入蛋白酶抑制劑Cocktail，使蛋白酶抑制劑Cocktail的終濃度為1×）?；靹蚝笾糜诒咸幚?0 min；離心收集上清液（4℃, 14000g, 10 min），置于冰上備用（或置于-20℃長期保存）。

b. 貼壁細(xì)胞樣品處理：移去培養(yǎng)基，用PBS清洗細(xì)胞兩遍；用細(xì)胞刮棒刮脫細(xì)胞，收集至1.5mL EP管內(nèi)，按照6孔板每孔加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制劑的裂解液（裂解液應(yīng)在使用前數(shù)分鐘內(nèi)加入蛋白酶抑制劑Cocktail，使蛋白酶抑制劑Cocktail的終濃度為1×）。吹打數(shù)下，使裂解液和細(xì)胞充分接觸?；靹蚝笾糜诒咸幚?0 min；離心收集上清液（4℃, 14000g, 10 min），置于冰上備用（或置于-20℃長期保存）。

4. 后續(xù)：磁珠預(yù)處理——抗體吸附——抗原結(jié)合反應(yīng)——抗體洗脫

免疫沉淀技術(shù)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。

免疫沉淀是利用抗體特異性反應(yīng)純化富集目的蛋白的一種方法。抗體與細(xì)胞裂解液或表達(dá)上清中相應(yīng)的蛋白結(jié)合后，再與蛋白A/G（ProteinA/G）或二抗偶聯(lián)的珠子（agarose或Sepharose）孵育，通過離心得到珠子-蛋白A/G或二抗-抗體-目的蛋白復(fù)合物，沉淀經(jīng)過洗滌后，重懸于電泳上樣緩沖液，煮沸5-10min，在高溫及還原劑的作用下，抗原與抗體解離，離心收集上清，上清中包括抗體、目的蛋白和少量的雜蛋白。免疫沉淀是一種生物學(xué)技術(shù)，它利用抗體的特異性結(jié)合特性來富集和分離混合物中的特定蛋白質(zhì)。這種技術(shù)是研究蛋白質(zhì)表達(dá)、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)修飾和蛋白質(zhì)功能的強(qiáng)大工具。免疫沉淀Co-IP技術(shù)選瓊脂糖珠還是磁珠？蘇州anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠哪個(gè)公司好用

免疫沉淀技術(shù)Co-IP的原理是什么？廣州IP免疫沉淀實(shí)驗(yàn)原理

免疫沉淀RIP實(shí)驗(yàn)中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實(shí)驗(yàn)情況。

瓊脂糖珠海綿狀的結(jié)構(gòu) (直徑 50-150 μm) 可以結(jié)合抗體 (繼而結(jié)合靶蛋白) ，它能夠直接高效、快速結(jié)合抗體，而不需借助特殊的專業(yè)設(shè)備。瓊脂糖珠呈多孔結(jié)構(gòu)，這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質(zhì)相互接觸，具有更高的結(jié)合載量。

與瓊脂糖珠不同，磁珠是固體，抗體的結(jié)合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠，盡管磁珠沒有多孔中心增加結(jié)合能力，但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多，使磁珠擁有足夠的抗體結(jié)合表面積滿足高容量的抗體結(jié)合。

簡而言之，瓊脂糖珠的結(jié)合能力較強(qiáng)，而磁珠在得率，可重復(fù)性以及自動(dòng)化方面有明顯的優(yōu)勢。

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標(biāo)簽：免疫沉淀支原體

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