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河南外泌體circRNA測(cè)序

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-03-01

外泌體是包含了復(fù)雜RNA和蛋白質(zhì)的小膜泡(30–150nm),由所有體外和體內(nèi)細(xì)胞持續(xù)分泌。由于人體內(nèi)復(fù)雜的功能,包括細(xì)胞間通訊和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),外泌體正在改變研究。這些細(xì)胞外囊泡正在生長(zhǎng),這既是為了了解其生物學(xué)功能,也是為了將其用于實(shí)際應(yīng)用,如無(wú)創(chuàng)診斷和高級(jí)調(diào)理開發(fā)。Dynabeads提供一系列外泌體分離產(chǎn)品和工具,用于表征和分析其RNA和蛋白質(zhì)含量,以及體外和體內(nèi)追蹤,以幫助您進(jìn)一步了解這些迷人的外泌體。超速離心方案可能冗長(zhǎng)乏味且耗時(shí)的。您可使用靈活且可擴(kuò)展的總外泌體分離試劑從細(xì)胞培養(yǎng)基或任何體液中即刻分離完整的外泌體。這些試劑及其隨附的方案是多種試驗(yàn)的理想選擇,包括處理少量樣本和處理多個(gè)樣本。外泌體是具有生物活性的脂雙層囊泡。河南外泌體circRNA測(cè)序

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近年來(lái),外泌體的捕獲技術(shù)越來(lái)越多,微流體系也被用于外泌體提取,此方法能根據(jù)其物理和生化特性同時(shí)分離外泌體。采用這種方法獲得的樣品純度高,且可及時(shí)獲取外泌體用于疾病的相關(guān)檢測(cè)。在初次注射時(shí)外泌體粘附在微流控設(shè)備的內(nèi)表面,并在隨后的PBS注射中沖洗掉。此方法采用的設(shè)備復(fù)雜,所需的樣本量取決于流動(dòng)通道的長(zhǎng)度。另外,樣品量的注入速率比較低,因此,對(duì)于大樣品量,將需要較長(zhǎng)的處理時(shí)間。外泌體在包括瘤子在內(nèi)的各種疾病的發(fā)病機(jī)理中具有重要的功能。目前,研究人員已開發(fā)了多種方法來(lái)分離外泌體,離心技術(shù)仍然是常用方法,其他方法,例如過(guò)濾、磁珠分離和色譜法等,也顯示出獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),但目前仍然沒(méi)有一種公認(rèn)有效的提取方法,研究人員應(yīng)針對(duì)不同來(lái)源的樣本以及不同的下游分析選取較適宜的提取方案。江西外泌體lncRNA測(cè)序選擇的分離方式是利用超速離心的方式分離外泌體,并且可以選用梯度密度離心法得到純度更高的外泌體。

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外泌體研究背景:胞外囊泡是從細(xì)胞膜上脫落或者由細(xì)胞分泌的具有雙層膜結(jié)構(gòu)的囊泡狀小體,主要由微囊泡、凋亡小體、外泌體組成。而外泌體是其中一類小囊泡,直徑為30~150nm,密度1.10~1.18g/ml,可攜帶核酸、蛋白質(zhì)質(zhì)和脂質(zhì)等,存在于血液、唾液、尿液等多種體液中。越來(lái)越多的研究證實(shí),外泌體可以通過(guò)細(xì)胞間轉(zhuǎn)移核酸、蛋白質(zhì)、脂質(zhì)等特定物質(zhì),發(fā)揮特殊的功能。如在抗原提呈細(xì)胞中呈遞抗原程中、肉瘤細(xì)胞發(fā)生了發(fā)展、神經(jīng)細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程中都發(fā)揮著重要作用。對(duì)外泌體的分析和檢測(cè)可以輔助疾病的早期診斷、療效評(píng)價(jià)和預(yù)后分析。

