上海RIP免疫沉淀磁珠的選擇

來(lái)源：發(fā)布時(shí)間：2024-06-22

Co-IP（免疫共沉淀）技術(shù)主要用于研究蛋白質(zhì)之間的相互作用，其實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)如下：

1. 樣品準(zhǔn)備：Co-IP實(shí)驗(yàn)通常有兩種，一種是內(nèi)源性蛋白相互作用驗(yàn)證，一種是非內(nèi)源性蛋白相互作用驗(yàn)證。內(nèi)源性相互作用通過(guò)質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染的方式將兩種蛋白轉(zhuǎn)染至同一細(xì)胞內(nèi)表達(dá)；非內(nèi)源性相互作用則是將含有靶蛋白的組織進(jìn)行預(yù)處理及細(xì)胞裂解獲得細(xì)胞裂解液。

2. 沉淀誘餌蛋白：利用磁珠偶聯(lián)抗體沉淀誘餌蛋白。在樣品中加入磁珠偶聯(lián)抗體，抗體會(huì)與誘餌蛋白結(jié)合，利用磁鐵將磁珠拉下，同時(shí)誘餌蛋白會(huì)一起被沉淀出來(lái)。

3. SDS-PAGE及WB檢測(cè)：得到沉淀后，需要驗(yàn)證沉淀中是否存在相互作用蛋白。先利用SDS-PAGE將蛋白復(fù)合物分離，隨后利用WB檢測(cè)是否存在靶蛋白。

4. 實(shí)驗(yàn)對(duì)照設(shè)置：為了避免“假陽(yáng)性”，需要設(shè)置正確的對(duì)照，包括陰性對(duì)照和陽(yáng)性對(duì)照（Input組）。Input組為直接利用抗體對(duì)細(xì)胞裂解液進(jìn)行WB檢測(cè)，驗(yàn)證細(xì)胞裂解液中存在蛋白。

5. 結(jié)果真實(shí)性：確保共沉淀的蛋白是由所加入的抗體沉淀得到的，而并非外源非特異蛋白。使用單克隆抗體有助于避免污染的發(fā)生。

免疫沉淀技術(shù)IP實(shí)驗(yàn)步驟。上海RIP免疫沉淀磁珠的選擇

免疫沉淀技術(shù)的實(shí)驗(yàn)方法通常包括以下步驟：

1. 樣本準(zhǔn)備

2. 細(xì)胞裂解：使用裂解緩沖液（含有蛋白酶抑制劑以防止蛋白質(zhì)降解）裂解細(xì)胞，釋放蛋白質(zhì)。

3. 蛋白質(zhì)濃度測(cè)定：使用BCA、Bradford或Lowry等方法測(cè)定裂解液中蛋白質(zhì)的濃度。

4. 抗體預(yù)處理：如果使用預(yù)固定的抗體，需先將抗體固定在固相支持物上，如瓊脂糖珠或磁性微珠。

5. 免疫沉淀反應(yīng)：將裂解液與特異性抗體（固定或未固定）混合，并在4°C下緩慢搖晃孵育過(guò)夜，以允許抗體與目標(biāo)蛋白質(zhì)充分結(jié)合。

6. 固相支持物的回收：對(duì)于未固定的抗體，加入與抗體特異性結(jié)合的蛋白A或蛋白G結(jié)合的固相支持物。

7. 洗滌：去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和雜質(zhì)，通常需要多次洗滌固相支持物。

8. 洗脫：使用適當(dāng)?shù)南疵摼彌_液（如加熱的SDS加載緩沖液或酸性緩沖液）從固相支持物上洗脫免疫復(fù)合物。

9. 后續(xù)分析：對(duì)洗脫的蛋白質(zhì)進(jìn)行SDS-PAGE電泳、Western Blot、質(zhì)譜分析等，以進(jìn)一步分析目標(biāo)蛋白質(zhì)。

10. 對(duì)照實(shí)驗(yàn)：包括正對(duì)照（已知能沉淀目標(biāo)蛋白的抗體）和負(fù)對(duì)照（非特異性抗體或無(wú)抗體）以驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)的特異性。

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Co-IP的實(shí)驗(yàn)步驟：

1. 細(xì)胞裂解：首先，細(xì)胞或組織被裂解，釋放其中的蛋白質(zhì)。

2. 抗體結(jié)合：然后，將特異性抗體（針對(duì)已知蛋白質(zhì)之一的抗體）加入到裂解物中。這些抗體會(huì)特異性地結(jié)合到目標(biāo)蛋白（誘餌蛋白）上。

3. 免疫復(fù)合物形成：抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合后，形成免疫復(fù)合物。

