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北京外泌體lncRNA測序

來源: 發(fā)布時間:2023-03-24

全轉(zhuǎn)錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA,主要為mRNA和lncRNA、circRNA等非編碼RNA。外泌體中攜帶有來自母本細胞的多種蛋白質(zhì)、脂類、短鏈RNA和長鏈RNA等重要信息。對外泌體中的長鏈RNA進行全轉(zhuǎn)錄組測序及分析,不只能夠篩選外泌體攜帶的特異Biomarker,同時對深入了解疾病或不同發(fā)育階段的內(nèi)在機制也有重要意義。外泌體全轉(zhuǎn)錄組測序體系,充分結(jié)合了微量核酸建庫技術(shù)、NGS技術(shù)和全新的生物信息序列比對算法,可實現(xiàn)對1mL血漿中的外泌體即可進行mRNA、lncRNA和circRNA等RNAs充分測序,獲取周全的外泌體轉(zhuǎn)錄組信息。外泌體鑒定方法從物理特征到表面分子標志物,多角度進行鑒定。北京外泌體lncRNA測序

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外泌體的來源與特征:外泌體是一種存在于細胞外的多囊泡體,通過細胞內(nèi)吞泡膜向內(nèi)凹陷形成,其大小均一,直徑為40-100nm,密度為1.10-1.18g/mL。外泌體可由間充質(zhì)干細胞、淋巴細胞和肉瘤細胞等多種類型細胞主動分泌釋放。外泌體內(nèi)主要含有核酸、蛋白質(zhì)和脂質(zhì)等,可作為疾病診斷標記物、調(diào)控靶細胞功能、參與細胞生物學活動等。例如:含有miR-140-5p的滑膜間充質(zhì)干細胞來源外泌體(SMSC-Exo影響軟骨組織再生;骨髓間充質(zhì)干細胞來源外泌體攜帶的miR-196a可調(diào)節(jié)成骨細胞分化促進大鼠顱骨缺損的骨再生。江蘇外泌體PKH26外泌體可以作為“天然的納米粒子”來進行藥物遞送。

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外泌體提取在短時間(一周之內(nèi))使用,可以放在4度保存,如果長時間保存可以放在-20度或-80度保存。也可以將外泌體進行分裝,分別放在-20度或-80度。外泌體檢測方法:外泌體分離之后,需要經(jīng)過一系列鑒定才能確定分離的是外泌體。鑒定方法從物理特征到表面分子標志物,多角度進行鑒定。l、透射電鏡鑒定法:簡稱TEM,適合外泌體雙層囊膜超微結(jié)構(gòu)觀察,即通常為茶托型或一側(cè)凹陷的半球形。2、納米顆粒追蹤分析法:簡稱NTA,該方法能保證外泌體原始狀態(tài)、檢測速度快,檢測后能提供外泌體粒徑和濃度信息。

細胞外小泡通過充當脂肪組織、肝臟、骨骼肌和免疫細胞之間的細胞間通訊方式,在肥胖及其代謝并發(fā)癥的發(fā)展中發(fā)揮作用。外泌體可能在外周胰島素敏感性的調(diào)節(jié)中起作用,外周胰島素敏感性是T2D發(fā)病機理的主要組成部分。外泌體似乎通過至少兩種不同的機制來調(diào)節(jié)胰島素敏感性,即通過調(diào)節(jié)炎癥或通過與胰島素反應性部位的直接相互作用。后者可通過與主要胰島素信號分子(例如磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/Akt信號通路)相互作用而影響胰島素信號通路而直接或間接發(fā)生。與對照組相比,糖尿病患者的血漿EV含量更高,并且與對照組相比,糖尿病小鼠的血漿外泌體數(shù)量也更高。然而,確定外泌體的作用及其在肝/腸軸通訊中的潛在作用將需要對它們的組成有更好的了解,特別是飲食是否會改變腸源性外泌體的含量,因此就胰島素反應而言它們的生物學功能尚未研究。外泌體是一種存在于細胞外的多囊泡體,通過細胞內(nèi)吞泡膜向內(nèi)凹陷形成。

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細胞外囊泡是蛋白質(zhì)、mRNA、miRNA和脂質(zhì)運輸來完成細胞間通訊通路的重要媒介,根據(jù)它們的大小和發(fā)生分為三類,包括外泌體、微泡和凋亡小體。其中,外泌體是直徑大約為40-100nm的包裝囊泡,由多種細胞分泌,內(nèi)含有特定的蛋白質(zhì)、脂質(zhì)、細胞因子或遺傳物質(zhì)。來源于不同的組織的外泌體不只具有其特異性蛋白分子,而且還包含其行使功能的關(guān)鍵分子。近年來,隨著外泌體研究的不斷深入,它的應用已經(jīng)涉及瘤子診療領(lǐng)域、醫(yī)學基礎(chǔ)和免疫領(lǐng)域、寄生蟲領(lǐng)域;臨床研究上已涉及心血管系統(tǒng)、內(nèi)分泌代謝系統(tǒng)等。超速離心是目前分離外泌體的主要技術(shù)。外泌體中含有核酸,包括miRNA、DNA、lncRNA、mRNA。海洋生物外泌體PKH26

干細胞外泌體攝取流式細胞技術(shù)是細胞和小顆粒定性和定量表征的有效方法。北京外泌體lncRNA測序

外泌體的納米球膜型結(jié)構(gòu)由雙層脂質(zhì)形成。它也由各種類型的脂質(zhì)和蛋白質(zhì)組成,這些脂質(zhì)和蛋白質(zhì)衍生自形成外泌體的親代細胞。根據(jù)外泌體數(shù)據(jù)庫ExoCarta的資料,目前已知約有8000種蛋白質(zhì)和194種脂質(zhì)與外泌體相關(guān)。外泌體通過生物體液被多種不同類型的細胞分泌,包括滑膜液,母乳,血液,尿液,唾液,羊水和血液中的血清,這表明它們在細胞間通訊和觸發(fā)生理反應中起著重要的作用。外泌體功能在研究初期階段發(fā)現(xiàn)是參與細胞成熟過程中去除不必要的蛋白質(zhì)。簡而言之,它們是天然膜囊泡,將蛋白質(zhì),RNA,DNA和脂質(zhì)從一個細胞攜帶到另一個細胞,從而調(diào)節(jié)受體細胞的生物功能。北京外泌體lncRNA測序

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