血漿中的外泌體蛋白既可以當(dāng)作標(biāo)志物,也可以進(jìn)行機(jī)理研究?首先,研究人員將慢性淋巴瘤(CLL)患者分為2個(gè)亞組:疾病進(jìn)展期和疾病慢性期。然后利用質(zhì)譜技術(shù)分析了患者血漿外泌體蛋白組,發(fā)現(xiàn)S100-A9蛋白在進(jìn)展期CLL患者中明顯高表達(dá),可以作為CLL進(jìn)展期診斷的輔助標(biāo)志物。進(jìn)一步,研究人員通過(guò)生信分析發(fā)現(xiàn)進(jìn)展期CLL患者外泌體中的高表達(dá)蛋白質(zhì)主要與炎癥和氧化應(yīng)激有關(guān),而NF-κB通路正是承接此效應(yīng)的關(guān)鍵通路。通過(guò)從進(jìn)展期CLL患者中分離富含S100-A9蛋白的外泌體加入CLL患者的PBMC細(xì)胞中,證實(shí)了S100-A9+外泌體能夠明顯促進(jìn)進(jìn)展期CLL患者PBMC細(xì)胞中IκBα蛋白的磷酸化上調(diào),進(jìn)一步活躍NF-κB通路。該研究證通過(guò)血漿外泌體蛋白組分析不只找到輔助診斷進(jìn)展期CLL的標(biāo)志物,并證實(shí)了S100-A9+外泌體可通過(guò)形成正向反饋調(diào)控,不斷活躍進(jìn)展期CLL患者自身PBMC細(xì)胞中的NF-κB通路,促進(jìn)CLL進(jìn)展的特殊機(jī)理。度梯度離心法,用此種方法分離到的外泌體純度高。

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外泌體的相關(guān)成分:1、外泌體的膜同細(xì)胞一樣,是磷脂雙分子層。2、外泌體膜含有MHC-1/2蛋白,能綁定特異性的肽鏈。3、外泌體膜中有跨膜蛋白PGRL、LAMP1、LAMP2。4、外泌體膜中有膜轉(zhuǎn)運(yùn)融合蛋白annexins、RAN、GTPases。5、外泌體膜上有脂質(zhì)筏Chol、ceramide、SM、PC,限制膜流動(dòng),參與包括跨膜信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、物質(zhì)內(nèi)吞、脂質(zhì)及蛋白定向分選的多種功能。6、外泌體中含有核酸,包括miRNA、DNA、lncRNA、mRNA;同時(shí)還有一些蛋白、脂類也能被包裹到外泌體中。7、與外泌體產(chǎn)生相關(guān)的重要分子:Ral、ARF6、PLD2、RAB家族。8、一些物質(zhì)進(jìn)行外泌體中是特異性的:如hnRNPA2B1能結(jié)合lncRNA或miRNA特異性的序列(GGAG/CCCU),進(jìn)行主動(dòng)包埋。外泌體的膜同細(xì)胞一樣,是磷脂雙分子層。超速離心是目前分離外泌體的主要技術(shù)。血液中外泌體提取

外泌體的膜蛋白有可能與細(xì)胞膜蛋白作用,活躍細(xì)胞內(nèi)通路。河南外泌體circRNA測(cè)序

外泌體的納米球膜型結(jié)構(gòu)由雙層脂質(zhì)形成。它也由各種類型的脂質(zhì)和蛋白質(zhì)組成,這些脂質(zhì)和蛋白質(zhì)衍生自形成外泌體的親代細(xì)胞。根據(jù)外泌體數(shù)據(jù)庫(kù)ExoCarta的資料,目前已知約有8000種蛋白質(zhì)和194種脂質(zhì)與外泌體相關(guān)。外泌體通過(guò)生物體液被多種不同類型的細(xì)胞分泌,包括滑膜液,母乳,血液,尿液,唾液,羊水和血液中的血清,這表明它們?cè)诩?xì)胞間通訊和觸發(fā)生理反應(yīng)中起著重要的作用。外泌體功能在研究初期階段發(fā)現(xiàn)是參與細(xì)胞成熟過(guò)程中去除不必要的蛋白質(zhì)。簡(jiǎn)而言之,它們是天然膜囊泡,將蛋白質(zhì),RNA,DNA和脂質(zhì)從一個(gè)細(xì)胞攜帶到另一個(gè)細(xì)胞,調(diào)節(jié)受體細(xì)胞的生物功能。河南外泌體circRNA測(cè)序

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