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深圳anti DYKDDDDK免疫沉淀實驗原理

來源: 發(fā)布時間:2024-06-02

免疫沉淀實驗中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實驗情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結構  (直徑 50-150 μm)  可以結合抗體  (繼而結合靶蛋白) ,它能夠直接高效、快速結合抗體,而不需借助特殊的專業(yè)設備。瓊脂糖珠呈多孔結構,這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質相互接觸,具有更高的結合載量。
與瓊脂糖珠不同,磁珠是固體,抗體的結合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,盡管磁珠沒有多孔中心增加結合能力,但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多,使磁珠擁有足夠的抗體結合表面積滿足高容量的抗體結合。
簡而言之,瓊脂糖珠的結合能力較強,而磁珠在得率,可重復性以及自動化方面有明顯的優(yōu)勢。
免疫沉淀技術IP的實驗方法。深圳anti DYKDDDDK免疫沉淀實驗原理

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RIP 技術的原理(RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay,RNA 結合蛋白免疫沉淀)主要是運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白復合物沉淀下來,經(jīng)過分離純化就可以對結合在復合物上的RNA 進行q-PCR驗證或者測序分析。

RIP 是研究細胞內(nèi)RNA 與蛋白結合情況的技術,是了解轉錄后調控網(wǎng)絡動態(tài)過程的有力工具。RIP可以看成是普遍使用的染色質免疫沉淀ChIP技術的類似應用,但由于研究對象是RNA-蛋白復合物而不是DNA-蛋白復合物,RIP實驗的優(yōu)化條件與ChIP實驗不太相同,如:RIP反應體系中的試劑和抗體不能含有RNA酶,抗體需經(jīng)RIP實驗驗證等等。
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免疫沉淀實驗步驟:
1. 樣品制備
a. 懸浮細胞樣品處理:離心收集細胞(4℃, 1000g, 5 min),用手指把細胞用力彈散。按照6孔板每孔細胞加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制劑的裂解液(裂解液應在使用前數(shù)分鐘內(nèi)加入蛋白酶抑制劑Cocktail,使蛋白酶抑制劑Cocktail的終濃度為1×)?;靹蚝笾糜诒咸幚?0 min;離心收集上清液(4℃, 14000g, 10 min),置于冰上備用(或置于-20℃長期保存)。
b. 貼壁細胞樣品處理:移去培養(yǎng)基,用PBS清洗細胞兩遍;用細胞刮棒刮脫細胞,收集至1.5mL EP管內(nèi),按照6孔板每孔加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制劑的裂解液(裂解液應在使用前數(shù)分鐘內(nèi)加入蛋白酶抑制劑Cocktail,使蛋白酶抑制劑Cocktail的終濃度為1×)。吹打數(shù)下,使裂解液和細胞充分接觸?;靹蚝笾糜诒咸幚?0 min;離心收集上清液(4℃, 14000g, 10 min),置于冰上備用(或置于-20℃長期保存)。
4. 后續(xù):磁珠預處理——抗體吸附——抗原結合反應——抗體洗脫

免疫沉淀純化所得抗原量低有多種原因,
A. 純化所得抗原量低
1. 抗原結合水平低
IP 應用中出現(xiàn)低抗原結合水平的可能原因有很多,結合反應所使用的溶液是重要原因之一。必須使用適合的緩沖液,有特定的pH和鹽濃度,可能還需要添加互作所需的輔助因子。IP 或Co-IP 中用于純化的抗體是影響得率的另一個重要因素。如果抗體本身易失活或與抗原結合微弱,則可能很難找到足夠溫和的條件,即能產(chǎn)生結合,又能保證在孵育和洗滌過程中結合可以穩(wěn)定保持。
2. 抗原洗脫水平低
在某些情況下,抗原與抗體或結合蛋白結合之間可能會發(fā)生極強的相互作用,傳統(tǒng)的洗脫緩沖液無法將其破壞。如果需要使用溫和洗脫緩沖液收集功能性抗原,則上述矛盾尤為突出。

免疫沉淀技術Co-IP的實驗設計。

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染色質免疫共沉淀(Chromatinimmunoprecipitation,ChIP)技術是目前公認的研究此相互作用的選擇,是真核生物基因表達機制研究中不可或缺的技術之一。
它的基本原理是在活細胞狀態(tài)下,固定蛋白質-DNA(染色質)復合物,并將其切斷為一定長度范圍內(nèi)的染色質小片段,然后通過免疫學方法(抗體親和)沉淀此復合體,特異性地富集目的蛋白結合的 DNA,通過對目的片段的純化與后期檢測,從而獲得蛋白質與 DNA 相互作用的信息。
這項技術通過蛋白質與DNA互作來分析目標基因活性以及已知蛋白質的靶基因,被廣泛應用于體內(nèi)轉錄調控因子與靶基因啟動子上特異核苷酸序列結合方面的研究。該技術常與DNA芯片和分子克隆技術相結合。
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免疫沉淀技術ChIP的實驗方法。深圳anti DYKDDDDK免疫沉淀實驗原理

免疫沉淀技術(Immunoprecipitation, IP)是一種利用抗體與特定蛋白質結合的特性,從復雜樣本中分離和純化目標蛋白質的實驗方法。這項技術在生物醫(yī)學研究中有著廣泛的應用場景,以下是一些主要的應用領域:
1. 蛋白質相互作用分析:通過免疫沉淀技術,研究人員可以研究蛋白質之間的相互作用,揭示蛋白質復合物的組成以及它們在細胞內(nèi)的功能和調控機制。
2. 抗體藥物開發(fā):免疫沉淀技術可以用于研究抗體藥物與其靶標蛋白的結合特性,評估抗體藥物的親和力和特異性,指導抗體藥物的設計和優(yōu)化。
3. 蛋白質表達水平分析:通過比較不同條件下的免疫沉淀結果,可以評估目標蛋白的相對量,進而研究蛋白質的表達調控。
4. 染色質免疫沉淀(ChIP):這是一種特殊的免疫沉淀技術,用于研究蛋白質與DNA的相互作用,如轉錄因子或組蛋白修飾與基因組特定區(qū)域的結合情況。
5. RNA免疫沉淀(RIP):類似于ChIP,RIP用于研究RNA結合蛋白與RNA分子之間的相互作用。
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世途科生物簡介:

上海世途科生物科技有限公司是一家集研發(fā)、生產(chǎn)、銷售于一體的,為全球用戶提供生物試劑的生命科學企業(yè)。世途科生物(CYTOCH)匯集了一支由海內(nèi)外KOL組成的研發(fā)團隊,他們在生物和化學領域擁有相當豐富的研發(fā)經(jīng)驗,通過將化學與生物技術相結合,致力于現(xiàn)有技術難點突破、新技術研究,為相關科學研究者提供思路和解決辦法。

憑借著強大的研發(fā)實力和嚴謹?shù)馁|量管理,通過產(chǎn)學研合作,加快客戶科研成果的轉化,不斷推動行業(yè)的發(fā)展。

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