4. 沉淀：接著，使用蛋白A或蛋白G結(jié)合的珠子（如瓊脂糖或磁性珠子）來(lái)捕獲免疫復(fù)合物。蛋白A或蛋白G能夠與抗體的Fc部分結(jié)合，從而拉下抗體以及與之結(jié)合的目標(biāo)蛋白和任何相關(guān)的相互作用蛋白。

5. 洗滌：捕獲的免疫復(fù)合物被洗滌以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)。

6. 洗脫和分析：免疫復(fù)合物被洗脫并進(jìn)行進(jìn)一步的分析，如Western blot（WB）或質(zhì)譜分析，以鑒定相互作用的蛋白質(zhì)。

免疫沉淀實(shí)驗(yàn)步驟：

1. 樣品制備

a. 懸浮細(xì)胞樣品處理：離心收集細(xì)胞（4℃, 1000g, 5 min），用手指把細(xì)胞用力彈散。按照6孔板每孔細(xì)胞加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制劑的裂解液（裂解液應(yīng)在使用前數(shù)分鐘內(nèi)加入蛋白酶抑制劑Cocktail，使蛋白酶抑制劑Cocktail的終濃度為1×）?；靹蚝笾糜诒咸幚?0 min；離心收集上清液（4℃, 14000g, 10 min），置于冰上備用（或置于-20℃長(zhǎng)期保存）。

b. 貼壁細(xì)胞樣品處理：移去培養(yǎng)基，用PBS清洗細(xì)胞兩遍；用細(xì)胞刮棒刮脫細(xì)胞，收集至1.5mL EP管內(nèi)，按照6孔板每孔加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制劑的裂解液（裂解液應(yīng)在使用前數(shù)分鐘內(nèi)加入蛋白酶抑制劑Cocktail，使蛋白酶抑制劑Cocktail的終濃度為1×）。吹打數(shù)下，使裂解液和細(xì)胞充分接觸?；靹蚝笾糜诒咸幚?0 min；離心收集上清液（4℃, 14000g, 10 min），置于冰上備用（或置于-20℃長(zhǎng)期保存）。

4. 后續(xù)：磁珠預(yù)處理——抗體吸附——抗原結(jié)合反應(yīng)——抗體洗脫

免疫沉淀技術(shù)IP的優(yōu)缺點(diǎn)是什么？

RIP技術(shù)的優(yōu)勢(shì)在于：

1. 特異性：利用特異性抗體，可以精確地捕獲目標(biāo)RNA結(jié)合蛋白及其相互作用的RNA。

2. 應(yīng)用場(chǎng)景多：適用于研究RNA結(jié)合蛋白、miRNA、lncRNA等非編碼RNA與蛋白質(zhì)的相互作用。

3. 技術(shù)結(jié)合：RIP后的RNA可以用于多種下游分析，如qPCR、測(cè)序等，為研究RNA的功能和調(diào)控提供了重要信息。

RIP技術(shù)的限制包括：

1. 抗體質(zhì)量：需要高質(zhì)量的特異性抗體，否則可能得到假陽(yáng)性或假陰性結(jié)果。

2. 非特異性結(jié)合：可能存在非特異性結(jié)合問(wèn)題，需要仔細(xì)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和對(duì)照來(lái)控制。

免疫沉淀純化所得抗原純度低是什么原因？上海RIP免疫沉淀磁珠的選擇

免疫沉淀技術(shù)IP的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。上海RIP免疫沉淀磁珠的選擇

Co-IP（免疫共沉淀）技術(shù)主要用于研究蛋白質(zhì)之間的相互作用，其應(yīng)用場(chǎng)景如下：

1. 蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的鑒定：Co-IP可用于構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)，發(fā)現(xiàn)目標(biāo)蛋白的結(jié)合伙伴。

2. 信號(hào)傳導(dǎo)途徑的研究：通過(guò)Co-IP技術(shù)，科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了許多關(guān)鍵的細(xì)胞信號(hào)通路，如MAPK和PI3K/Akt通路等，為深入理解這些通路的功能和調(diào)控機(jī)制提供了重要線索。

3. 藥物靶點(diǎn)篩選：利用Co-IP技術(shù)，研究人員可以篩選潛在的藥物靶點(diǎn)。

疾病機(jī)制研究：通過(guò)分析疾病相關(guān)蛋白質(zhì)的相互作用，Co-IP有助于揭示疾病的分子機(jī)制。

4. 抗體藥物開發(fā)：Co-IP可用于研究抗體藥物與其靶標(biāo)蛋白的結(jié)合特性，評(píng)估抗體藥物的親和力和特異性。

5. 轉(zhuǎn)錄因子研究：Co-IP技術(shù)可以用于研究轉(zhuǎn)錄因子與蛋白質(zhì)的相互作用，進(jìn)而揭示基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。

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標(biāo)簽：支原體免疫沉淀

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