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海洋生物外泌體miRNA芯片

來源: 發(fā)布時間:2023-04-04

被特定部位的細胞獲取的瘤子外泌體可為肉瘤的轉(zhuǎn)移準(zhǔn)備轉(zhuǎn)移前微環(huán)境。用肺轉(zhuǎn)傾向的肉瘤細胞來源的外泌體處理小鼠后可使骨轉(zhuǎn)傾向的肉瘤細胞重新定向。外泌體的蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)不同部位傾向性的肉瘤細胞來源的外泌體具有不同的整合素(integrin)表達譜,整合素α6β4和α6β1與肺轉(zhuǎn)有關(guān),而整合素αvβ5與肝轉(zhuǎn)有關(guān)。敲低整合素α6β4和αvβ5可減少外泌體被靶部位細胞獲取,進而分別降低了肺和肝的轉(zhuǎn)移。進一步研究發(fā)現(xiàn)外泌體整合素被細胞獲取后活躍了Src的磷酸化和促炎的S100基因的表達。通過臨床數(shù)據(jù)分析顯示外泌體整合素可作為預(yù)測肉瘤轉(zhuǎn)移的部位傾向性的診斷指標(biāo)。采用磁珠法時,外泌體生物活性易受PH和鹽濃度影響。海洋生物外泌體miRNA芯片

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流式細胞技術(shù)是細胞和小顆粒定性和定量表征的有效方法,其用于外泌體定量檢測的準(zhǔn)確性也在不斷上升。將外泌體表面特異性標(biāo)志物CD63、CD81等相應(yīng)抗體進行標(biāo)記,可用流式細胞儀檢測到陽性表達,從而實現(xiàn)對外泌體的定量。但流式細胞技術(shù)檢測時需要單顆粒懸浮液,當(dāng)外泌體濃度高或分離過程中發(fā)生外泌體囊泡聚集時將導(dǎo)致一次觀察到多個顆粒,從而導(dǎo)致數(shù)據(jù)不準(zhǔn)確。因此,為了通過流式細胞儀觀察,需要將外泌體通過免疫捕獲或共價結(jié)合固定在磁珠表面上,從而便于將外泌體囊泡暴露于已知或者預(yù)期在外泌體表面表達的抗原的熒光偶聯(lián)抗體中。在流式細胞術(shù)之前,可以在落射熒光顯微鏡(EPI)下觀察與磁珠和熒光抗體偶聯(lián)的外泌體囊泡。當(dāng)樣品通過流式細胞儀時采集熒光信號,不只可以對外泌體進行高通量分析,還可以基于抗原表達對外泌體進行定量或分類。杭州腹膜透析液外泌體外泌體膜蛋白可以被蛋白酶剪切,剪切的碎片可以作為配體與細胞膜上的受體結(jié)合,從而活躍細胞內(nèi)的信號通路。

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超速離心是外泌體提取較常用的方法也被認為是金標(biāo)準(zhǔn),主要是根據(jù)外泌體的沉降系數(shù)、大小和形狀將其分離出來。首先4℃低速離心(300-500g,10min)去除死細胞以及細胞碎片,隨后以較高離心速度(2000xg,10min)去除生物聚合物以及凋亡小體,然后用10000xg,30min離心去除大型囊泡,結(jié)尾以超速離心沉淀外泌體。通過懸浮以及重復(fù)超速離心去除外泌體沉淀中的非外泌體蛋白。超速離心法具有操作簡單、不易被分離試劑污染、獲得的外泌體數(shù)量較多等優(yōu)點。但是此方法需要昂貴的超高速離心機,每次處理的樣本量較小,費時,電鏡鑒定時還發(fā)現(xiàn)外泌體易聚集成塊,且上清中仍能檢測到大型囊泡,純度不高,另外高速離心會損傷外泌體影響下游實驗。外泌體通過內(nèi)體途徑分泌到細胞外空間,并將各種生物活性分子(貨物)轉(zhuǎn)運至靶細胞。

質(zhì)膜的連續(xù)內(nèi)陷較終導(dǎo)致多泡體的形成,多泡體可與細胞內(nèi)的其他囊泡和細胞器交叉,從而增加了外泌體成分的多樣性。根據(jù)細胞來源的不同,細胞外囊泡,包括外泌體,可以包含細胞的許多成分,包括DNA、RNA、脂質(zhì)、代謝物、胞質(zhì)和細胞表面蛋白。目前產(chǎn)生外泌體的生理目的尚不清楚,需要進一步研究。一個推測的作用是外泌體可能從細胞中去除多余和/或不必要的成分以維持細胞內(nèi)環(huán)境的穩(wěn)定。較近的研究也表明外泌體中特定細胞成分的功能、靶向、機制驅(qū)動的積累,提示它們在調(diào)節(jié)細胞間通訊中發(fā)揮作用。外泌體是指包含了復(fù)雜RNA和蛋白質(zhì)的小膜泡(30-150nm)。

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近年來,外泌體的捕獲技術(shù)越來越多,微流體系也被用于外泌體提取,此方法能根據(jù)其物理和生化特性同時分離外泌體。采用這種方法獲得的樣品純度高,且可及時獲取外泌體用于疾病的相關(guān)檢測。在初次注射時外泌體粘附在微流控設(shè)備的內(nèi)表面,并在隨后的PBS注射中沖洗掉。此方法采用的設(shè)備復(fù)雜,所需的樣本量取決于流動通道的長度。另外,樣品量的注入速率比較低,因此,對于大樣品量,將需要較長的處理時間。外泌體在包括瘤子在內(nèi)的各種疾病的發(fā)病機理中具有重要的功能。目前,研究人員已經(jīng)開發(fā)了多種方法來分離外泌體,離心技術(shù)仍然是常用方法,其他方法,例如過濾、磁珠分離和色譜法等,也顯示出獨特的優(yōu)勢,但目前仍然沒有一種公認有效的提取方法,研究人員應(yīng)針對不同來源的樣本以及不同的下游分析選取較適宜的提取方案。外泌體屬于胞外囊泡類,除了外泌體之外細胞還分泌微泡以及其它的膜囊泡。pkh67

對外泌體的分析和檢測可以輔助疾病的早期診斷、療效評價和預(yù)后分析。海洋生物外泌體miRNA芯片

密度梯度離心法根據(jù)在蔗糖、碘海醇或碘克沙醇等惰性溶液中的浮力密度將外泌體分成特定的層,目前普遍應(yīng)用的是蔗糖,這種方法可以成功地將亞細胞成分(例如過氧化物酶體,線粒體和核內(nèi)體)分離到密度梯度溶液中的不同層中。樣品被放置在梯度的頂部,當(dāng)施加離心力時,樣品中的顆粒以獨特的速率通過梯度,該梯度以從上到下的密度增加。樣品中的外泌體將在1.13-1.19g/ml的密度范圍富集,隨后可以通過分餾收集,密度梯度超速離心對從蛋白質(zhì)聚集體和非膜顆粒中分離出外泌體非常有效。此方法獲得的外泌體純度較高,但步驟繁瑣、費時且會造成外泌體損失。海洋生物外泌體miRNA芯片

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